एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए: Difference between revisions

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{{Short description|DNA located outside the chromosomes of a cell, and found for example in organelles or plasmids}}
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'''एक्स्ट्राक्रोमोसोमल''' '''डीएनए''' (संक्षेप में ईसीडीएनए) कोई भी डीएनए है जो किसी कोशिका के केंद्रक के अंदर या बाहर गुणसूत्रों से पाया जाता है। एक व्यक्तिगत जीनोम में अधिकांश डीएनए नाभिक में मौजूद गुणसूत्रों में पाया जाता है। एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के कई रूप मौजूद हैं, और, इनमें से कुछ महत्वपूर्ण जैविक कार्य करते हैं,<ref name="Rush" /> वे कैंसर जैसी बीमारियों में भी भूमिका निभा सकते हैं।<ref name=":1">{{cite journal | vauthors = Verhaak RG, Bafna V, Mischel PS | title = ट्यूमर रोगजनन और विकास में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल ऑन्कोजीन प्रवर्धन| journal = Nature Reviews. Cancer | volume = 19 | issue = 5 | pages = 283–288 | date = May 2019 | pmid = 30872802 | doi = 10.1038/s41568-019-0128-6 | pmc = 7168519 }}</ref><ref name=":0">{{cite journal | vauthors = Turner KM, Deshpande V, Beyter D, Koga T, Rusert J, Lee C, Li B, Arden K, Ren B, Nathanson DA, Kornblum HI, Taylor MD, Kaushal S, Cavenee WK, Wechsler-Reya R, Furnari FB, Vandenberg SR, Rao PN, Wahl GM, Bafna V, Mischel PS | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल ऑन्कोजीन प्रवर्धन ट्यूमर के विकास और आनुवंशिक विषमता को संचालित करता है| journal = Nature | volume = 543 | issue = 7643 | pages = 122–125 | date = March 2017 | pmid = 28178237 | pmc = 5334176 | doi = 10.1038/nature21356 | bibcode = 2017Natur.543..122T }}</ref><ref name=":3">{{Cite web|title=क्रोमोसोम के बाहर डीएनए द्वारा कैंसर को प्रेरित किया जा सकता है|url=https://www.the-scientist.com/features/cancer-may-be-driven-by-dna-outside-of-chromosomes-68590|access-date=2021-10-05|website=The Scientist Magazine®|language=en}}</ref>
'''एक्स्ट्राक्रोमोसोमल''' '''डीएनए''' (संक्षेप में ecDNA) कोई भी डीएनए है जो किसी कोशिका के केंद्रक के अंदर या बाहर गुणसूत्रों से पाया जाता है। व्यक्तिगत जीनोम में अधिकांश डीएनए नाभिक में उपस्थित गुणसूत्रों में पाया जाता है। एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के कई रूप उपस्थित हैं, और, इनमें से कुछ महत्वपूर्ण जैविक कार्य करते हैं,<ref name="Rush" /> वे कैंसर जैसी बीमारियों में भी भूमिका निभा सकते हैं।<ref name=":1">{{cite journal | vauthors = Verhaak RG, Bafna V, Mischel PS | title = ट्यूमर रोगजनन और विकास में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल ऑन्कोजीन प्रवर्धन| journal = Nature Reviews. Cancer | volume = 19 | issue = 5 | pages = 283–288 | date = May 2019 | pmid = 30872802 | doi = 10.1038/s41568-019-0128-6 | pmc = 7168519 }}</ref><ref name=":0">{{cite journal | vauthors = Turner KM, Deshpande V, Beyter D, Koga T, Rusert J, Lee C, Li B, Arden K, Ren B, Nathanson DA, Kornblum HI, Taylor MD, Kaushal S, Cavenee WK, Wechsler-Reya R, Furnari FB, Vandenberg SR, Rao PN, Wahl GM, Bafna V, Mischel PS | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल ऑन्कोजीन प्रवर्धन ट्यूमर के विकास और आनुवंशिक विषमता को संचालित करता है| journal = Nature | volume = 543 | issue = 7643 | pages = 122–125 | date = March 2017 | pmid = 28178237 | pmc = 5334176 | doi = 10.1038/nature21356 | bibcode = 2017Natur.543..122T }}</ref><ref name=":3">{{Cite web|title=क्रोमोसोम के बाहर डीएनए द्वारा कैंसर को प्रेरित किया जा सकता है|url=https://www.the-scientist.com/features/cancer-may-be-driven-by-dna-outside-of-chromosomes-68590|access-date=2021-10-05|website=The Scientist Magazine®|language=en}}</ref>


प्रोकैरियोट्स में, नॉनवायरल एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए मुख्य रूप से प्लास्मिड में पाया जाता है, जबकि यूकेरियोट्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए मुख्य रूप से ऑर्गेनेल में पाया जाता है।<ref name="Rush">{{cite journal | vauthors = Rush MG, Misra R | title = यूकेरियोट्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए| journal = Plasmid | volume = 14 | issue = 3 | pages = 177–91 | date = November 1985 | pmid = 3912782 | doi = 10.1016/0147-619X(85)90001-0 }}</ref> [[माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए]] यूकेरियोट्स में इस एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का एक मुख्य स्रोत है।<ref name="Kuttler">{{cite journal | vauthors = Kuttler F, Mai S | title = विकास, विभेदीकरण और ऑन्कोजेनेसिस के दौरान गैर-यादृच्छिक एक्स्ट्राक्रोमोसोमल तत्वों का निर्माण| journal = Seminars in Cancer Biology | volume = 17 | issue = 1 | pages = 56–64 | date = February 2007 | pmid = 17116402 | doi = 10.1016/j.semcancer.2006.10.007 }}</ref> तथ्य यह है कि इस अंगक में अपना स्वयं का डीएनए होता है जो इस परिकल्पना का समर्थन करता है कि माइटोकॉन्ड्रिया की उत्पत्ति पैतृक यूकेरियोटिक कोशिकाओं से घिरे जीवाणु कोशिकाओं के रूप में हुई थी।<ref>{{cite book|last1=Alberts|first1=Bruce|last2=Bray|first2=Dennis|last3=Hopkin|first3=Karen|last4=Johnson|first4=Alexander|last5=Lewis|first5=Julian|last6=Raff|first6=Martin|last7=Roberts|first7=Keith|last8=Walter|first8=Peter | name-list-style = vanc |title=आवश्यक कोशिका जीव विज्ञान|date=2014|publisher=Garland Science|location=New York, New York, USA|isbn=978-0-8153-4454-4|page=449|edition=Fourth}}</ref> एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का उपयोग अक्सर प्रतिकृति के अनुसंधान में किया जाता है क्योंकि इसे पहचानना और अलग करना आसान होता है।<ref name="Rush" />
प्रोकैरियोट्स में, नॉनवायरल एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए मुख्य रूप से प्लास्मिड में पाया जाता है, जबकि यूकेरियोट्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए मुख्य रूप से ऑर्गेनेल में पाया जाता है।<ref name="Rush">{{cite journal | vauthors = Rush MG, Misra R | title = यूकेरियोट्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए| journal = Plasmid | volume = 14 | issue = 3 | pages = 177–91 | date = November 1985 | pmid = 3912782 | doi = 10.1016/0147-619X(85)90001-0 }}</ref> [[माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए]] यूकेरियोट्स में इस एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का एक मुख्य स्रोत है।<ref name="Kuttler">{{cite journal | vauthors = Kuttler F, Mai S | title = विकास, विभेदीकरण और ऑन्कोजेनेसिस के दौरान गैर-यादृच्छिक एक्स्ट्राक्रोमोसोमल तत्वों का निर्माण| journal = Seminars in Cancer Biology | volume = 17 | issue = 1 | pages = 56–64 | date = February 2007 | pmid = 17116402 | doi = 10.1016/j.semcancer.2006.10.007 }}</ref> तथ्य यह है कि इस अंगक में अपना स्वयं का डीएनए होता है जो इस परिकल्पना का समर्थन करता है कि माइटोकॉन्ड्रिया की उत्पत्ति पैतृक यूकेरियोटिक कोशिकाओं से घिरे जीवाणु कोशिकाओं के रूप में हुई थी।<ref>{{cite book|last1=Alberts|first1=Bruce|last2=Bray|first2=Dennis|last3=Hopkin|first3=Karen|last4=Johnson|first4=Alexander|last5=Lewis|first5=Julian|last6=Raff|first6=Martin|last7=Roberts|first7=Keith|last8=Walter|first8=Peter | name-list-style = vanc |title=आवश्यक कोशिका जीव विज्ञान|date=2014|publisher=Garland Science|location=New York, New York, USA|isbn=978-0-8153-4454-4|page=449|edition=Fourth}}</ref> एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का उपयोग प्रायः प्रतिकृति के अनुसंधान में किया जाता है क्योंकि इसे पहचानना और अलग करना आसान होता है।<ref name="Rush" />


हालाँकि एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए (ईसीसीडीएनए) सामान्य यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाया जाता है, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (ईसीडीएनए) एक विशिष्ट इकाई है जिसे कैंसर कोशिकाओं के नाभिक में पहचाना गया है और ड्राइवर ऑन्कोजीन की कई प्रतियां ले जाने के लिए दिखाया गया है।<ref name="Targeted therapy resistance mediate">{{cite journal | vauthors = Nathanson DA, Gini B, Mottahedeh J, Visnyei K, Koga T, Gomez G, Eskin A, Hwang K, Wang J, Masui K, Paucar A, Yang H, Ohashi M, Zhu S, Wykosky J, Reed R, Nelson SF, Cloughesy TF, James CD, Rao PN, Kornblum HI, Heath JR, Cavenee WK, Furnari FB, Mischel PS | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल म्यूटेंट ईजीएफआर डीएनए के गतिशील विनियमन द्वारा मध्यस्थता से लक्षित चिकित्सा प्रतिरोध| journal = Science | volume = 343 | issue = 6166 | pages = 72–6 | date = January 2014 | pmid = 24310612 | pmc = 4049335 | doi = 10.1126/science.1241328 | bibcode = 2014Sci...343...72N }}</ref><ref name=":2">{{cite journal | vauthors = deCarvalho AC, Kim H, Poisson LM, Winn ME, Mueller C, Cherba D, Koeman J, Seth S, Protopopov A, Felicella M, Zheng S, Multani A, Jiang Y, Zhang J, Nam DH, Petricoin EF, Chin L, Mikkelsen T, Verhaak RG | display-authors = 6 | title = क्रोमोसोमल और एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए तत्वों की असंगत विरासत ग्लियोब्लास्टोमा में गतिशील रोग विकास में योगदान करती है| journal = Nature Genetics | volume = 50 | issue = 5 | pages = 708–717 | date = May 2018 | pmid = 29686388 | pmc = 5934307 | doi = 10.1038/s41588-018-0105-0 }}</ref><ref name=":0" /> ईसीडीएनए को जीन प्रवर्धन का एक प्राथमिक तंत्र माना जाता है, जिसके परिणामस्वरूप चालक ऑन्कोजीन की कई प्रतियां और बहुत आक्रामक कैंसर होते हैं।
हालाँकि एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए (eccDNA) सामान्य यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाया जाता है, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (ecDNA) विशिष्ट इकाई है जिसे कैंसर कोशिकाओं के नाभिक में पहचाना गया है और ड्राइवर ऑन्कोजीन की कई प्रतियां ले जाने के लिए दिखाया गया है।<ref name="Targeted therapy resistance mediate">{{cite journal | vauthors = Nathanson DA, Gini B, Mottahedeh J, Visnyei K, Koga T, Gomez G, Eskin A, Hwang K, Wang J, Masui K, Paucar A, Yang H, Ohashi M, Zhu S, Wykosky J, Reed R, Nelson SF, Cloughesy TF, James CD, Rao PN, Kornblum HI, Heath JR, Cavenee WK, Furnari FB, Mischel PS | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल म्यूटेंट ईजीएफआर डीएनए के गतिशील विनियमन द्वारा मध्यस्थता से लक्षित चिकित्सा प्रतिरोध| journal = Science | volume = 343 | issue = 6166 | pages = 72–6 | date = January 2014 | pmid = 24310612 | pmc = 4049335 | doi = 10.1126/science.1241328 | bibcode = 2014Sci...343...72N }}</ref><ref name=":2">{{cite journal | vauthors = deCarvalho AC, Kim H, Poisson LM, Winn ME, Mueller C, Cherba D, Koeman J, Seth S, Protopopov A, Felicella M, Zheng S, Multani A, Jiang Y, Zhang J, Nam DH, Petricoin EF, Chin L, Mikkelsen T, Verhaak RG | display-authors = 6 | title = क्रोमोसोमल और एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए तत्वों की असंगत विरासत ग्लियोब्लास्टोमा में गतिशील रोग विकास में योगदान करती है| journal = Nature Genetics | volume = 50 | issue = 5 | pages = 708–717 | date = May 2018 | pmid = 29686388 | pmc = 5934307 | doi = 10.1038/s41588-018-0105-0 }}</ref><ref name=":0" /> ecDNA को जीन प्रवर्धन का एक प्राथमिक तंत्र माना जाता है, जिसके परिणामस्वरूप चालक ऑन्कोजीन की कई प्रतियां और बहुत आक्रामक कैंसर होते हैं।


साइटोप्लाज्म में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए संरचनात्मक रूप से परमाणु डीएनए से भिन्न पाया गया है। साइटोप्लाज्मिक डीएनए नाभिक के भीतर पाए जाने वाले डीएनए की तुलना में कम मिथाइलेटेड होता है। यह भी पुष्टि की गई कि साइटोप्लाज्मिक डीएनए के अनुक्रम एक ही जीव में परमाणु डीएनए से भिन्न थे, जिससे पता चलता है कि साइटोप्लाज्मिक डीएनए केवल परमाणु डीएनए के टुकड़े नहीं हैं।<ref name="Vogt">{{cite journal | vauthors = Koch J, Vogt G, Kissel W | title = साइटोप्लाज्मिक डीएनए परमाणु डीएनए से संरचनात्मक रूप से अलग है| journal = Die Naturwissenschaften | volume = 70 | issue = 5 | pages = 252–4 | date = May 1983 | pmid = 6877387 | doi = 10.1007/BF00405447 | bibcode = 1983NW.....70..252K | s2cid = 9721603 }}</ref> कैंसर कोशिकाओं में, ईसीडीएनए को मुख्य रूप से नाभिक से पृथक दिखाया गया है (<ref name=":1" /> में समीक्षा की गई है)।
साइटोप्लाज्म में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए संरचनात्मक रूप से परमाणु डीएनए से भिन्न पाया गया है। साइटोप्लाज्मिक डीएनए नाभिक के भीतर पाए जाने वाले डीएनए की तुलना में कम मिथाइलेटेड होता है। यह भी पुष्टि की गई कि साइटोप्लाज्मिक डीएनए के अनुक्रम एक ही जीव में परमाणु डीएनए से भिन्न थे, जिससे पता चलता है कि साइटोप्लाज्मिक डीएनए केवल परमाणु डीएनए के टुकड़े नहीं हैं।<ref name="Vogt">{{cite journal | vauthors = Koch J, Vogt G, Kissel W | title = साइटोप्लाज्मिक डीएनए परमाणु डीएनए से संरचनात्मक रूप से अलग है| journal = Die Naturwissenschaften | volume = 70 | issue = 5 | pages = 252–4 | date = May 1983 | pmid = 6877387 | doi = 10.1007/BF00405447 | bibcode = 1983NW.....70..252K | s2cid = 9721603 }}</ref> कैंसर कोशिकाओं में, ecDNA को मुख्य रूप से नाभिक से पृथक दिखाया गया है (<ref name=":1" /> में समीक्षा की गई है)।


