बायोजेएस: Difference between revisions

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'''बायोजेएस''' वेब पर जैव सूचना विज्ञान डेटा के लिए संवृत-स्रोत परियोजना है।<ref name="CorpasJimenez2014">{{Cite journal |last=Corpas |authorlink1 = Manuel Corpas (Scientist)|last2=Jimenez |first2=Rafael |last3=Carbon |first3=Seth J |last4=García |first4=Alex |last5=Garcia |first5=Leyla |last6=Goldberg |first6=Tatyana |last7=Gomez |first7=John |last8=Kalderimis |first8=Alexis |last9=Lewis |first9=Suzanna E |year=2014 |title=BioJS: an open source standard for biological visualisation – its status in 2014 |journal=F1000Research | pmid=25075290 | doi=10.12688/f1000research.3-55.v1 |issn=2046-1402 |last10=Mulvany |first10=Ian |last11=Pawlik |first11=Aleksandra |last12=Rowland |first12=Francis |last13=Salazar |first13=Gustavo |last14=Schreiber |first14=Fabian |last15=Sillitoe |first15=Ian |last16=Spooner |first16=William H |last17=Thanki |first17=Anil |last18=Villaveces |first18=José M |last19=Yachdav |first19=Guy |last20=Hermjakob |first20=Henning|pmc=4103492 }}</ref> इसका लक्ष्य जैविक डेटा की कल्पना करने के लिए [[जावास्क्रिप्ट]] घटकों की संवृत-स्रोत लाइब्रेरी विकसित करना है।<ref name="BioJS_Mission">{{Cite web |url=http://biojs.net/our_mission.html |title=बायोजेएस विजन और मिशन|publisher=BioJS |archive-url=https://web.archive.org/web/20140810063209/http://biojs.net/our_mission.html |archive-date=10 August 2014 |url-status=dead |access-date=29 August 2014}}</ref> बायोजेएस छोटे बिल्डिंग ब्लॉक्स (घटकों) का विकास और सुरक्षा करता है जिनका दूसरों द्वारा पुन: उपयोग किया जा सकता है। उपलब्ध घटकों की शोध के लिए, बायोजेएस {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20180313202921/http://biojs.net/#/components |date=2018-03-13 }} को संग्रहीत [https://biojs.net/#/components रजिस्ट्री] बनाए रखता है। .


==इतिहास==
==इतिहास==


BioJS का पहला संस्करण 2012 में जॉन गोमेज़ द्वारा जारी किया गया था। इसे वेब अनुप्रयोगों में जैविक डेटा का प्रतिनिधित्व करने के लिए वेब घटकों की जावास्क्रिप्ट लाइब्रेरी के रूप में विकसित किया गया था। संस्करण 2.0 में लाइब्रेरी का पूरा नया डिज़ाइन शामिल था और इसे 2014 में [[मैनुअल कॉर्पस (वैज्ञानिक)]] के नेतृत्व में Google समर ऑफ़ कोड प्रोजेक्ट के रूप में जारी किया गया था और डेविड डाओ और सेबेस्टियन विल्ज़बैक द्वारा विकसित किया गया था। तब से 100 से अधिक लोगों ने इस परियोजना में योगदान दिया। वर्तमान में BioJS रजिस्ट्री में 150 से अधिक घटक उपलब्ध हैं।
बायोजेएस का प्रथम संस्करण 2012 में जॉन गोमेज़ द्वारा प्रस्तावित किया गया था। इसे वेब अनुप्रयोगों में जैविक डेटा का प्रतिनिधित्व करने के लिए वेब घटकों की जावास्क्रिप्ट लाइब्रेरी के रूप में विकसित किया गया था। संस्करण 2.0 में लाइब्रेरी का पूर्ण नया डिज़ाइन सम्मिलित था और इसे 2014 में [[मैनुअल कॉर्पस (वैज्ञानिक)]] के नेतृत्व में गूगल समर ऑफ़ कोड परियोजना के रूप में प्रस्तावित किया गया था और डेविड डाओ और सेबेस्टियन विल्ज़बैक द्वारा विकसित किया गया था। तब से 100 से अधिक लोगों ने इस परियोजना में योगदान दिया। वर्तमान में बायोजेएस रजिस्ट्री में 150 से अधिक घटक उपलब्ध हैं।