कोशिकाओं में नाभिक के बाहर पाए जाने वाले डीएनए के अलावा, वायरल जीनोम द्वारा संक्रमण भी एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का एक उदाहरण प्रदान करता है।
कोशिकाओं में नाभिक के बाहर पाए जाने वाले डीएनए के अलावा, वायरल जीनोम द्वारा संक्रमण भी एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का एक उदाहरण प्रदान करता है।


== प्रोकैरियोटिक ==
== प्रोकैरियोटिक ==
[[File:PBR322 plasmid showing restriction sites and resistance genes.jpg|thumb|right|200px|ई. कोलाई का pBR32 प्लाज्मिड]]यद्यपि प्रोकैरियोटिक जीवों में यूकेरियोट्स की तरह एक झिल्ली-बद्ध नाभिक नहीं होता है, उनमें एक [[न्यूक्लियॉइड]] क्षेत्र होता है जिसमें मुख्य गुणसूत्र पाया जाता है। एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए न्यूक्लियॉइड क्षेत्र के बाहर गोलाकार या रैखिक प्लास्मिड के रूप में प्रोकैरियोट्स में मौजूद होता है। बैक्टीरियल प्लास्मिड आम तौर पर छोटे अनुक्रम होते हैं, जिनमें 1 से कुछ सौ किलोबेस (केबी) खंड होते हैं, और इसमें प्रतिकृति की उत्पत्ति होती है जो प्लास्मिड को बैक्टीरिया गुणसूत्र से स्वतंत्र रूप से दोहराने की अनुमति देती है।<ref name=Lehninger>{{cite book|last=Nelson|first=David|name-list-style=vanc|title=जैव रसायन के लेहिंगर सिद्धांत|year=2008|publisher=W. H. Freeman and Company|location=New York|isbn=978-0-7167-7108-1|pages=[https://archive.org/details/lehningerprincip00lehn_1/page/307 307–308]|url-access=registration|url=https://archive.org/details/lehningerprincip00lehn_1/page/307}}</ref> किसी कोशिका के भीतर किसी विशेष प्लास्मिड की कुल संख्या को प्रतिलिपि संख्या कहा जाता है और यह प्रति कोशिका दो प्रतियों से लेकर प्रति कोशिका कई सौ प्रतियों तक हो सकती है।<ref name=Watson>{{cite book|last=Watson|first=James| name-list-style = vanc |title=Recombinant RNA: Genes and Genomes- A Short Course|year=2007|publisher=W. H. Freeman and Company|location=New York|isbn=978-0-7167-2866-5|page=81}}</ref> सर्कुलर बैक्टीरियल प्लास्मिड को प्लास्मिड पर एन्कोड किए गए जीन द्वारा प्रदान किए जाने वाले विशेष कार्यों के अनुसार वर्गीकृत किया जाता है। फर्टिलिटी प्लास्मिड, या एफ प्लास्मिड, संयुग्मन होने की अनुमति देते हैं जबकि प्रतिरोध प्लास्मिड, या आर प्लास्मिड, में ऐसे जीन होते हैं जो विभिन्न प्रकार के एंटीबायोटिक दवाओं जैसे एम्पीसिलीन और टेट्रासाइक्लिन के प्रति प्रतिरोध व्यक्त करते हैं। विषाणु प्लास्मिड में जीवाणुओं को रोगजनक बनने के लिए आवश्यक आनुवंशिक तत्व होते हैं। डिग्रेडेटिव प्लास्मिड में ऐसे जीन होते हैं जो बैक्टीरिया को विभिन्न प्रकार के पदार्थों जैसे कि सुगंधित यौगिकों और ज़ेनोबायोटिक्स को नष्ट करने की अनुमति देते हैं।<ref name=Dib>{{cite journal | vauthors = Dib JR, Liebl W, Wagenknecht M, Farías ME, Meinhardt F | title = माइक्रोकोकस में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल जेनेटिक तत्व| journal = Applied Microbiology and Biotechnology | volume = 97 | issue = 1 | pages = 63–75 | date = January 2013 | pmid = 23138713 | doi = 10.1007/s00253-012-4539-5 | s2cid = 5623260 }}</ref> बैक्टीरियल प्लास्मिड रंगद्रव्य उत्पादन, नाइट्रोजन स्थिरीकरण और भारी धातुओं के प्रतिरोध में भी कार्य कर सकते हैं।<ref name=Barnum>{{cite book|last=Barnum|first=Susan| name-list-style = vanc |title=जैव प्रौद्योगिकी- एक परिचय|year=2005|publisher=Brooks / Cole|location=California|isbn=978-0-495-11205-1|pages=62–63}}</ref>
[[File:PBR322 plasmid showing restriction sites and resistance genes.jpg|thumb|right|200px|ई. कोलाई का pBR32 प्लाज्मिड]]यद्यपि प्रोकैरियोटिक जीवों में यूकेरियोट्स की तरह झिल्ली-बद्ध नाभिक नहीं होता है, उनमें [[न्यूक्लियॉइड]] क्षेत्र होता है जिसमें मुख्य गुणसूत्र पाया जाता है। एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए न्यूक्लियॉइड क्षेत्र के बाहर गोलाकार या रैखिक प्लास्मिड के रूप में प्रोकैरियोट्स में उपस्थित होता है। बैक्टीरियल प्लास्मिड सामान्यतः छोटे अनुक्रम होते हैं, जिनमें 1 से कुछ सौ किलोबेस (केबी) खंड होते हैं, और इसमें प्रतिकृति की उत्पत्ति होती है जो प्लास्मिड को बैक्टीरिया गुणसूत्र से स्वतंत्र रूप से दोहराने की अनुमति देती है।<ref name=Lehninger>{{cite book|last=Nelson|first=David|name-list-style=vanc|title=जैव रसायन के लेहिंगर सिद्धांत|year=2008|publisher=W. H. Freeman and Company|location=New York|isbn=978-0-7167-7108-1|pages=[https://archive.org/details/lehningerprincip00lehn_1/page/307 307–308]|url-access=registration|url=https://archive.org/details/lehningerprincip00lehn_1/page/307}}</ref> किसी कोशिका के भीतर किसी विशेष प्लास्मिड की कुल संख्या को प्रतिलिपि संख्या कहा जाता है और यह प्रति कोशिका दो प्रतियों से लेकर प्रति कोशिका कई सौ प्रतियों तक हो सकती है।<ref name=Watson>{{cite book|last=Watson|first=James| name-list-style = vanc |title=Recombinant RNA: Genes and Genomes- A Short Course|year=2007|publisher=W. H. Freeman and Company|location=New York|isbn=978-0-7167-2866-5|page=81}}</ref> सर्कुलर बैक्टीरियल प्लास्मिड को प्लास्मिड पर एन्कोड किए गए जीन द्वारा प्रदान किए जाने वाले विशेष कार्यों के अनुसार वर्गीकृत किया जाता है। फर्टिलिटी प्लास्मिड, या एफ प्लास्मिड, संयुग्मन होने की अनुमति देते हैं जबकि प्रतिरोध प्लास्मिड, या आर प्लास्मिड, में ऐसे जीन होते हैं जो विभिन्न प्रकार के एंटीबायोटिक दवाओं जैसे एम्पीसिलीन और टेट्रासाइक्लिन के प्रति प्रतिरोध व्यक्त करते हैं। विषाणु प्लास्मिड में जीवाणुओं को रोगजनक बनने के लिए आवश्यक आनुवंशिक तत्व होते हैं। डिग्रेडेटिव प्लास्मिड में ऐसे जीन होते हैं जो बैक्टीरिया को विभिन्न प्रकार के पदार्थों जैसे कि सुगंधित यौगिकों और ज़ेनोबायोटिक्स को नष्ट करने की अनुमति देते हैं।<ref name=Dib>{{cite journal | vauthors = Dib JR, Liebl W, Wagenknecht M, Farías ME, Meinhardt F | title = माइक्रोकोकस में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल जेनेटिक तत्व| journal = Applied Microbiology and Biotechnology | volume = 97 | issue = 1 | pages = 63–75 | date = January 2013 | pmid = 23138713 | doi = 10.1007/s00253-012-4539-5 | s2cid = 5623260 }}</ref> बैक्टीरियल प्लास्मिड रंगद्रव्य उत्पादन, नाइट्रोजन स्थिरीकरण और भारी धातुओं के प्रतिरोध में भी कार्य कर सकते हैं।<ref name=Barnum>{{cite book|last=Barnum|first=Susan| name-list-style = vanc |title=जैव प्रौद्योगिकी- एक परिचय|year=2005|publisher=Brooks / Cole|location=California|isbn=978-0-495-11205-1|pages=62–63}}</ref>


स्वाभाविक रूप से उत्पन्न होने वाले वृत्ताकार प्लास्मिड को बहुप्रतिरोध जीनों और कई अद्वितीय [[प्रतिबंध साइटों]] को समाहित करने के लिए संशोधित किया जा सकता है, जिससे वे जैव प्रौद्योगिकी में [[क्लोनिंग वेक्टर]] के रूप में मूल्यवान उपकरण बन जाते हैं।<ref name=Lehninger /> सर्कुलर बैक्टीरियल प्लास्मिड भी [[डीएनए टीकाकरण]] के उत्पादन का आधार हैं। प्लास्मिड डीएनए टीके [[जेनेटिक इंजीनियरिंग]] हैं जिसमें एक जीन होता है जो एक रोगजनक वायरस, जीवाणु या अन्य परजीवी द्वारा उत्पादित [[एंटीजन]] या प्रोटीन के लिए एन्कोड करता है।<ref name=Laddy>{{cite journal | vauthors = Laddy DJ, Weiner DB | title = From plasmids to protection: a review of DNA vaccines against infectious diseases | journal = International Reviews of Immunology | volume = 25 | issue = 3–4 | pages = 99–123 | year = 2006 | pmid = 16818367 | doi = 10.1080/08830180600785827 | s2cid = 38432882 }}</ref> एक बार मेजबान में वितरित होने के बाद, प्लाज्मिड जीन के उत्पाद मेजबान की सहज प्रतिरक्षा और अनुकूली प्रतिरक्षा दोनों को उत्तेजित करेंगे। मेजबान से प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को बढ़ाने के लिए प्लास्मिड अक्सर डिलीवरी से पहले किसी प्रकार के [[सहायक]] के साथ लेपित होते हैं।<ref name=Ongkudon>{{cite journal | vauthors = Ongkudon CM, Ho J, Danquah MK | title = Mitigating the looming vaccine crisis: production and delivery of plasmid-based vaccines | journal = Critical Reviews in Biotechnology | volume = 31 | issue = 1 | pages = 32–52 | date = March 2011 | pmid = 20879832 | doi = 10.3109/07388551.2010.483460 | s2cid = 207467603 | url = http://eprints.ums.edu.my/20570/1/Mitigating%20the%20Looming%20Vaccine%20crisis.pdf }}</ref>
स्वाभाविक रूप से उत्पन्न होने वाले वृत्ताकार प्लास्मिड को बहुप्रतिरोध जीनों और कई अद्वितीय [[प्रतिबंध साइटों]] को समाहित करने के लिए संशोधित किया जा सकता है, जिससे वे जैव प्रौद्योगिकी में [[क्लोनिंग वेक्टर]] के रूप में मूल्यवान उपकरण बन जाते हैं।<ref name=Lehninger /> सर्कुलर बैक्टीरियल प्लास्मिड भी [[डीएनए टीकाकरण]] के उत्पादन का आधार हैं। प्लास्मिड डीएनए टीके [[जेनेटिक इंजीनियरिंग]] हैं जिसमें जीन होता है जो एक रोगजनक वायरस, जीवाणु या अन्य परजीवी द्वारा उत्पादित [[एंटीजन]] या प्रोटीन के लिए एन्कोड करता है।<ref name=Laddy>{{cite journal | vauthors = Laddy DJ, Weiner DB | title = From plasmids to protection: a review of DNA vaccines against infectious diseases | journal = International Reviews of Immunology | volume = 25 | issue = 3–4 | pages = 99–123 | year = 2006 | pmid = 16818367 | doi = 10.1080/08830180600785827 | s2cid = 38432882 }}</ref> एक बार मेजबान में वितरित होने के बाद, प्लाज्मिड जीन के उत्पाद मेजबान की सहज प्रतिरक्षा और अनुकूली प्रतिरक्षा दोनों को उत्तेजित करेंगे। मेजबान से प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को बढ़ाने के लिए प्लास्मिड प्रायः डिलीवरी से पहले किसी प्रकार के [[सहायक]] के साथ लेपित होते हैं।<ref name=Ongkudon>{{cite journal | vauthors = Ongkudon CM, Ho J, Danquah MK | title = Mitigating the looming vaccine crisis: production and delivery of plasmid-based vaccines | journal = Critical Reviews in Biotechnology | volume = 31 | issue = 1 | pages = 32–52 | date = March 2011 | pmid = 20879832 | doi = 10.3109/07388551.2010.483460 | s2cid = 207467603 | url = http://eprints.ums.edu.my/20570/1/Mitigating%20the%20Looming%20Vaccine%20crisis.pdf }}</ref>


स्पिरोचैट की कई प्रजातियों में लीनियर बैक्टीरियल प्लास्मिड की पहचान की गई है, जिसमें जीनस बोरेलिया के सदस्य (जिससे लाइम रोग के लिए जिम्मेदार रोगज़नक़ शामिल है), [[ग्राम-नकारात्मक जीवाणु|ग्राम-ऋणात्मक जीवाणु]] की कई प्रजातियाँ जीनस स्ट्रेप्टोमाइसेस के मिट्टी के बैक्टीरिया और ग्राम में- ऋणात्मक जीवाणु प्रजाति थियोबैसिलस वर्सुटस, एक जीवाणु जो सल्फर को ऑक्सीकरण करता है। प्रोकैरियोट्स के रैखिक प्लास्मिड या तो एक [[हेयरपिन लूप]] या डीएनए अणु के [[टेलोमेर]] सिरों से जुड़े एक [[सहसंयोजक बंधन]] प्रोटीन से युक्त पाए जाते हैं। बोरेलिया बैक्टीरिया के एडेनिन-थाइमिन समृद्ध हेयरपिन लूप का आकार 5 किलोबेस जोड़े (केबी) से लेकर 200 केबी से अधिक तक होता है।<ref name="Hinnenbusch">{{cite journal | vauthors = Hinnebusch J, Tilly K | title = बैक्टीरिया में रैखिक प्लास्मिड और गुणसूत्र| journal = Molecular Microbiology | volume = 10 | issue = 5 | pages = 917–22 | date = December 1993 | pmid = 7934868 | doi = 10.1111/j.1365-2958.1993.tb00963.x | s2cid = 23852021 | url = https://zenodo.org/record/1230611 }}</ref> और बैक्टीरिया पर प्रमुख सतह प्रोटीन, या एंटीजन के एक समूह के उत्पादन के लिए जिम्मेदार जीन होते हैं जो इसे अपने संक्रमित मेजबान की प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया से बचने की अनुमति देते हैं।<ref name="Meinhardt">{{cite journal | vauthors = Meinhardt F, Schaffrath R, Larsen M | title = माइक्रोबियल रैखिक प्लास्मिड| journal = Applied Microbiology and Biotechnology | volume = 47 | issue = 4 | pages = 329–36 | date = April 1997 | pmid = 9163946 | doi = 10.1007/s002530050936 | s2cid = 8092364 }}</ref> रैखिक प्लास्मिड जिसमें एक प्रोटीन होता है जो डीएनए स्ट्रैंड के 5' छोर से सहसंयोजक रूप से जुड़ा होता है, इनवर्ट्रोन के रूप में जाना जाता है और इसका आकार 9 केबी से लेकर 600 केबी से अधिक हो सकता है जिसमें उल्टे दोहराव शामिल होते हैं।<ref name="Hinnenbusch" /> एक सहसंयोजक प्रोटीन के साथ रैखिक प्लास्मिड जीवाणु जीवाणु संयुग्मन और प्लास्मिड के जीनोम में एकीकरण के साथ सहायता कर सकते हैं। इस प्रकार के रैखिक प्लास्मिड एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के सबसे बड़े वर्ग का प्रतिनिधित्व करते हैं क्योंकि वे न केवल कुछ बैक्टीरिया कोशिकाओं में मौजूद होते हैं, बल्कि यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाए जाने वाले सभी रैखिक एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु भी इस इन्वर्ट्रोन संरचना को 5' छोर से जुड़े प्रोटीन के साथ लेते हैं।<ref name="Hinnenbusch" /><ref name="Meinhardt" />
स्पिरोचैट की कई प्रजातियों में लीनियर बैक्टीरियल प्लास्मिड की पहचान की गई है, जिसमें जीनस बोरेलिया के सदस्य (जिससे लाइम रोग के लिए जिम्मेदार रोगज़नक़ सम्मिलित है), [[ग्राम-नकारात्मक जीवाणु|ग्राम-ऋणात्मक जीवाणु]] की कई प्रजातियाँ जीनस स्ट्रेप्टोमाइसेस के मिट्टी के बैक्टीरिया और ग्राम में- ऋणात्मक जीवाणु प्रजाति थियोबैसिलस वर्सुटस, जीवाणु जो सल्फर को ऑक्सीकरण करता है। प्रोकैरियोट्स के रैखिक प्लास्मिड या तो [[हेयरपिन लूप]] या डीएनए अणु के [[टेलोमेर]] सिरों से जुड़े [[सहसंयोजक बंधन]] प्रोटीन से युक्त पाए जाते हैं। बोरेलिया बैक्टीरिया के एडेनिन-थाइमिन समृद्ध हेयरपिन लूप का आकार 5 किलोबेस जोड़े (केबी) से लेकर 200 केबी से अधिक तक होता है।<ref name="Hinnenbusch">{{cite journal | vauthors = Hinnebusch J, Tilly K | title = बैक्टीरिया में रैखिक प्लास्मिड और गुणसूत्र| journal = Molecular Microbiology | volume = 10 | issue = 5 | pages = 917–22 | date = December 1993 | pmid = 7934868 | doi = 10.1111/j.1365-2958.1993.tb00963.x | s2cid = 23852021 | url = https://zenodo.org/record/1230611 }}</ref> और बैक्टीरिया पर प्रमुख सतह प्रोटीन, या एंटीजन के समूह के उत्पादन के लिए जिम्मेदार जीन होते हैं जो इसे अपने संक्रमित मेजबान की प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया से बचने की अनुमति देते हैं।<ref name="Meinhardt">{{cite journal | vauthors = Meinhardt F, Schaffrath R, Larsen M | title = माइक्रोबियल रैखिक प्लास्मिड| journal = Applied Microbiology and Biotechnology | volume = 47 | issue = 4 | pages = 329–36 | date = April 1997 | pmid = 9163946 | doi = 10.1007/s002530050936 | s2cid = 8092364 }}</ref> रैखिक प्लास्मिड जिसमें प्रोटीन होता है जो डीएनए स्ट्रैंड के 5' छोर से सहसंयोजक रूप से जुड़ा होता है, इनवर्ट्रोन के रूप में जाना जाता है और इसका आकार 9 केबी से लेकर 600 केबी से अधिक हो सकता है जिसमें उल्टे दोहराव सम्मिलित होते हैं।<ref name="Hinnenbusch" /> सहसंयोजक प्रोटीन के साथ रैखिक प्लास्मिड जीवाणु जीवाणु संयुग्मन और प्लास्मिड के जीनोम में एकीकरण के साथ सहायता कर सकते हैं। इस प्रकार के रैखिक प्लास्मिड एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के सबसे बड़े वर्ग का प्रतिनिधित्व करते हैं क्योंकि वे न केवल कुछ बैक्टीरिया कोशिकाओं में उपस्थित होते हैं, बल्कि यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाए जाने वाले सभी रैखिक एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु भी इस इन्वर्ट्रोन संरचना को 5' छोर से जुड़े प्रोटीन के साथ लेते हैं।<ref name="Hinnenbusch" /><ref name="Meinhardt" />


लंबे, रैखिक "बोर्ग" जो आर्कियोन की एक प्रजाति के साथ सह-घटित होते हैं - जो उन्हें होस्ट कर सकते हैं और उनके कई जीनों को साझा कर सकते हैं - एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए संरचनाओं का एक अज्ञात रूप हो सकता है।<ref>{{cite journal |last1=Dance |first1=Amber |title=बड़े पैमाने पर डीएनए 'बोर्ग' वैज्ञानिकों को हैरान कर देता है|journal=Nature |date=16 July 2021 |volume=595 |issue=7869 |pages=636 |language=en |doi=10.1038/d41586-021-01947-3|bibcode=2021Natur.595..636D |s2cid=236001172 |doi-access=free }}</ref><ref name="indepborgs">{{cite news |last1=Andrew |first1=Shakespeare, William Gurr |title=पहले अनदेखा डीएनए 'बोर्ग' कैलिफोर्निया आर्द्रभूमि पर पाया गया|url=https://www.independent.co.uk/climate-change/news/dna-wetlands-borgs-california-b1893312.html |access-date=13 August 2021 |work=The Independent |date=30 July 2021 |language=en}}</ref>
लंबे, रैखिक "बोर्ग" जो आर्कियोन की प्रजाति के साथ सह-घटित होते हैं - जो उन्हें होस्ट कर सकते हैं और उनके कई जीनों को साझा कर सकते हैं - एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए संरचनाओं का अज्ञात रूप हो सकता है।<ref>{{cite journal |last1=Dance |first1=Amber |title=बड़े पैमाने पर डीएनए 'बोर्ग' वैज्ञानिकों को हैरान कर देता है|journal=Nature |date=16 July 2021 |volume=595 |issue=7869 |pages=636 |language=en |doi=10.1038/d41586-021-01947-3|bibcode=2021Natur.595..636D |s2cid=236001172 |doi-access=free }}</ref><ref name="indepborgs">{{cite news |last1=Andrew |first1=Shakespeare, William Gurr |title=पहले अनदेखा डीएनए 'बोर्ग' कैलिफोर्निया आर्द्रभूमि पर पाया गया|url=https://www.independent.co.uk/climate-change/news/dna-wetlands-borgs-california-b1893312.html |access-date=13 August 2021 |work=The Independent |date=30 July 2021 |language=en}}</ref>


== यूकेरियोटिक ==
== यूकेरियोटिक ==


=== माइटोकॉन्ड्रियल ===
=== माइटोकॉन्ड्रियल ===
[[File:Map of the human mitochondrial genome.svg|thumb|मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए 37 जीन दिखा रहा है]]यूकेरियोटिक कोशिकाओं में मौजूद माइटोकॉन्ड्रिया में माइटोकॉन्ड्रियल मैट्रिक्स में माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (एमटीडीएनए) की कई प्रतियां होती हैं।<ref name=Lodish>{{cite book|last=Lodish|first=Harvey| name-list-style = vanc |title=Molecular Cell Biology, 7th edition|year=2013|publisher=W.H. Freeman and Company|location=New York|isbn=978-1-4641-2398-6|pages=245–251}}</ref> मनुष्यों सहित बहुकोशिकीय जानवरों में, गोलाकार एमटीडीएनए क्रोमोसोम में 13 जीन होते हैं जो प्रोटीन को एनकोड करते हैं जो इलेक्ट्रॉन परिवहन श्रृंखला का हिस्सा होते हैं और अन्य माइटोकॉन्ड्रियल प्रोटीन के लिए 24 जीन होते हैं; ये जीन 2 [[आरआरएनए]] जीन और 22 [[टीआरएनए]] जीन में टूट जाते हैं।<ref name=Chinnery>{{cite journal | vauthors = Chinnery PF, Turnbull DM | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए और रोग| journal = Lancet | volume = 354 Suppl 1 | issue = 9176 | pages = SI17-21 | date = July 1999 | pmid = 10437851 | doi = 10.1016/S0140-6736(99)90244-1 | s2cid = 38869885 | doi-access = free }}</ref> एक जानवर एमटीडीएनए प्लास्मिड का आकार लगभग 16.6 केबी है और, हालांकि इसमें टीआरएनए और एमआरएनए संश्लेषण के लिए जीन शामिल हैं, परमाणु जीन द्वारा कोडित प्रोटीन को अभी भी एमटीडीएनए को दोहराने या माइटोकॉन्ड्रियल प्रोटीन का अनुवाद करने के लिए आवश्यक है।<ref name=Dimmock>{{cite journal | vauthors = Dimmock D, Tang LY, Schmitt ES, Wong LJ | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए रिक्तीकरण सिंड्रोम का मात्रात्मक मूल्यांकन| journal = Clinical Chemistry | volume = 56 | issue = 7 | pages = 1119–27 | date = July 2010 | pmid = 20448188 | doi = 10.1373/clinchem.2009.141549 | doi-access = free }}</ref> माइटोकॉन्ड्रियल गुणसूत्र का केवल एक क्षेत्र है जिसमें कोडिंग अनुक्रम नहीं होता है, 1 केबी क्षेत्र जिसे डी-लूप के रूप में जाना जाता है, जिससे परमाणु नियामक प्रोटीन बंधते हैं।<ref name = Chinnery /> प्रति माइटोकॉन्ड्रिया में एमटीडीएनए अणुओं की संख्या प्रजातियों से प्रजातियों के साथ-साथ विभिन्न ऊर्जा मांगों वाली कोशिकाओं के बीच भिन्न होती है। उदाहरण के लिए, मांसपेशियों और यकृत कोशिकाओं में रक्त और त्वचा कोशिकाओं की तुलना में प्रति माइटोकॉन्ड्रिया में एमटीडीएनए की अधिक प्रतियां होती हैं।<ref name=Dimmock /> माइटोकॉन्ड्रियल आंतरिक झिल्ली के भीतर इलेक्ट्रॉन परिवहन श्रृंखला की निकटता और [[प्रतिक्रियाशील ऑक्सीजन प्रजातियों]] (आरओएस) के उत्पादन के कारण, और इस तथ्य के कारण कि एमटीडीएनए अणु हिस्टोन द्वारा बाध्य या संरक्षित नहीं है, एमटीडीएनए परमाणु डीएनए की तुलना में डीएनए क्षति के प्रति अधिक संवेदनशील है।<ref name=Bohr>{{cite journal | vauthors = Bohr VA, Anson RM | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए की मरम्मत के रास्ते| journal = Journal of Bioenergetics and Biomembranes | volume = 31 | issue = 4 | pages = 391–8 | date = August 1999 | pmid = 10665528 | doi = 10.1023/A:1005484004167 | s2cid = 43100873 }}</ref> ऐसे मामलों में जहां एमटीडीएनए क्षति होती है, डीएनए को या तो बेस एक्सिशन रिपेयर पाथवे के जरिए ठीक किया जा सकता है, या क्षतिग्रस्त एमटीडीएनए अणु को नष्ट कर दिया जाता है (माइटोकॉन्ड्रियन को नुकसान पहुंचाए बिना क्योंकि प्रति माइटोकॉन्ड्रियन में एमटीडीएनए की कई प्रतियां होती हैं)।<ref name=Bendich>{{cite journal | vauthors = Bendich AJ | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए, क्लोरोप्लास्ट डीएनए और यूकेरियोटिक जीवों में विकास की उत्पत्ति| journal = Biology Direct | volume = 5 | issue = 42 | pages = 42 | date = June 2010 | pmid = 20587059 | pmc = 2907347 | doi = 10.1186/1745-6150-5-42 }}</ref>
[[File:Map of the human mitochondrial genome.svg|thumb|मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए 37 जीन दिखा रहा है]]यूकेरियोटिक कोशिकाओं में उपस्थित माइटोकॉन्ड्रिया में माइटोकॉन्ड्रियल मैट्रिक्स में माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (mtDNA) की कई प्रतियां होती हैं।<ref name=Lodish>{{cite book|last=Lodish|first=Harvey| name-list-style = vanc |title=Molecular Cell Biology, 7th edition|year=2013|publisher=W.H. Freeman and Company|location=New York|isbn=978-1-4641-2398-6|pages=245–251}}</ref> मनुष्यों सहित बहुकोशिकीय जानवरों में, गोलाकार mtDNA क्रोमोसोम में 13 जीन होते हैं जो प्रोटीन को एनकोड करते हैं जो इलेक्ट्रॉन परिवहन श्रृंखला का हिस्सा होते हैं और अन्य माइटोकॉन्ड्रियल प्रोटीन के लिए 24 जीन होते हैं; ये जीन 2 [[आरआरएनए|rRNA]] जीन और 22 [[टीआरएनए|tRNA]] जीन में टूट जाते हैं।<ref name=Chinnery>{{cite journal | vauthors = Chinnery PF, Turnbull DM | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए और रोग| journal = Lancet | volume = 354 Suppl 1 | issue = 9176 | pages = SI17-21 | date = July 1999 | pmid = 10437851 | doi = 10.1016/S0140-6736(99)90244-1 | s2cid = 38869885 | doi-access = free }}</ref> जानवर mtDNA प्लास्मिड का आकार लगभग 16.6 केबी है और, हालांकि इसमें tRNA और mRNA संश्लेषण के लिए जीन सम्मिलित हैं, परमाणु जीन द्वारा कोडित प्रोटीन को अभी भी mtDNA को दोहराने या माइटोकॉन्ड्रियल प्रोटीन का अनुवाद करने के लिए आवश्यक है।<ref name=Dimmock>{{cite journal | vauthors = Dimmock D, Tang LY, Schmitt ES, Wong LJ | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए रिक्तीकरण सिंड्रोम का मात्रात्मक मूल्यांकन| journal = Clinical Chemistry | volume = 56 | issue = 7 | pages = 1119–27 | date = July 2010 | pmid = 20448188 | doi = 10.1373/clinchem.2009.141549 | doi-access = free }}</ref> माइटोकॉन्ड्रियल गुणसूत्र का केवल एक क्षेत्र है जिसमें कोडिंग अनुक्रम नहीं होता है, 1 केबी क्षेत्र जिसे डी-लूप के रूप में जाना जाता है, जिससे परमाणु नियामक प्रोटीन बंधते हैं।<ref name = Chinnery /> प्रति माइटोकॉन्ड्रिया में mtDNA अणुओं की संख्या प्रजातियों से प्रजातियों के साथ-साथ विभिन्न ऊर्जा मांगों वाली कोशिकाओं के बीच भिन्न होती है। उदाहरण के लिए, मांसपेशियों और यकृत कोशिकाओं में रक्त और त्वचा कोशिकाओं की तुलना में प्रति माइटोकॉन्ड्रिया में mtDNA की अधिक प्रतियां होती हैं।<ref name=Dimmock /> माइटोकॉन्ड्रियल आंतरिक झिल्ली के भीतर इलेक्ट्रॉन परिवहन श्रृंखला की निकटता और [[प्रतिक्रियाशील ऑक्सीजन प्रजातियों]] (आरओएस) के उत्पादन के कारण, और इस तथ्य के कारण कि mtDNA अणु हिस्टोन द्वारा बाध्य या संरक्षित नहीं है, mtDNA परमाणु डीएनए की तुलना में डीएनए क्षति के प्रति अधिक संवेदनशील है।<ref name=Bohr>{{cite journal | vauthors = Bohr VA, Anson RM | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए की मरम्मत के रास्ते| journal = Journal of Bioenergetics and Biomembranes | volume = 31 | issue = 4 | pages = 391–8 | date = August 1999 | pmid = 10665528 | doi = 10.1023/A:1005484004167 | s2cid = 43100873 }}</ref> ऐसे स्थितियों में जहां mtDNA क्षति होती है, डीएनए को या तो बेस एक्सिशन रिपेयर पाथवे के जरिए ठीक किया जा सकता है, या क्षतिग्रस्त mtDNA अणु को नष्ट कर दिया जाता है (माइटोकॉन्ड्रियन को नुकसान पहुंचाए बिना क्योंकि प्रति माइटोकॉन्ड्रियन में mtDNA की कई प्रतियां होती हैं)।<ref name=Bendich>{{cite journal | vauthors = Bendich AJ | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए, क्लोरोप्लास्ट डीएनए और यूकेरियोटिक जीवों में विकास की उत्पत्ति| journal = Biology Direct | volume = 5 | issue = 42 | pages = 42 | date = June 2010 | pmid = 20587059 | pmc = 2907347 | doi = 10.1186/1745-6150-5-42 }}</ref>
मानक आनुवंशिक कोड जिसके द्वारा परमाणु जीन का अनुवाद किया जाता है, सार्वभौमिक है, जिसका अर्थ है कि डीएनए का प्रत्येक 3-आधार अनुक्रम एक ही अमीनो एसिड के लिए कोड करता है, चाहे डीएनए किसी भी प्रजाति से आता हो। हालाँकि, यह कोड काफी सार्वभौमिक है और कवक, जानवरों, प्रोटिस्ट और पौधों के माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए में थोड़ा अलग है।<ref name=Lodish /> जबकि इन जीवों के एमटीडीएनए में अधिकांश 3-बेस अनुक्रम (कोडन) परमाणु आनुवंशिक कोड के समान अमीनो एसिड के लिए कोड करते हैं, कुछ भिन्न होते हैं।
मानक आनुवंशिक कोड जिसके द्वारा परमाणु जीन का अनुवाद किया जाता है, सार्वभौमिक है, जिसका अर्थ है कि डीएनए का प्रत्येक 3-आधार अनुक्रम एक ही अमीनो एसिड के लिए कोड करता है, चाहे डीएनए किसी भी प्रजाति से आता हो। हालाँकि, यह कोड काफी सार्वभौमिक है और कवक, जानवरों, प्रोटिस्ट और पौधों के माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए में थोड़ा अलग है।<ref name=Lodish /> जबकि इन जीवों के mtDNA में अधिकांश 3-बेस अनुक्रम (कोडन) परमाणु आनुवंशिक कोड के समान अमीनो एसिड के लिए कोड करते हैं, कुछ भिन्न होते हैं।