==प्रकाशित घटकों की चयनित सूची==
==प्रकाशित घटकों की चयनित सूची==


* डीएजी व्यूअर<ref>{{cite journal|last1=Kalderimis|first1=Alexis|last2=Stepan|first2=Radek|last3=Sullivan|first3=Julie|last4=Lyne|first4=Rachel|last5=Lyne|first5=Michael|last6=Micklem|first6=Gos|title=BioJS DAGViewer: A reusable JavaScript component for displaying directed graphs|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=24627804 | doi=10.12688/f1000research.3-51.v1|pmc=3945768}}</ref>
* डीएजी दर्शक<ref>{{cite journal|last1=Kalderimis|first1=Alexis|last2=Stepan|first2=Radek|last3=Sullivan|first3=Julie|last4=Lyne|first4=Rachel|last5=Lyne|first5=Michael|last6=Micklem|first6=Gos|title=BioJS DAGViewer: A reusable JavaScript component for displaying directed graphs|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=24627804 | doi=10.12688/f1000research.3-51.v1|pmc=3945768}}</ref>
* डीएनए सामग्री दर्शक<ref name="ThankiCaim2014">{{cite journal|last1=Thanki|first1=Anil S.|last2=Caim|first2=Shabhonam|last3=Corpas|first3=Manuel|authorlink3 = Manuel Corpas (Scientist)|last4=Davey|first4=Robert P.|title=DNAContentViewer a BioJS component to visualise GC/AT Content|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|doi=10.12688/f1000research.3-54.v1|doi-access=free}}</ref>
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* फ़ीचर व्यूअर<ref name="GarciaYachdav2014">{{cite journal|last1=Garcia|first1=Leyla|last2=Yachdav|first2=Guy|last3=Martin|first3=Maria-Jesus|title=फ़ीचरव्यूअर, प्रोटीन अनुक्रमों में स्थिति-आधारित एनोटेशन के विज़ुअलाइज़ेशन के लिए एक बायोजेएस घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=24741440 |doi=10.12688/f1000research.3-47.v2| pmc=3983936 |doi-access=free}}</ref>
* फ़ीचर दर्शक<ref name="GarciaYachdav2014">{{cite journal|last1=Garcia|first1=Leyla|last2=Yachdav|first2=Guy|last3=Martin|first3=Maria-Jesus|title=फ़ीचरव्यूअर, प्रोटीन अनुक्रमों में स्थिति-आधारित एनोटेशन के विज़ुअलाइज़ेशन के लिए एक बायोजेएस घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=24741440 |doi=10.12688/f1000research.3-47.v2| pmc=3983936 |doi-access=free}}</ref>
* हीटमैपव्यूअर<ref name="YachdavHecht2014">{{cite journal|last1=Yachdav|first1=Guy|last2=Hecht|first2=Maximilian|last3=Pasmanik-Chor|first3=Metsada|last4=Yeheskel|first4=Adva|last5=Rost|first5=Burkhard|title=HeatMapViewer: interactive display of 2D data in biology|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402| pmid=24860644|doi=10.12688/f1000research.3-48.v1 | pmc=4023661|doi-access=free}}</ref>
* हीटमैपदर्शक<ref name="YachdavHecht2014">{{cite journal|last1=Yachdav|first1=Guy|last2=Hecht|first2=Maximilian|last3=Pasmanik-Chor|first3=Metsada|last4=Yeheskel|first4=Adva|last5=Rost|first5=Burkhard|title=HeatMapViewer: interactive display of 2D data in biology|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402| pmid=24860644|doi=10.12688/f1000research.3-48.v1 | pmc=4023661|doi-access=free}}</ref>
* अंतःविषय विश्लेषण<ref>{{cite journal|last1=Kalderimis|first1=Alexis|last2=Stepan|first2=Radek|last3=Sullivan|first3=Julie|last4=Lyne|first4=Rachel|last5=Lyne|first5=Michael|last6=Micklem|first6=Gos|title=BioJS InterMine List Analysis: A BioJS component for displaying graphical or statistical analysis of collections of items from InterMine endpoints|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|doi=10.12688/f1000research.3-45.v1|doi-access=free}}</ref>
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* अंतबिंदुओं को अंतःस्थापित करें<ref>{{cite journal|last1=Kalderimis|first1=Alexis|last2=Stepan|first2=Radek|last3=Sullivan|first3=Julie|last4=Lyne|first4=Rachel|last5=Lyne|first5=Michael|last6=Micklem|first6=Gos|title=BioJS InterMineTable Component: A BioJS component for displaying data from InterMine compatible webservice endpoints|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|doi=10.12688/f1000research.3-46.v1|doi-access=free}}</ref>