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|+ विभिन्न जीवों के एमटीडीएनए अनुक्रमों में कोडिंग अंतर
|+ विभिन्न जीवों के mtDNA अनुक्रमों में कोडिंग अंतर
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ऐसा माना जाता है कि कोडिंग अंतर ट्रांसफर आरएनए में रासायनिक संशोधनों का परिणाम है जो एमटीडीएनए अनुक्रमों को लिखने के परिणामस्वरूप उत्पन्न मैसेंजर आरएनए के साथ बातचीत करते हैं।<ref name=Bernt>{{cite journal | vauthors = Bernt M, Braband A, Schierwater B, Stadler PF | title = माइटोकॉन्ड्रियल जीनोम विकास के आनुवंशिक पहलू| journal = Molecular Phylogenetics and Evolution | volume = 69 | issue = 2 | pages = 328–38 | date = November 2013 | pmid = 23142697 | doi = 10.1016/j.ympev.2012.10.020 }}</ref>
ऐसा माना जाता है कि कोडिंग अंतर ट्रांसफर आरएनए में रासायनिक संशोधनों का परिणाम है जो mtDNA अनुक्रमों को लिखने के परिणामस्वरूप उत्पन्न मैसेंजर आरएनए के साथ बातचीत करते हैं।<ref name=Bernt>{{cite journal | vauthors = Bernt M, Braband A, Schierwater B, Stadler PF | title = माइटोकॉन्ड्रियल जीनोम विकास के आनुवंशिक पहलू| journal = Molecular Phylogenetics and Evolution | volume = 69 | issue = 2 | pages = 328–38 | date = November 2013 | pmid = 23142697 | doi = 10.1016/j.ympev.2012.10.020 }}</ref>
=== [[क्लोरोप्लास्ट]] ===
=== [[क्लोरोप्लास्ट]] ===
यूकेरियोटिक क्लोरोप्लास्ट, साथ ही अन्य पौधों के प्लास्टिड्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु भी होते हैं। अधिकांश क्लोरोप्लास्ट अपनी सभी आनुवंशिक सामग्री को एक ही चक्राकार गुणसूत्र में रखते हैं, हालाँकि कुछ प्रजातियों में कई छोटे चक्राकार प्लास्मिड के प्रमाण मिलते हैं।<ref>{{cite journal | vauthors = Clegg MT, Gaut BS, Learn GH, Morton BR | title = क्लोरोप्लास्ट डीएनए विकास की दरें और पैटर्न| journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 91 | issue = 15 | pages = 6795–801 | date = July 1994 | pmid = 8041699 | pmc = 44285 | doi = 10.1073/pnas.91.15.6795 | bibcode = 1994PNAS...91.6795C | doi-access = free }}</ref><ref name="Lilly">{{cite journal | vauthors = Lilly JW, Havey MJ, Jackson SA, Jiang J | title = साइटोजेनोमिक विश्लेषण से उच्च पौधों में क्लोरोप्लास्ट जीनोम की संरचनात्मक प्लास्टिसिटी का पता चलता है| journal = The Plant Cell | volume = 13 | issue = 2 | pages = 245–54 | date = February 2001 | pmid = 11226183 | pmc = 102240 | doi = 10.1105/tpc.13.2.245 }}</ref><ref>{{cite book|last1=Aronsson|first1=Henrik|last2=Sandelius|first2=Anna Stina | name-list-style = vanc |title=क्लोरोप्लास्ट पर्यावरण के साथ परस्पर क्रिया करता है|date=2009|publisher=Springer|location=Berlin|isbn=978-3540686965|page=18|edition=[Online-Ausg.].}}</ref> एक हालिया सिद्धांत जो अंगूठी के आकार के क्लोरोप्लास्ट डीएनए (सीपीडीएनए) के वर्तमान मानक मॉडल पर सवाल उठाता है, सुझाव देता है कि सीपीडीएनए आमतौर पर एक रैखिक आकार ले सकता है।<ref>{{cite journal | vauthors = Bendich AJ | title = Circular chloroplast chromosomes: the grand illusion | journal = The Plant Cell | volume = 16 | issue = 7 | pages = 1661–6 | date = July 2004 | pmid = 15235123 | pmc = 514151 | doi = 10.1105/tpc.160771 }}</ref> सीपीडीएनए के एक अणु में 100-200 जीन हो सकते हैं<ref name=Wang>{{cite journal | vauthors = Wang Y, Ding J, Daniell H, Hu H, Li X | title = मोटिफ विश्लेषण क्लोरोप्लास्ट जीन के संभावित सह-नियमन और क्लोरोप्लास्ट प्रोटीन को कूटने वाले परमाणु जीन का खुलासा करता है| journal = Plant Molecular Biology | volume = 80 | issue = 2 | pages = 177–87 | date = September 2012 | pmid = 22733202 | doi = 10.1007/s11103-012-9938-6 | s2cid = 18567678 }}</ref> और विभिन्न प्रजातियों के आकार में भिन्नता होती है। उच्च पौधों में सीपीडीएनए का आकार लगभग 120-160 केबी होता है।<ref name=Lodish /> एमआरएनए के लिए सीपीडीएनए कोड पर पाए जाने वाले जीन प्रकाश संश्लेषक मार्ग के आवश्यक घटकों के उत्पादन के साथ-साथ टीआरएनए, आरआरएनए, आरएनए पोलीमरेज़ सबयूनिट और [[राइबोसोमल प्रोटीन]] सबयूनिट के लिए कोडिंग के लिए जिम्मेदार हैं।<ref name=Pfalz>{{cite journal | vauthors = Pfalz J, Pfannschmidt T | title = प्रारंभिक क्लोरोप्लास्ट विकास में आवश्यक न्यूक्लियॉइड प्रोटीन| journal = Trends in Plant Science | volume = 18 | issue = 4 | pages = 186–94 | date = April 2013 | pmid = 23246438 | doi = 10.1016/j.tplants.2012.11.003 }}</ref> एमटीडीएनए की तरह, सीपीडीएनए पूरी तरह से स्वायत्त नहीं है और क्लोरोप्लास्ट प्रोटीन की प्रतिकृति और उत्पादन के लिए परमाणु जीन उत्पादों पर निर्भर करता है। क्लोरोप्लास्ट में सीपीडीएनए की कई प्रतियां होती हैं और संख्या न केवल प्रजातियों से प्रजातियों या कोशिका प्रकार से कोशिका प्रकार तक भिन्न हो सकती है, बल्कि कोशिका की आयु और विकास के चरण के आधार पर एक कोशिका के भीतर भी भिन्न हो सकती है। उदाहरण के लिए, युवा कोशिकाओं के क्लोरोप्लास्ट में सीपीडीएनए सामग्री, विकास के शुरुआती चरणों के दौरान, जहां क्लोरोप्लास्ट अस्पष्ट प्रोप्लास्टिड के रूप में होते हैं, उस समय मौजूद कोशिकाओं की तुलना में बहुत अधिक होती है जब वह कोशिका परिपक्व होती है और विस्तारित होती है, जिसमें पूरी तरह से परिपक्व प्लास्टिड होते हैं।<ref name=Rowen>{{cite journal | vauthors = Rowan BA, Bendich AJ | title = The loss of DNA from chloroplasts as leaves mature: fact or artefact? | journal = Journal of Experimental Botany | volume = 60 | issue = 11 | pages = 3005–10 | year = 2009 | pmid = 19454766 | doi = 10.1093/jxb/erp158 | doi-access = free }}</ref>
यूकेरियोटिक क्लोरोप्लास्ट, साथ ही अन्य पौधों के प्लास्टिड्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु भी होते हैं। अधिकांश क्लोरोप्लास्ट अपनी सभी आनुवंशिक सामग्री को एक ही चक्राकार गुणसूत्र में रखते हैं, हालाँकि कुछ प्रजातियों में कई छोटे चक्राकार प्लास्मिड के प्रमाण मिलते हैं।<ref>{{cite journal | vauthors = Clegg MT, Gaut BS, Learn GH, Morton BR | title = क्लोरोप्लास्ट डीएनए विकास की दरें और पैटर्न| journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 91 | issue = 15 | pages = 6795–801 | date = July 1994 | pmid = 8041699 | pmc = 44285 | doi = 10.1073/pnas.91.15.6795 | bibcode = 1994PNAS...91.6795C | doi-access = free }}</ref><ref name="Lilly">{{cite journal | vauthors = Lilly JW, Havey MJ, Jackson SA, Jiang J | title = साइटोजेनोमिक विश्लेषण से उच्च पौधों में क्लोरोप्लास्ट जीनोम की संरचनात्मक प्लास्टिसिटी का पता चलता है| journal = The Plant Cell | volume = 13 | issue = 2 | pages = 245–54 | date = February 2001 | pmid = 11226183 | pmc = 102240 | doi = 10.1105/tpc.13.2.245 }}</ref><ref>{{cite book|last1=Aronsson|first1=Henrik|last2=Sandelius|first2=Anna Stina | name-list-style = vanc |title=क्लोरोप्लास्ट पर्यावरण के साथ परस्पर क्रिया करता है|date=2009|publisher=Springer|location=Berlin|isbn=978-3540686965|page=18|edition=[Online-Ausg.].}}</ref> एक हालिया सिद्धांत जो अंगूठी के आकार के क्लोरोप्लास्ट डीएनए (सीपीडीएनए) के वर्तमान मानक मॉडल पर सवाल उठाता है, सुझाव देता है कि सीपीडीएनए सामान्यतः एक रैखिक आकार ले सकता है।<ref>{{cite journal | vauthors = Bendich AJ | title = Circular chloroplast chromosomes: the grand illusion | journal = The Plant Cell | volume = 16 | issue = 7 | pages = 1661–6 | date = July 2004 | pmid = 15235123 | pmc = 514151 | doi = 10.1105/tpc.160771 }}</ref> सीपीडीएनए के एक अणु में 100-200 जीन हो सकते हैं<ref name=Wang>{{cite journal | vauthors = Wang Y, Ding J, Daniell H, Hu H, Li X | title = मोटिफ विश्लेषण क्लोरोप्लास्ट जीन के संभावित सह-नियमन और क्लोरोप्लास्ट प्रोटीन को कूटने वाले परमाणु जीन का खुलासा करता है| journal = Plant Molecular Biology | volume = 80 | issue = 2 | pages = 177–87 | date = September 2012 | pmid = 22733202 | doi = 10.1007/s11103-012-9938-6 | s2cid = 18567678 }}</ref> और विभिन्न प्रजातियों के आकार में भिन्नता होती है। उच्च पौधों में सीपीडीएनए का आकार लगभग 120-160 केबी होता है।<ref name=Lodish /> mRNA के लिए सीपीडीएनए कोड पर पाए जाने वाले जीन प्रकाश संश्लेषक मार्ग के आवश्यक घटकों के उत्पादन के साथ-साथ tRNA, rRNA, आरएनए पोलीमरेज़ सबयूनिट और [[राइबोसोमल प्रोटीन]] सबयूनिट के लिए कोडिंग के लिए जिम्मेदार हैं।<ref name=Pfalz>{{cite journal | vauthors = Pfalz J, Pfannschmidt T | title = प्रारंभिक क्लोरोप्लास्ट विकास में आवश्यक न्यूक्लियॉइड प्रोटीन| journal = Trends in Plant Science | volume = 18 | issue = 4 | pages = 186–94 | date = April 2013 | pmid = 23246438 | doi = 10.1016/j.tplants.2012.11.003 }}</ref> mtDNA की तरह, सीपीडीएनए पूरी तरह से स्वायत्त नहीं है और क्लोरोप्लास्ट प्रोटीन की प्रतिकृति और उत्पादन के लिए परमाणु जीन उत्पादों पर निर्भर करता है। क्लोरोप्लास्ट में सीपीडीएनए की कई प्रतियां होती हैं और संख्या न केवल प्रजातियों से प्रजातियों या कोशिका प्रकार से कोशिका प्रकार तक भिन्न हो सकती है, बल्कि कोशिका की आयु और विकास के चरण के आधार पर एक कोशिका के भीतर भी भिन्न हो सकती है। उदाहरण के लिए, युवा कोशिकाओं के क्लोरोप्लास्ट में सीपीडीएनए सामग्री, विकास के प्रारंभिक चरणों के दौरान, जहां क्लोरोप्लास्ट अस्पष्ट प्रोप्लास्टिड के रूप में होते हैं, उस समय उपस्थित कोशिकाओं की तुलना में बहुत अधिक होती है जब वह कोशिका परिपक्व होती है और विस्तारित होती है, जिसमें पूरी तरह से परिपक्व प्लास्टिड होते हैं।<ref name=Rowen>{{cite journal | vauthors = Rowan BA, Bendich AJ | title = The loss of DNA from chloroplasts as leaves mature: fact or artefact? | journal = Journal of Experimental Botany | volume = 60 | issue = 11 | pages = 3005–10 | year = 2009 | pmid = 19454766 | doi = 10.1093/jxb/erp158 | doi-access = free }}</ref>


=== सर्कुलर ===
=== सर्कुलर ===
{{main|एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए}}
{{main|एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए}}


एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए (ईसीसीडीएनए) सभी यूकेरियोटिक कोशिकाओं में मौजूद होते हैं, आमतौर पर जीनोमिक डीएनए से प्राप्त होते हैं, और क्रोमोसोम के कोडिंग और गैर-कोडिंग दोनों क्षेत्रों में पाए जाने वाले डीएनए के दोहराव वाले अनुक्रमों से बने होते हैं। ईसीसीडीएनए का आकार 2000 से कम बेस जोड़े से लेकर 20,000 से अधिक बेस जोड़े तक हो सकता है।<ref name="Cohen, S.2">{{cite journal | vauthors = Cohen S, Houben A, Segal D | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए पौधों में अग्रानुक्रमिक रूप से दोहराए जाने वाले जीनोमिक अनुक्रमों से प्राप्त होता है| journal = The Plant Journal | volume = 53 | issue = 6 | pages = 1027–34 | date = March 2008 | pmid = 18088310 | doi = 10.1111/j.1365-313X.2007.03394.x }}</ref> पौधों में, ईसीसीडीएनए में उन अनुक्रमों के समान बार-बार अनुक्रम होते हैं जो गुणसूत्रों के सेंट्रोमेरिक क्षेत्रों और दोहराए जाने वाले उपग्रह डीएनए में पाए जाते हैं।<ref name=Navratilova>{{cite journal | vauthors = Navrátilová A, Koblízková A, Macas J | title = प्लांट सैटेलाइट रिपीट से प्राप्त एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए का सर्वेक्षण| journal = BMC Plant Biology | volume = 8 | pages = 90 | date = August 2008 | pmid = 18721471 | pmc = 2543021 | doi = 10.1186/1471-2229-8-90 }}</ref> जानवरों में, ईसीसीडीएनए अणुओं में दोहराव वाले अनुक्रम पाए जाते हैं जो [[उपग्रह डीएनए]], [[5S राइबोसोमल डीएनए]] और टेलोमेयर डीएनए में देखे जाते हैं।<ref name="Cohen, S.2" /> कुछ जीव, जैसे कि यीस्ट, ईसीसीडीएनए का उत्पादन करने के लिए क्रोमोसोमल डीएनए प्रतिकृति पर निर्भर होते हैं<ref name=Navratilova /> जबकि ईसीसीडीएनए का गठन अन्य जीवों, जैसे स्तनधारियों, में प्रतिकृति प्रक्रिया से स्वतंत्र रूप से हो सकता है।<ref name="Cohen, Z.1">{{cite journal | vauthors = Cohen Z, Lavi S | title = स्तनधारी कोशिका-मुक्त प्रणाली में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए का प्रतिकृति स्वतंत्र गठन| journal = PLOS ONE | volume = 4 | issue = 7 | pages = e6126 | date = July 2009 | pmid = 19568438 | pmc = 2699479 | doi = 10.1371/journal.pone.0006126 | veditors = Sullivan BA | bibcode = 2009PLoSO...4.6126C | doi-access = free }}</ref> ईसीसीडीएनए के कार्य का व्यापक रूप से अध्ययन नहीं किया गया है, लेकिन यह प्रस्तावित किया गया है कि जीनोमिक डीएनए अनुक्रमों से ईसीसीडीएनए तत्वों का उत्पादन यूकेरियोटिक जीनोम की प्लास्टिसिटी को बढ़ाता है और जीनोम स्थिरता, कोशिका उम्र बढ़ने और गुणसूत्रों के विकास को प्रभावित कर सकता है।<ref name="Cohen, S3">{{cite journal | vauthors = Cohen S, Agmon N, Sobol O, Segal D | title = Extrachromosomal circles of satellite repeats and 5S ribosomal DNA in human cells | journal = Mobile DNA | volume = 1 | issue = 1 | pages = 11 | date = March 2010 | pmid = 20226008 | pmc = 3225859 | doi = 10.1186/1759-8753-1-11 }}</ref>
एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए (eccDNA) सभी यूकेरियोटिक कोशिकाओं में उपस्थित होते हैं, सामान्यतः जीनोमिक डीएनए से प्राप्त होते हैं, और क्रोमोसोम के कोडिंग और गैर-कोडिंग दोनों क्षेत्रों में पाए जाने वाले डीएनए के दोहराव वाले अनुक्रमों से बने होते हैं। eccDNA का आकार 2000 से कम बेस जोड़े से लेकर 20,000 से अधिक बेस जोड़े तक हो सकता है।<ref name="Cohen, S.2">{{cite journal | vauthors = Cohen S, Houben A, Segal D | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए पौधों में अग्रानुक्रमिक रूप से दोहराए जाने वाले जीनोमिक अनुक्रमों से प्राप्त होता है| journal = The Plant Journal | volume = 53 | issue = 6 | pages = 1027–34 | date = March 2008 | pmid = 18088310 | doi = 10.1111/j.1365-313X.2007.03394.x }}</ref> पौधों में, eccDNA में उन अनुक्रमों के समान बार-बार अनुक्रम होते हैं जो गुणसूत्रों के सेंट्रोमेरिक क्षेत्रों और दोहराए जाने वाले उपग्रह डीएनए में पाए जाते हैं।<ref name=Navratilova>{{cite journal | vauthors = Navrátilová A, Koblízková A, Macas J | title = प्लांट सैटेलाइट रिपीट से प्राप्त एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए का सर्वेक्षण| journal = BMC Plant Biology | volume = 8 | pages = 90 | date = August 2008 | pmid = 18721471 | pmc = 2543021 | doi = 10.1186/1471-2229-8-90 }}</ref> जानवरों में, eccDNA अणुओं में दोहराव वाले अनुक्रम पाए जाते हैं जो [[उपग्रह डीएनए]], [[5S राइबोसोमल डीएनए]] और टेलोमेयर डीएनए में देखे जाते हैं।<ref name="Cohen, S.2" /> कुछ जीव, जैसे कि यीस्ट, eccDNA का उत्पादन करने के लिए क्रोमोसोमल डीएनए प्रतिकृति पर निर्भर होते हैं<ref name=Navratilova /> जबकि eccDNA का गठन अन्य जीवों, जैसे स्तनधारियों, में प्रतिकृति प्रक्रिया से स्वतंत्र रूप से हो सकता है।<ref name="Cohen, Z.1">{{cite journal | vauthors = Cohen Z, Lavi S | title = स्तनधारी कोशिका-मुक्त प्रणाली में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए का प्रतिकृति स्वतंत्र गठन| journal = PLOS ONE | volume = 4 | issue = 7 | pages = e6126 | date = July 2009 | pmid = 19568438 | pmc = 2699479 | doi = 10.1371/journal.pone.0006126 | veditors = Sullivan BA | bibcode = 2009PLoSO...4.6126C | doi-access = free }}</ref> eccDNA के कार्य का व्यापक रूप से अध्ययन नहीं किया गया है, लेकिन यह प्रस्तावित किया गया है कि जीनोमिक डीएनए अनुक्रमों से eccDNA तत्वों का उत्पादन यूकेरियोटिक जीनोम की प्लास्टिसिटी को बढ़ाता है और जीनोम स्थिरता, कोशिका उम्र बढ़ने और गुणसूत्रों के विकास को प्रभावित कर सकता है।<ref name="Cohen, S3">{{cite journal | vauthors = Cohen S, Agmon N, Sobol O, Segal D | title = Extrachromosomal circles of satellite repeats and 5S ribosomal DNA in human cells | journal = Mobile DNA | volume = 1 | issue = 1 | pages = 11 | date = March 2010 | pmid = 20226008 | pmc = 3225859 | doi = 10.1186/1759-8753-1-11 }}</ref>


एक विशिष्ट प्रकार का एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए, जिसे ईसीडीएनए के रूप में जाना जाता है, आमतौर पर मानव कैंसर कोशिकाओं में देखा जाता है।<ref name=":1" /><ref name=":0" /><ref name=":3" /> कैंसर कोशिकाओं में पाए जाने वाले ईसीडीएनए में एक या एक से अधिक जीन होते हैं जो चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। ईसीडीएनए, ईसीसीडीएनए से बहुत बड़े होते हैं और प्रकाश माइक्रोस्कोपी द्वारा दृश्यमान होते हैं। कैंसर में ईसीडीएनए आम तौर पर 1-3 एमबी और उससे अधिक आकार का होता है।<ref name=":1" /> मानव कैंसर कोशिकाओं के नाभिक में बड़े ईसीडीएनए अणु पाए गए हैं और यह दिखाया गया है कि वे चालक ऑन्कोजीन की कई प्रतियां ले जाते हैं, जो ट्यूमर कोशिकाओं में स्थानांतरित हो जाते हैं। इस साक्ष्य के आधार पर यह माना जाता है कि ईसीडीएनए कैंसर के विकास में योगदान देता है।
एक विशिष्ट प्रकार का एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए, जिसे ecDNA के रूप में जाना जाता है, सामान्यतः मानव कैंसर कोशिकाओं में देखा जाता है।<ref name=":1" /><ref name=":0" /><ref name=":3" /> कैंसर कोशिकाओं में पाए जाने वाले ecDNA में एक या एक से अधिक जीन होते हैं जो चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। ecDNA, eccDNA से बहुत बड़े होते हैं और प्रकाश माइक्रोस्कोपी द्वारा दृश्यमान होते हैं। कैंसर में ecDNA सामान्यतः 1-3 एमबी और उससे अधिक आकार का होता है।<ref name=":1" /> मानव कैंसर कोशिकाओं के नाभिक में बड़े ecDNA अणु पाए गए हैं और यह दिखाया गया है कि वे चालक ऑन्कोजीन की कई प्रतियां ले जाते हैं, जो ट्यूमर कोशिकाओं में स्थानांतरित हो जाते हैं। इस साक्ष्य के आधार पर यह माना जाता है कि ecDNA कैंसर के विकास में योगदान देता है।


विशिष्ट उपकरण मौजूद हैं जो ईसीडीएनए की पहचान करने की अनुमति देते हैं, जैसे
विशिष्ट उपकरण उपस्थित हैं जो ecDNA की पहचान करने की अनुमति देते हैं, जैसे


* [[पॉल मिशेल]] और [[विनीत बाफना]] द्वारा विकसित सॉफ्टवेयर जो सूक्ष्म छवियों में ईसीडीएनए को पहचानने की अनुमति देता है।
* [[पॉल मिशेल]] और [[विनीत बाफना]] द्वारा विकसित सॉफ्टवेयर जो सूक्ष्म छवियों में ecDNA को पहचानने की अनुमति देता है।
* "सर्कल-सेक, कोशिकाओं से ईसीडीएनए को भौतिक रूप से अलग करने, एंजाइमों के साथ किसी भी शेष रैखिक डीएनए को हटाने और जो गोलाकार डीएनए रहता है उसे अनुक्रमित करने की एक विधि", कोपेनहेगन विश्वविद्यालय में बिरगिट रेगेनबर्ग और उनकी टीम द्वारा विकसित की गई।<ref>{{Cite web|url=https://cen.acs.org/pharmaceuticals/oncology/curious-DNA-circles-make-treating/98/i40|access-date=2021-10-02|website=cen.acs.org}}</ref>
* "सर्कल-सेक, कोशिकाओं से ecDNA को भौतिक रूप से अलग करने, एंजाइमों के साथ किसी भी शेष रैखिक डीएनए को हटाने और जो गोलाकार डीएनए रहता है उसे अनुक्रमित करने की एक विधि", कोपेनहेगन विश्वविद्यालय में बिरगिट रेगेनबर्ग और उनकी टीम द्वारा विकसित की गई।<ref>{{Cite web|url=https://cen.acs.org/pharmaceuticals/oncology/curious-DNA-circles-make-treating/98/i40|access-date=2021-10-02|website=cen.acs.org}}</ref>