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* केजीव्यूअर<ref>{{cite journal|last1=Villaveces|first1=Jose M.|last2=Jimenez|first2=Rafael C.|last3=Habermann|first3=Bianca H.|title=KEGGViewer, KEGG पाथवेज़ को देखने के लिए एक BioJS घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=24715980| doi=10.12688/f1000research.3-43.v1|pmc=3954160 |doi-access=free}}</ref>
* केइजीजीदर्शक<ref>{{cite journal|last1=Villaveces|first1=Jose M.|last2=Jimenez|first2=Rafael C.|last3=Habermann|first3=Bianca H.|title=KEGGViewer, KEGG पाथवेज़ को देखने के लिए एक BioJS घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=24715980| doi=10.12688/f1000research.3-43.v1|pmc=3954160 |doi-access=free}}</ref>
* पीपीआई-इंटरैक्शन<ref name="SalazarMeintjes2014">{{cite journal|last1=Salazar|first1=Gustavo A.|last2=Meintjes|first2=Ayton|last3=Mulder|first3=Nicola|title=PPI layouts: BioJS components for the display of Protein-Protein Interactions|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=25075288 |doi=10.12688/f1000research.3-50.v1 | pmc=4103490 |doi-access=free}}</ref>
* पीपीआई-इंटरैक्शन<ref name="SalazarMeintjes2014">{{cite journal|last1=Salazar|first1=Gustavo A.|last2=Meintjes|first2=Ayton|last3=Mulder|first3=Nicola|title=PPI layouts: BioJS components for the display of Protein-Protein Interactions|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=25075288 |doi=10.12688/f1000research.3-50.v1 | pmc=4103490 |doi-access=free}}</ref>
* PsicquicGraph<ref>{{cite journal|last1=Villaveces|first1=Jose M.|last2=Jimenez|first2=Rafael C.|last3=Habermann|first3=Bianca H.|title=PsicquicGraph, PSICQUIC सर्वर से आणविक अंतःक्रियाओं को देखने के लिए एक BioJS घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=25075287 |  doi=10.12688/f1000research.3-44.v1|pmc=4097353|doi-access=free}}</ref>
* साइक्विक ग्राफ़<ref>{{cite journal|last1=Villaveces|first1=Jose M.|last2=Jimenez|first2=Rafael C.|last3=Habermann|first3=Bianca H.|title=PsicquicGraph, PSICQUIC सर्वर से आणविक अंतःक्रियाओं को देखने के लिए एक BioJS घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=25075287 |  doi=10.12688/f1000research.3-44.v1|pmc=4097353|doi-access=free}}</ref>
* अनुक्रम<ref name="GomezJimenez2014">{{cite journal|last1=Gomez|first1=John|last2=Jimenez|first2=Rafael|title=अनुक्रम, अनुक्रमों को देखने के लिए एक बायोजेएस घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|pmid=25075289| doi=10.12688/f1000research.3-52.v1| pmc=4103491|doi-access=free}}</ref>
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* विगएक्सप्लोरर<ref name="ThankiJimenez2014">{{cite journal|last1=Thanki|first1=Anil S.|last2=Jimenez|first2=Rafael C.|last3=Kaithakottil|first3=Gemy G.|last4=Corpas|first4=Manuel|authorlink4 = Manuel Corpas (Scientist)|last5=Davey|first5=Robert P.|title=विगएक्सप्लोरर, विग डेटा को विज़ुअलाइज़ करने के लिए एक बायोजेएस घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|doi=10.12688/f1000research.3-53.v2|doi-access=free}}</ref>
* विग्सप्लोरर<ref name="ThankiJimenez2014">{{cite journal|last1=Thanki|first1=Anil S.|last2=Jimenez|first2=Rafael C.|last3=Kaithakottil|first3=Gemy G.|last4=Corpas|first4=Manuel|authorlink4 = Manuel Corpas (Scientist)|last5=Davey|first5=Robert P.|title=विगएक्सप्लोरर, विग डेटा को विज़ुअलाइज़ करने के लिए एक बायोजेएस घटक|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|doi=10.12688/f1000research.3-53.v2|doi-access=free}}</ref>
* ट्रीविजेट<ref name="Schreiber2014">{{cite journal|last1=Schreiber|first1=Fabian|title=treeWidget: a BioJS component to visualise phylogenetic trees|journal=F1000Research|year=2014|issn=2046-1402|doi=10.12688/f1000research.3-49.v1|doi-access=free}}</ref>
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== बायोजेएस का उपयोग करने वाले संस्थान ==
== बायोजेएस का उपयोग करने वाले संस्थान ==
* [[यूरोपीय जैव सूचना विज्ञान संस्थान]]
* [[यूरोपीय जैव सूचना विज्ञान संस्थान]]
* [[ईलाइफ]]
* [[ईलाइफ]]
* [[इंटरमाइन]]
* [[इंटरमाइन]]
* [[लॉरेंस बर्कले राष्ट्रीय प्रयोगशाला]]
* [[लॉरेंस बर्कले राष्ट्रीय प्रयोगशाला]]
* खुले तथ्य
* संवृत तथ्य
* [http://www.rostlab.org/ रोस्टलैब]
* [http://www.rostlab.org/ रोस्टलैब]
* [[जीनोम विश्लेषण केंद्र]]
* [[जीनोम विश्लेषण केंद्र]]
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Latest revision as of 12:13, 1 November 2023