== वायरल ==
== वायरल ==
वायरल डीएनए एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का उदाहरण है। वायरस के विकास और उत्परिवर्तन को समझने के लिए वायरल जीनोम को समझना बहुत महत्वपूर्ण है।<ref>{{cite journal | vauthors = Sanjuán R, Nebot MR, Chirico N, Mansky LM, Belshaw R | title = वायरल उत्परिवर्तन दर| journal = Journal of Virology | volume = 84 | issue = 19 | pages = 9733–48 | date = October 2010 | pmid = 20660197 | pmc = 2937809 | doi = 10.1128/JVI.00694-10 }}</ref> कुछ वायरस, जैसे कि एचआईवी और ऑन्कोजेनिक वायरस, अपने स्वयं के डीएनए को मेजबान कोशिका के जीनोम में शामिल करते हैं।<ref name=Silverthorn>{{cite book|last=Silverthorn|first=Dee Unglaub| name-list-style = vanc |title=मानव मनोविज्ञान|year=2007|publisher=Peason/Benjamin Cummings}}</ref> वायरल जीनोम सिंगल स्ट्रैंडेड डीएनए (एसएसडीएनए), डबल स्ट्रैंडेड डीएनए (डीएसडीएनए) से बना हो सकता है और रैखिक और गोलाकार दोनों रूपों में पाया जा सकता है।<ref>{{cite web|title=वायरल जीनोम|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/GenomesHome.cgi}}</ref>
वायरल डीएनए एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का उदाहरण है। वायरस के विकास और उत्परिवर्तन को समझने के लिए वायरल जीनोम को समझना बहुत महत्वपूर्ण है।<ref>{{cite journal | vauthors = Sanjuán R, Nebot MR, Chirico N, Mansky LM, Belshaw R | title = वायरल उत्परिवर्तन दर| journal = Journal of Virology | volume = 84 | issue = 19 | pages = 9733–48 | date = October 2010 | pmid = 20660197 | pmc = 2937809 | doi = 10.1128/JVI.00694-10 }}</ref> कुछ वायरस, जैसे कि एचआईवी और ऑन्कोजेनिक वायरस, अपने स्वयं के डीएनए को मेजबान कोशिका के जीनोम में सम्मिलित करते हैं।<ref name=Silverthorn>{{cite book|last=Silverthorn|first=Dee Unglaub| name-list-style = vanc |title=मानव मनोविज्ञान|year=2007|publisher=Peason/Benjamin Cummings}}</ref> वायरल जीनोम सिंगल स्ट्रैंडेड डीएनए (एसएसडीएनए), डबल स्ट्रैंडेड डीएनए (डीएसडीएनए) से बना हो सकता है और रैखिक और गोलाकार दोनों रूपों में पाया जा सकता है।<ref>{{cite web|title=वायरल जीनोम|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/GenomesHome.cgi}}</ref>


एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के रूप में गठित वायरस के संक्रमण का एक उदाहरण ह्यूमन पेपिलोमावायरस ([[एचपीवी]]) है। एचपीवी डीएनए जीनोम प्रतिकृति के तीन अलग-अलग चरणों से होकर गुजरता है: स्थापना, रखरखाव और प्रवर्धन। एचपीवी एनोजिनिटल ट्रैक्ट और मौखिक गुहा में उपकला कोशिकाओं को संक्रमित करता है। आम तौर पर, एचपीवी का पता लगाया जाता है और प्रतिरक्षा प्रणाली द्वारा उसे ख़त्म कर दिया जाता है। वायरल डीएनए की पहचान प्रतिरक्षा प्रतिक्रियाओं का एक महत्वपूर्ण भाग है। इस वायरस के बने रहने के लिए, कोशिका विभाजन के दौरान वृत्ताकार जीनोम को दोहराया जाना चाहिए और विरासत में मिला होना चाहिए।<ref name="Lorenz">{{cite journal | vauthors = Lorenz LD, Rivera Cardona J, Lambert PF | title = Inactivation of p53 rescues the maintenance of high risk HPV DNA genomes deficient in expression of E6 | journal = PLOS Pathogens | volume = 9 | issue = 10 | pages = e1003717 | date = October 2013 | pmid = 24204267 | pmc = 3812038 | doi = 10.1371/journal.ppat.1003717 | veditors = Roman A }}</ref>
एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के रूप में गठित वायरस के संक्रमण का एक उदाहरण ह्यूमन पेपिलोमावायरस ([[एचपीवी]]) है। एचपीवी डीएनए जीनोम प्रतिकृति के तीन अलग-अलग चरणों से होकर गुजरता है: स्थापना, रखरखाव और प्रवर्धन। एचपीवी एनोजिनिटल ट्रैक्ट और मौखिक गुहा में उपकला कोशिकाओं को संक्रमित करता है। सामान्यतः, एचपीवी का पता लगाया जाता है और प्रतिरक्षा प्रणाली द्वारा उसे ख़त्म कर दिया जाता है। वायरल डीएनए की पहचान प्रतिरक्षा प्रतिक्रियाओं का एक महत्वपूर्ण भाग है। इस वायरस के बने रहने के लिए, कोशिका विभाजन के दौरान वृत्ताकार जीनोम को दोहराया जाना चाहिए और वंशानुक्रम में मिला होना चाहिए।<ref name="Lorenz">{{cite journal | vauthors = Lorenz LD, Rivera Cardona J, Lambert PF | title = Inactivation of p53 rescues the maintenance of high risk HPV DNA genomes deficient in expression of E6 | journal = PLOS Pathogens | volume = 9 | issue = 10 | pages = e1003717 | date = October 2013 | pmid = 24204267 | pmc = 3812038 | doi = 10.1371/journal.ppat.1003717 | veditors = Roman A }}</ref>


=== मेजबान कोशिका द्वारा अनुभूति ===
=== मेजबान कोशिका द्वारा अनुभूति ===
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कोशिकाएँ विदेशी साइटोप्लास्मिक डीएनए को पहचान सकती हैं। पहचान के मार्गों को समझने से रोगों की रोकथाम और उपचार पर प्रभाव पड़ता है।<ref name=Barber_2011Sep>{{cite journal | vauthors = Barber GN | title = साइटोप्लाज्मिक डीएनए जन्मजात प्रतिरक्षा मार्ग| journal = Immunological Reviews | volume = 243 | issue = 1 | pages = 99–108 | date = September 2011 | pmid = 21884170 | doi = 10.1111/j.1600-065X.2011.01051.x | s2cid = 205826027 }</ref> कोशिकाओं में सेंसर होते हैं जो विशेष रूप से वायरल डीएनए जैसे टोल-लाइक रिसेप्टर (टीएलआर) मार्ग को पहचान सकते हैं।<ref name=Barber_2011Feb>{{cite journal | vauthors = Barber GN | title = सहज प्रतिरक्षा डीएनए संवेदन मार्ग: STING, AIMII और इंटरफेरॉन उत्पादन और भड़काऊ प्रतिक्रियाओं का विनियमन| journal = Current Opinion in Immunology | volume = 23 | issue = 1 | pages = 10–20 | date = February 2011 | pmid = 21239155 | pmc = 3881186 | doi = 10.1016/j.coi.2010.12.015 }}</ref>
कोशिकाएँ विदेशी साइटोप्लास्मिक डीएनए को पहचान सकती हैं। पहचान के मार्गों को समझने से रोगों की रोकथाम और उपचार पर प्रभाव पड़ता है।<ref name=Barber_2011Sep>{{cite journal | vauthors = Barber GN | title = साइटोप्लाज्मिक डीएनए जन्मजात प्रतिरक्षा मार्ग| journal = Immunological Reviews | volume = 243 | issue = 1 | pages = 99–108 | date = September 2011 | pmid = 21884170 | doi = 10.1111/j.1600-065X.2011.01051.x | s2cid = 205826027 }</ref> कोशिकाओं में सेंसर होते हैं जो विशेष रूप से वायरल डीएनए जैसे टोल-लाइक रिसेप्टर (टीएलआर) मार्ग को पहचान सकते हैं।<ref name=Barber_2011Feb>{{cite journal | vauthors = Barber GN | title = सहज प्रतिरक्षा डीएनए संवेदन मार्ग: STING, AIMII और इंटरफेरॉन उत्पादन और भड़काऊ प्रतिक्रियाओं का विनियमन| journal = Current Opinion in Immunology | volume = 23 | issue = 1 | pages = 10–20 | date = February 2011 | pmid = 21239155 | pmc = 3881186 | doi = 10.1016/j.coi.2010.12.015 }}</ref>


टोल पाथवे को, सबसे पहले कीड़ों में, एक ऐसे मार्ग के रूप में मान्यता दी गई थी जो कुछ प्रकार की कोशिकाओं को विभिन्न प्रकार के बैक्टीरिया या वायरल जीनोम और पीएमपीएस ([[रोगज़नक़ से जुड़े आणविक पैटर्न]]) का पता लगाने में सक्षम सेंसर के रूप में कार्य करने की अनुमति देता है। पीएएमपी को जन्मजात प्रतिरक्षा सिग्नलिंग के शक्तिशाली सक्रियकर्ता के रूप में जाना जाता है। लगभग 10 मानव टोल-लाइक रिसेप्टर्स (टीएलआर) हैं। मनुष्यों में अलग-अलग टीएलआर अलग-अलग पीएएमपीएस का पता लगाते हैं: टीएलआर4 द्वारा लिपोपॉलीसेकेराइड, टीएलआर3 द्वारा वायरल डीएसआरएनए, टीएलआर7/टीएलआर8 द्वारा वायरल एसएसआरएनए, टीएलआर9 द्वारा वायरल या बैक्टीरियल अनमिथाइलेटेड डीएनए। टीएलआर9 आमतौर पर बैक्टीरिया और वायरस में पाए जाने वाले [[सीपीजी साइट|सीपीजी]] डीएनए का पता लगाने और आईएफएन (प्रकार I इंटरफेरॉन) और अन्य [[साइटोकिन्स]] का उत्पादन शुरू करने के लिए विकसित हुआ है।<ref name=Barber_2011Feb />
टोल पाथवे को, सबसे पहले कीड़ों में, एक ऐसे मार्ग के रूप में मान्यता दी गई थी जो कुछ प्रकार की कोशिकाओं को विभिन्न प्रकार के बैक्टीरिया या वायरल जीनोम और पीएमपीएस ([[रोगज़नक़ से जुड़े आणविक पैटर्न]]) का पता लगाने में सक्षम सेंसर के रूप में कार्य करने की अनुमति देता है। पीएएमपी को जन्मजात प्रतिरक्षा सिग्नलिंग के शक्तिशाली सक्रियकर्ता के रूप में जाना जाता है। लगभग 10 मानव टोल-लाइक रिसेप्टर्स (टीएलआर) हैं। मनुष्यों में अलग-अलग टीएलआर अलग-अलग पीएएमपीएस का पता लगाते हैं: टीएलआर4 द्वारा लिपोपॉलीसेकेराइड, टीएलआर3 द्वारा वायरल डीएसआरएनए, टीएलआर7/टीएलआर8 द्वारा वायरल एसएसआरएनए, टीएलआर9 द्वारा वायरल या बैक्टीरियल अनमिथाइलेटेड डीएनए। टीएलआर9 सामान्यतः बैक्टीरिया और वायरस में पाए जाने वाले [[सीपीजी साइट|सीपीजी]] डीएनए का पता लगाने और आईएफएन (प्रकार I इंटरफेरॉन) और अन्य [[साइटोकिन्स]] का उत्पादन प्रारम्भ करने के लिए विकसित हुआ है।<ref name=Barber_2011Feb />


== वंशानुक्रम ==
== वंशानुक्रम ==
[[File:Mitochondrial.svg|thumb|300px|मनुष्यों में माइटोकॉन्ड्रियल वंशानुक्रम: एमटीडीएनए और इसके उत्परिवर्तन मातृ संचरित होते हैं।]]एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का वंशानुक्रम गुणसूत्रों में पाए जाने वाले परमाणु डीएनए के वंशानुक्रम से भिन्न होता है। क्रोमोसोम के विपरीत, [[ ecDNA |ईसीडीएनए]] में सेंट्रोमियर नहीं होते हैं और इसलिए यह एक गैर-मेंडेलियन वंशानुक्रम पैटर्न प्रदर्शित करता है जो विषम कोशिका आबादी को जन्म देता है। मनुष्यों में, वस्तुतः संपूर्ण कोशिकाद्रव्य माँ के अंडे से विरासत में मिलता है।<ref name="Griffiths NCBI">{{cite book| vauthors = Griffiths AJ |title=आनुवंशिक विश्लेषण का एक परिचय|year=2000|publisher=W.H.Freeman|location=New York|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22059/}}</ref> इस कारण से, एमटीडीएनए समेत ऑर्गेनेल डीएनए मां से विरासत में मिला है। एमटीडीएनए या अन्य साइटोप्लाज्मिक डीएनए में उत्परिवर्तन भी मां से विरासत में मिलेगा। यह एकतरफा विरासत गैर-मेंडेलियन विरासत का एक उदाहरण है। पौधे एकपक्षीय एमटीडीएनए वंशानुक्रम भी दर्शाते हैं। अधिकांश पौधों को एमटीडीएनए मातृ रूप से विरासत में मिलता है, जिसमें एक उल्लेखनीय अपवाद रेडवुड सिकोइया सेपरविरेन्स है जो एमटीडीएनए पैतृक रूप से विरासत में मिलता है।<ref name=Sato>{{cite journal | vauthors = Sato M, Sato K | title = पैतृक माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए को खत्म करने के लिए विभिन्न तंत्रों द्वारा माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए की मातृ विरासत| journal = Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research | volume = 1833 | issue = 8 | pages = 1979–84 | date = August 2013 | pmid = 23524114 | doi = 10.1016/j.bbamcr.2013.03.010 | doi-access = free }}</ref>
[[File:Mitochondrial.svg|thumb|300px|मनुष्यों में माइटोकॉन्ड्रियल वंशानुक्रम: mtDNA और इसके उत्परिवर्तन मातृ संचरित होते हैं।]]एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का वंशानुक्रम गुणसूत्रों में पाए जाने वाले परमाणु डीएनए के वंशानुक्रम से भिन्न होता है। क्रोमोसोम के विपरीत, [[ ecDNA |ecDNA]] में सेंट्रोमियर नहीं होते हैं और इसलिए यह एक गैर-मेंडेलियन वंशानुक्रम पैटर्न प्रदर्शित करता है जो विषम कोशिका आबादी को जन्म देता है। मनुष्यों में, वस्तुतः संपूर्ण कोशिकाद्रव्य माँ के अंडे से वंशानुक्रम में मिलता है।<ref name="Griffiths NCBI">{{cite book| vauthors = Griffiths AJ |title=आनुवंशिक विश्लेषण का एक परिचय|year=2000|publisher=W.H.Freeman|location=New York|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22059/}}</ref> इस कारण से, mtDNA समेत ऑर्गेनेल डीएनए मां से वंशानुक्रम में मिला है। mtDNA या अन्य साइटोप्लाज्मिक डीएनए में उत्परिवर्तन भी मां से वंशानुक्रम में मिलेगा। यह एकतरफा वंशानुक्रम गैर-मेंडेलियन वंशानुक्रम का एक उदाहरण है। पौधे एकपक्षीय mtDNA वंशानुक्रम भी दर्शाते हैं। अधिकांश पौधों को mtDNA मातृ रूप से वंशानुक्रम में मिलता है, जिसमें एक उल्लेखनीय अपवाद रेडवुड सिकोइया सेपरविरेन्स है जो mtDNA पैतृक रूप से वंशानुक्रम में मिलता है।<ref name=Sato>{{cite journal | vauthors = Sato M, Sato K | title = पैतृक माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए को खत्म करने के लिए विभिन्न तंत्रों द्वारा माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए की मातृ विरासत| journal = Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research | volume = 1833 | issue = 8 | pages = 1979–84 | date = August 2013 | pmid = 23524114 | doi = 10.1016/j.bbamcr.2013.03.010 | doi-access = free }}</ref>


ऐसे दो सिद्धांत हैं कि क्यों पैतृक एमटीडीएनए शायद ही कभी संतानों में प्रसारित होता है। एक तो बस यह तथ्य है कि पैतृक एमटीडीएनए मातृ एमटीडीएनए की तुलना में इतनी कम सांद्रता पर है और इस प्रकार संतानों में इसका पता नहीं लगाया जा सकता है। दूसरा, अधिक जटिल सिद्धांत, वंशानुक्रम को रोकने के लिए पैतृक एमटीडीएनए का पाचन शामिल है। यह सिद्धांत दिया गया है कि एमटीडीएनए की एकतरफा विरासत, जिसमें उच्च उत्परिवर्तन दर है, साइटोप्लाज्मिक डीएनए की होमोप्लाज्मी को बनाए रखने के लिए एक तंत्र हो सकती है।<ref name=Sato />
ऐसे दो सिद्धांत हैं कि क्यों पैतृक mtDNA शायद ही कभी संतानों में प्रसारित होता है। एक तो बस यह तथ्य है कि पैतृक mtDNA मातृ mtDNA की तुलना में इतनी कम सांद्रता पर है और इस प्रकार संतानों में इसका पता नहीं लगाया जा सकता है। दूसरा, अधिक जटिल सिद्धांत, वंशानुक्रम को रोकने के लिए पैतृक mtDNA का पाचन सम्मिलित है। यह सिद्धांत दिया गया है कि mtDNA की एकतरफा वंशानुक्रम, जिसमें उच्च उत्परिवर्तन दर है, साइटोप्लाज्मिक डीएनए की होमोप्लाज्मी को बनाए रखने के लिए एक तंत्र हो सकती है।<ref name=Sato />


== चिकित्सीय महत्व ==
== चिकित्सीय महत्व ==


कभी-कभी ईई कहा जाता है, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल तत्व, यूकेरियोट्स में [[जीनोमिक अस्थिरता]] से जुड़े हुए हैं। छोटे पॉलीडिस्पर्ड डीएनए (एसपीसीडीएनए), एक प्रकार का ईसीसीडीएनए, आमतौर पर जीनोम अस्थिरता के साथ पाए जाते हैं। एसपीसीडीएनए उपग्रह डीएनए, रेट्रोवायरस जैसे डीएनए तत्वों और जीनोम में ट्रांसपोज़ेबल तत्वों जैसे दोहराव अनुक्रमों से प्राप्त होते हैं। ऐसा माना जाता है कि ये जीन पुनर्व्यवस्था के उत्पाद हैं।
कभी-कभी ईई कहा जाता है, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल तत्व, यूकेरियोट्स में [[जीनोमिक अस्थिरता]] से जुड़े हुए हैं। छोटे पॉलीडिस्पर्ड डीएनए (एसपीसीडीएनए), एक प्रकार का eccDNA, सामान्यतः जीनोम अस्थिरता के साथ पाए जाते हैं। एसपीसीडीएनए उपग्रह डीएनए, रेट्रोवायरस जैसे डीएनए तत्वों और जीनोम में ट्रांसपोज़ेबल तत्वों जैसे दोहराव अनुक्रमों से प्राप्त होते हैं। ऐसा माना जाता है कि ये जीन पुनर्व्यवस्था के उत्पाद हैं।


कैंसर में पाए जाने वाले एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (ईसीडीएनए) को ऐतिहासिक रूप से [[डबल मिनट]] क्रोमोसोम (डीएम) के रूप में जाना जाता है, जो प्रकाश माइक्रोस्कोपी के तहत युग्मित क्रोमैटिन निकायों के रूप में मौजूद होते हैं। डबल मिनट क्रोमोसोम एकल निकायों सहित ईसीडीएनए के ~30% कैंसर युक्त स्पेक्ट्रम का प्रतिनिधित्व करते हैं और इसमें एकल निकायों के समान जीन सामग्री पाई गई है।<ref name=":0" /> ईसीडीएनए संकेतन कैंसर कोशिकाओं में पाए जाने वाले बड़े, ऑन्कोजीन युक्त, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के सभी रूपों को शामिल करता है। इस प्रकार का ईसीडीएनए आमतौर पर विभिन्न हिस्टोलॉजी की कैंसर कोशिकाओं में देखा जाता है, लेकिन सामान्य कोशिकाओं में लगभग कभी नहीं देखा जाता है।<ref name=":0" /> ऐसा माना जाता है कि ईसीडीएनए गुणसूत्रों में डबल-स्ट्रैंड टूटने या किसी जीव में डीएनए की अत्यधिक प्रतिकृति के माध्यम से उत्पन्न होता है। अध्ययनों से पता चलता है कि कैंसर और अन्य जीनोमिक अस्थिरता के मामलों में, ईई के उच्च स्तर देखे जा सकते हैं।<ref name="Kuttler" />
कैंसर में पाए जाने वाले एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (ecDNA) को ऐतिहासिक रूप से [[डबल मिनट]] क्रोमोसोम (डीएम) के रूप में जाना जाता है, जो प्रकाश माइक्रोस्कोपी के तहत युग्मित क्रोमैटिन निकायों के रूप में उपस्थित होते हैं। डबल मिनट क्रोमोसोम एकल निकायों सहित ecDNA के ~30% कैंसर युक्त स्पेक्ट्रम का प्रतिनिधित्व करते हैं और इसमें एकल निकायों के समान जीन सामग्री पाई गई है।<ref name=":0" /> ecDNA संकेतन कैंसर कोशिकाओं में पाए जाने वाले बड़े, ऑन्कोजीन युक्त, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के सभी रूपों को सम्मिलित करता है। इस प्रकार का ecDNA सामान्यतः विभिन्न हिस्टोलॉजी की कैंसर कोशिकाओं में देखा जाता है, लेकिन सामान्य कोशिकाओं में लगभग कभी नहीं देखा जाता है।<ref name=":0" /> ऐसा माना जाता है कि ecDNA गुणसूत्रों में डबल-स्ट्रैंड टूटने या किसी जीव में डीएनए की अत्यधिक प्रतिकृति के माध्यम से उत्पन्न होता है। अध्ययनों से पता चलता है कि कैंसर और अन्य जीनोमिक अस्थिरता के स्थितियों में, ईई के उच्च स्तर देखे जा सकते हैं।<ref name="Kuttler" />


माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए विभिन्न तरीकों से बीमारी की शुरुआत में भूमिका निभा सकता है। एमटीडीएनए में या वैकल्पिक [[जीन व्यवस्था]] में बिंदु उत्परिवर्तन कई बीमारियों से जुड़ा हुआ है जो हृदय, [[केंद्रीय तंत्रिका तंत्र]], अंतःस्रावी तंत्र, जठरांत्र संबंधी मार्ग, आंख और गुर्दे को प्रभावित करते हैं।<ref name=Chinnery /> माइटोकॉन्ड्रिया में मौजूद एमटीडीएनए की मात्रा के नुकसान से माइटोकॉन्ड्रियल डिप्लेशन सिंड्रोम (एमडीडी) नामक बीमारियों का एक पूरा उपसमूह हो सकता है, जो मनुष्यों में यकृत, केंद्रीय और परिधीय तंत्रिका तंत्र, चिकनी मांसपेशियों और श्रवण को प्रभावित करता है।<ref name=Dimmock /> ऐसे अध्ययनों में मिश्रित और कभी-कभी परस्पर विरोधी परिणाम सामने आए हैं, जो एमटीडीएनए कॉपी संख्या को कुछ कैंसर के विकास के जोखिम से जोड़ने का प्रयास करते हैं। अध्ययन किए गए हैं जो बढ़े हुए और घटे हुए एमटीडीएनए स्तरों और स्तन कैंसर के विकास के बढ़ते जोखिम के बीच संबंध दिखाते हैं। बढ़े हुए एमटीडीएनए स्तर और गुर्दे के ट्यूमर के विकास के बढ़ते जोखिम के बीच एक सकारात्मक संबंध देखा गया है, लेकिन एमटीडीएनए स्तर और पेट के कैंसर के विकास के बीच कोई संबंध नहीं दिखता है।<ref name=Thyagarajan>{{cite journal | vauthors = Thyagarajan B, Wang R, Nelson H, Barcelo H, Koh WP, Yuan JM | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए कॉपी नंबर स्तन कैंसर के खतरे से जुड़ा है| journal = PLOS ONE | volume = 8 | issue = 6 | pages = e65968 | date = June 2013 | pmid = 23776581 | pmc = 3680391 | doi = 10.1371/journal.pone.0065968 | veditors = Bai Y | bibcode = 2013PLoSO...865968T | doi-access = free }}</ref>
माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए विभिन्न तरीकों से बीमारी की प्रारम्भ में भूमिका निभा सकता है। mtDNA में या वैकल्पिक [[जीन व्यवस्था]] में बिंदु उत्परिवर्तन कई बीमारियों से जुड़ा हुआ है जो हृदय, [[केंद्रीय तंत्रिका तंत्र]], अंतःस्रावी तंत्र, जठरांत्र संबंधी मार्ग, आंख और गुर्दे को प्रभावित करते हैं।<ref name=Chinnery /> माइटोकॉन्ड्रिया में उपस्थित mtDNA की मात्रा के नुकसान से माइटोकॉन्ड्रियल डिप्लेशन सिंड्रोम (एमडीडी) नामक बीमारियों का एक पूरा उपसमूह हो सकता है, जो मनुष्यों में यकृत, केंद्रीय और परिधीय तंत्रिका तंत्र, चिकनी मांसपेशियों और श्रवण को प्रभावित करता है।<ref name=Dimmock /> ऐसे अध्ययनों में मिश्रित और कभी-कभी परस्पर विरोधी परिणाम सामने आए हैं, जो mtDNA कॉपी संख्या को कुछ कैंसर के विकास के जोखिम से जोड़ने का प्रयास करते हैं। अध्ययन किए गए हैं जो बढ़े हुए और घटे हुए mtDNA स्तरों और स्तन कैंसर के विकास के बढ़ते जोखिम के बीच संबंध दिखाते हैं। बढ़े हुए mtDNA स्तर और गुर्दे के ट्यूमर के विकास के बढ़ते जोखिम के बीच एक सकारात्मक संबंध देखा गया है, लेकिन mtDNA स्तर और पेट के कैंसर के विकास के बीच कोई संबंध नहीं दिखता है।<ref name=Thyagarajan>{{cite journal | vauthors = Thyagarajan B, Wang R, Nelson H, Barcelo H, Koh WP, Yuan JM | title = माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए कॉपी नंबर स्तन कैंसर के खतरे से जुड़ा है| journal = PLOS ONE | volume = 8 | issue = 6 | pages = e65968 | date = June 2013 | pmid = 23776581 | pmc = 3680391 | doi = 10.1371/journal.pone.0065968 | veditors = Bai Y | bibcode = 2013PLoSO...865968T | doi-access = free }}</ref>


एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए एपिकॉम्प्लेक्सा में पाया जाता है, जो [[प्रोटोजोआ]] का एक समूह है। [[मलेरिया]] परजीवी (जीनस प्लाज़मोडियम), एड्स से संबंधित रोगज़नक़ ([[टैक्सोप्लाज्मा]] और क्रिप्टोस्पोरिडियम) दोनों एपिकॉम्प्लेक्सा समूह के सदस्य हैं। मलेरिया परजीवी में माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (एमटीडीएनए) पाया गया।<ref name="Wilson">{{cite journal | vauthors = Wilson RJ, Williamson DH | title = Apicomplexa में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए| journal = Microbiology and Molecular Biology Reviews | volume = 61 | issue = 1 | pages = 1–16 | date = March 1997 | doi = 10.1128/mmbr.61.1.1-16.1997 | pmid = 9106361 | pmc = 232597 }}</ref> मलेरिया परजीवियों में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के दो रूप पाए जाते हैं। इनमें से एक 6-केबी रैखिक डीएनए है और दूसरा 35-केबी गोलाकार डीएनए है। इन डीएनए अणुओं पर एंटीबायोटिक दवाओं के लिए संभावित [[न्यूक्लियोटाइड]] लक्ष्य साइटों के रूप में शोध किया गया है।<ref>{{cite journal | vauthors = Creasey A, Mendis K, Carlton J, Williamson D, Wilson I, Carter R | title = मलेरिया परजीवियों में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए की मातृ विरासत| journal = Molecular and Biochemical Parasitology | volume = 65 | issue = 1 | pages = 95–8 | date = May 1994 | pmid = 7935632 | doi = 10.1016/0166-6851(94)90118-X }}</ref>
एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए एपिकॉम्प्लेक्सा में पाया जाता है, जो [[प्रोटोजोआ]] का एक समूह है। [[मलेरिया]] परजीवी (जीनस प्लाज़मोडियम), एड्स से संबंधित रोगज़नक़ ([[टैक्सोप्लाज्मा]] और क्रिप्टोस्पोरिडियम) दोनों एपिकॉम्प्लेक्सा समूह के सदस्य हैं। मलेरिया परजीवी में माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (mtDNA) पाया गया।<ref name="Wilson">{{cite journal | vauthors = Wilson RJ, Williamson DH | title = Apicomplexa में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए| journal = Microbiology and Molecular Biology Reviews | volume = 61 | issue = 1 | pages = 1–16 | date = March 1997 | doi = 10.1128/mmbr.61.1.1-16.1997 | pmid = 9106361 | pmc = 232597 }}</ref> मलेरिया परजीवियों में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के दो रूप पाए जाते हैं। इनमें से एक 6-केबी रैखिक डीएनए है और दूसरा 35-केबी गोलाकार डीएनए है। इन डीएनए अणुओं पर एंटीबायोटिक दवाओं के लिए संभावित [[न्यूक्लियोटाइड]] लक्ष्य साइटों के रूप में शोध किया गया है।<ref>{{cite journal | vauthors = Creasey A, Mendis K, Carlton J, Williamson D, Wilson I, Carter R | title = मलेरिया परजीवियों में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए की मातृ विरासत| journal = Molecular and Biochemical Parasitology | volume = 65 | issue = 1 | pages = 95–8 | date = May 1994 | pmid = 7935632 | doi = 10.1016/0166-6851(94)90118-X }}</ref>