बायोजेएस
Initial release2012
Written inJavaScript
TypeBioinformatics
LicenseApache 2
Websitebiojs.net

बायोजेएस वेब पर जैव सूचना विज्ञान डेटा के लिए संवृत-स्रोत परियोजना है।[1] इसका लक्ष्य जैविक डेटा की कल्पना करने के लिए जावास्क्रिप्ट घटकों की संवृत-स्रोत लाइब्रेरी विकसित करना है।[2] बायोजेएस छोटे बिल्डिंग ब्लॉक्स (घटकों) का विकास और सुरक्षा करता है जिनका दूसरों द्वारा पुन: उपयोग किया जा सकता है। उपलब्ध घटकों की शोध के लिए, बायोजेएस Archived 2018-03-13 at the Wayback Machine को संग्रहीत रजिस्ट्री बनाए रखता है। .

इतिहास

बायोजेएस का प्रथम संस्करण 2012 में जॉन गोमेज़ द्वारा प्रस्तावित किया गया था। इसे वेब अनुप्रयोगों में जैविक डेटा का प्रतिनिधित्व करने के लिए वेब घटकों की जावास्क्रिप्ट लाइब्रेरी के रूप में विकसित किया गया था। संस्करण 2.0 में लाइब्रेरी का पूर्ण नया डिज़ाइन सम्मिलित था और इसे 2014 में मैनुअल कॉर्पस (वैज्ञानिक) के नेतृत्व में गूगल समर ऑफ़ कोड परियोजना के रूप में प्रस्तावित किया गया था और डेविड डाओ और सेबेस्टियन विल्ज़बैक द्वारा विकसित किया गया था। तब से 100 से अधिक लोगों ने इस परियोजना में योगदान दिया। वर्तमान में बायोजेएस रजिस्ट्री में 150 से अधिक घटक उपलब्ध हैं।

प्रकाशित घटकों की चयनित सूची

  • डीएजी दर्शक[3]
  • डीएनए सामग्री दर्शक[4]
  • फ़ीचर दर्शक[5]
  • हीटमैपदर्शक[6]
  • इंटरमाइन विश्लेषण[7]
  • अंतबिंदुओं को अंतःस्थापित करें[8]
  • केइजीजीदर्शक[9]
  • पीपीआई-इंटरैक्शन[10]
  • साइक्विक ग्राफ़[11]
  • अनुक्रम[12]
  • विग्सप्लोरर[13]
  • ट्रीविजेट[14]

बायोजेएस का उपयोग करने वाले संस्थान

यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Corpas; Jimenez, Rafael; Carbon, Seth J; García, Alex; Garcia, Leyla; Goldberg, Tatyana; Gomez, John; Kalderimis, Alexis; Lewis, Suzanna E; Mulvany, Ian; Pawlik, Aleksandra; Rowland, Francis; Salazar, Gustavo; Schreiber, Fabian; Sillitoe, Ian; Spooner, William H; Thanki, Anil; Villaveces, José M; Yachdav, Guy; Hermjakob, Henning (2014). "BioJS: an open source standard for biological visualisation – its status in 2014". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-55.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4103492. PMID 25075290.
  2. ↑ "बायोजेएस विजन और मिशन". BioJS. Archived from the original on 10 August 2014. Retrieved 29 August 2014.
  3. ↑ Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS DAGViewer: A reusable JavaScript component for displaying directed graphs". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-51.v1. ISSN 2046-1402. PMC 3945768. PMID 24627804.
  4. ↑ Thanki, Anil S.; Caim, Shabhonam; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "DNAContentViewer a BioJS component to visualise GC/AT Content". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-54.v1. ISSN 2046-1402.
  5. ↑ Garcia, Leyla; Yachdav, Guy; Martin, Maria-Jesus (2014). "फ़ीचरव्यूअर, प्रोटीन अनुक्रमों में स्थिति-आधारित एनोटेशन के विज़ुअलाइज़ेशन के लिए एक बायोजेएस घटक". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-47.v2. ISSN 2046-1402. PMC 3983936. PMID 24741440.
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बाहरी संबंध

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