== कैंसर में ईसीडीएनए की भूमिका ==
== कैंसर में ecDNA की भूमिका ==
जीन प्रवर्धन ऑन्कोजीन सक्रियण के सबसे सामान्य तंत्रों में से एक है। कैंसर में जीन प्रवर्धन अक्सर एक्स्ट्राक्रोमोसोमल, वृत्ताकार तत्वों पर होता है।<ref>{{cite journal | vauthors = Kim H, Nguyen NP, Turner K, Wu S, Gujar AD, Luebeck J, Liu J, Deshpande V, Rajkumar U, Namburi S, Amin SB, Yi E, Menghi F, Schulte JH, Henssen AG, Chang HY, Beck CR, Mischel PS, Bafna V, Verhaak RG | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए ऑन्कोजीन प्रवर्धन और कई कैंसर में खराब परिणाम से जुड़ा है| journal = Nature Genetics| volume = 52 | issue = 8 | pages = 891–897 | date = August 2020| pmid = 32807987| pmc = 7484012 | doi =  10.1038/s41588-020-0678-2 }}</ref><ref name=":3" /> कैंसर में ईसीडीएनए का एक प्राथमिक कार्य ट्यूमर को तेजी से उच्च प्रतिलिपि संख्या तक पहुंचने में सक्षम बनाना है, साथ ही तेजी से, बड़े पैमाने पर सेल-टू-सेल आनुवंशिक विविधता को बढ़ावा देना है।<ref name=":0" /><ref name=":2" /> कैंसर में सबसे आम तौर पर प्रवर्धित ऑन्कोजीन ईसीडीएनए पर पाए जाते हैं और इन्हें अत्यधिक गतिशील दिखाया गया है, जो गैर-देशी गुणसूत्रों में सजातीय धुंधला क्षेत्रों के रूप में फिर से एकीकृत (एचएसआर)<ref>{{cite journal | vauthors = Storlazzi CT, Lonoce A, Guastadisegni MC, Trombetta D, D'Addabbo P, Daniele G, L'Abbate A, Macchia G, Surace C, Kok K, Ullmann R, Purgato S, Palumbo O, Carella M, Ambros PF, Rocchi M | display-authors = 6 | title = Gene amplification as double minutes or homogeneously staining regions in solid tumors: origin and structure | journal = Genome Research | volume = 20 | issue = 9 | pages = 1198–206 | date = September 2010 | pmid = 20631050 | pmc = 2928498 | doi = 10.1101/gr.106252.110 }}</ref><ref name=":02">{{cite journal | vauthors = Turner KM, Deshpande V, Beyter D, Koga T, Rusert J, Lee C, Li B, Arden K, Ren B, Nathanson DA, Kornblum HI, Taylor MD, Kaushal S, Cavenee WK, Wechsler-Reya R, Furnari FB, Vandenberg SR, Rao PN, Wahl GM, Bafna V, Mischel PS | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल ऑन्कोजीन प्रवर्धन ट्यूमर के विकास और आनुवंशिक विषमता को संचालित करता है| journal = Nature | volume = 543 | issue = 7643 | pages = 122–125 | date = March 2017 | pmid = 28178237 | pmc = 5334176 | doi = 10.1038/nature21356 | bibcode = 2017Natur.543..122T }}</ref> और विभिन्न दवा उपचारों के जवाब में कॉपी संख्या और संरचना में परिवर्तन है।<ref>{{cite journal | vauthors = Von Hoff DD, McGill JR, Forseth BJ, Davidson KK, Bradley TP, Van Devanter DR, Wahl GM | title = मानव ट्यूमर कोशिकाओं से एक्स्ट्राक्रोमोसोमली प्रवर्धित MYC जीन का उन्मूलन उनकी ट्यूमरजन्यता को कम करता है| journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 89 | issue = 17 | pages = 8165–9 | date = September 1992 | pmid = 1518843 | pmc = 49877 | doi = 10.1073/pnas.89.17.8165 | bibcode = 1992PNAS...89.8165V | doi-access = free }}</ref><ref name="Targeted therapy resistance mediate"/><ref>{{cite journal | vauthors = Xu K, Ding L, Chang TC, Shao Y, Chiang J, Mulder H, Wang S, Shaw TI, Wen J, Hover L, McLeod C, Wang YD, Easton J, Rusch M, Dalton J, Downing JR, Ellison DW, Zhang J, Baker SJ, Wu G | display-authors = 6 | title = ब्रेन ट्यूमर के निदान और पुनरावर्तन में दोहरे मिनट की संरचना और विकास| journal = Acta Neuropathologica | volume = 137 | issue = 1 | pages = 123–137 | date = January 2019 | pmid = 30267146 | pmc = 6338707 | doi = 10.1007/s00401-018-1912-1 }}</ref> ईसीडीएनए बड़ी संख्या में अधिक उन्नत और सबसे गंभीर कैंसरों के साथ-साथ कैंसर-रोधी दवाओं के प्रतिरोध के लिए जिम्मेदार है।<ref>{{cite journal | vauthors = Wu S, Turner KM, Nguyen N, Raviram R, Erb M, Santini J, Luebeck J, Rajkumar U, Diao Y, Li B, Zhang W, Jameson N, Corces MR, Granja JM, Chen X, Coruh C, Abnousi A, Houston J, Ye Z, Hu R, Yu M, Kim H, Law JA, Verhaak RG, Hu M, Furnari FB, Chang HY, Ren B, Bafna V, Mischel PS | display-authors = 6 | title = परिपत्र ईसीडीएनए सुलभ क्रोमैटिन और उच्च ऑन्कोजीन अभिव्यक्ति को बढ़ावा देता है| journal = Nature | volume = 575 | issue = 7784 | pages = 699–703 | date = November 2019 | pmid = 31748743 | pmc = 7094777 | doi = 10.1038/s41586-019-1763-5 | bibcode = 2019Natur.575..699W }}</ref>
जीन प्रवर्धन ऑन्कोजीन सक्रियण के सबसे सामान्य तंत्रों में से एक है। कैंसर में जीन प्रवर्धन प्रायः एक्स्ट्राक्रोमोसोमल, वृत्ताकार तत्वों पर होता है।<ref>{{cite journal | vauthors = Kim H, Nguyen NP, Turner K, Wu S, Gujar AD, Luebeck J, Liu J, Deshpande V, Rajkumar U, Namburi S, Amin SB, Yi E, Menghi F, Schulte JH, Henssen AG, Chang HY, Beck CR, Mischel PS, Bafna V, Verhaak RG | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए ऑन्कोजीन प्रवर्धन और कई कैंसर में खराब परिणाम से जुड़ा है| journal = Nature Genetics| volume = 52 | issue = 8 | pages = 891–897 | date = August 2020| pmid = 32807987| pmc = 7484012 | doi =  10.1038/s41588-020-0678-2 }}</ref><ref name=":3" /> कैंसर में ecDNA का एक प्राथमिक कार्य ट्यूमर को तेजी से उच्च प्रतिलिपि संख्या तक पहुंचने में सक्षम बनाना है, साथ ही तेजी से, बड़े पैमाने पर सेल-टू-सेल आनुवंशिक विविधता को बढ़ावा देना है।<ref name=":0" /><ref name=":2" /> कैंसर में सबसे सामान्यतः प्रवर्धित ऑन्कोजीन ecDNA पर पाए जाते हैं और इन्हें अत्यधिक गतिशील दिखाया गया है, जो गैर-देशी गुणसूत्रों में सजातीय धुंधला क्षेत्रों के रूप में फिर से एकीकृत (एचएसआर)<ref>{{cite journal | vauthors = Storlazzi CT, Lonoce A, Guastadisegni MC, Trombetta D, D'Addabbo P, Daniele G, L'Abbate A, Macchia G, Surace C, Kok K, Ullmann R, Purgato S, Palumbo O, Carella M, Ambros PF, Rocchi M | display-authors = 6 | title = Gene amplification as double minutes or homogeneously staining regions in solid tumors: origin and structure | journal = Genome Research | volume = 20 | issue = 9 | pages = 1198–206 | date = September 2010 | pmid = 20631050 | pmc = 2928498 | doi = 10.1101/gr.106252.110 }}</ref><ref name=":02">{{cite journal | vauthors = Turner KM, Deshpande V, Beyter D, Koga T, Rusert J, Lee C, Li B, Arden K, Ren B, Nathanson DA, Kornblum HI, Taylor MD, Kaushal S, Cavenee WK, Wechsler-Reya R, Furnari FB, Vandenberg SR, Rao PN, Wahl GM, Bafna V, Mischel PS | display-authors = 6 | title = एक्स्ट्राक्रोमोसोमल ऑन्कोजीन प्रवर्धन ट्यूमर के विकास और आनुवंशिक विषमता को संचालित करता है| journal = Nature | volume = 543 | issue = 7643 | pages = 122–125 | date = March 2017 | pmid = 28178237 | pmc = 5334176 | doi = 10.1038/nature21356 | bibcode = 2017Natur.543..122T }}</ref> और विभिन्न दवा उपचारों के जवाब में कॉपी संख्या और संरचना में परिवर्तन है।<ref>{{cite journal | vauthors = Von Hoff DD, McGill JR, Forseth BJ, Davidson KK, Bradley TP, Van Devanter DR, Wahl GM | title = मानव ट्यूमर कोशिकाओं से एक्स्ट्राक्रोमोसोमली प्रवर्धित MYC जीन का उन्मूलन उनकी ट्यूमरजन्यता को कम करता है| journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 89 | issue = 17 | pages = 8165–9 | date = September 1992 | pmid = 1518843 | pmc = 49877 | doi = 10.1073/pnas.89.17.8165 | bibcode = 1992PNAS...89.8165V | doi-access = free }}</ref><ref name="Targeted therapy resistance mediate"/><ref>{{cite journal | vauthors = Xu K, Ding L, Chang TC, Shao Y, Chiang J, Mulder H, Wang S, Shaw TI, Wen J, Hover L, McLeod C, Wang YD, Easton J, Rusch M, Dalton J, Downing JR, Ellison DW, Zhang J, Baker SJ, Wu G | display-authors = 6 | title = ब्रेन ट्यूमर के निदान और पुनरावर्तन में दोहरे मिनट की संरचना और विकास| journal = Acta Neuropathologica | volume = 137 | issue = 1 | pages = 123–137 | date = January 2019 | pmid = 30267146 | pmc = 6338707 | doi = 10.1007/s00401-018-1912-1 }}</ref> ecDNA बड़ी संख्या में अधिक उन्नत और सबसे गंभीर कैंसरों के साथ-साथ कैंसर-रोधी दवाओं के प्रतिरोध के लिए जिम्मेदार है।<ref>{{cite journal | vauthors = Wu S, Turner KM, Nguyen N, Raviram R, Erb M, Santini J, Luebeck J, Rajkumar U, Diao Y, Li B, Zhang W, Jameson N, Corces MR, Granja JM, Chen X, Coruh C, Abnousi A, Houston J, Ye Z, Hu R, Yu M, Kim H, Law JA, Verhaak RG, Hu M, Furnari FB, Chang HY, Ren B, Bafna V, Mischel PS | display-authors = 6 | title = परिपत्र ईसीडीएनए सुलभ क्रोमैटिन और उच्च ऑन्कोजीन अभिव्यक्ति को बढ़ावा देता है| journal = Nature | volume = 575 | issue = 7784 | pages = 699–703 | date = November 2019 | pmid = 31748743 | pmc = 7094777 | doi = 10.1038/s41586-019-1763-5 | bibcode = 2019Natur.575..699W }}</ref>


ईसीडीएनए का गोलाकार आकार सार्थक तरीकों से क्रोमोसोमल डीएनए की रैखिक संरचना से भिन्न होता है जो कैंसर रोगजनन को प्रभावित करता है।<ref>{{cite web|url=https://www.theguardian.com/science/2023/feb/18/bond-villain-dna-could-transform-cancer-treatment-scientists-say|title=‘Bond villain’ DNA could transform cancer treatment, scientists say|date=February 18, 2023|doi=10.1038/s41588-022-01177-x}}</ref> ईसीडीएनए पर एन्कोड किए गए ऑन्कोजीन में बड़े पैमाने पर ट्रांसक्रिप्शनल आउटपुट होता है, जो पूरे ट्रांसक्रिप्टोम में शीर्ष 1% जीन में रैंकिंग करता है। बैक्टीरियल प्लास्मिड या माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए के विपरीत, ईसीडीएनए क्रोमैटिनीकृत होते हैं, जिनमें सक्रिय हिस्टोन निशान के उच्च स्तर होते हैं, लेकिन दमनकारी हिस्टोन निशान की कमी होती है। ईसीडीएनए क्रोमेटिन वास्तुकला में उच्च-क्रम संघनन का अभाव है जो क्रोमोसोमल डीएनए पर मौजूद है और पूरे कैंसर जीनोम में सबसे सुलभ डीएनए में से एक है।
ecDNA का गोलाकार आकार सार्थक तरीकों से क्रोमोसोमल डीएनए की रैखिक संरचना से भिन्न होता है जो कैंसर रोगजनन को प्रभावित करता है।<ref>{{cite web|url=https://www.theguardian.com/science/2023/feb/18/bond-villain-dna-could-transform-cancer-treatment-scientists-say|title=‘Bond villain’ DNA could transform cancer treatment, scientists say|date=February 18, 2023|doi=10.1038/s41588-022-01177-x}}</ref> ecDNA पर एन्कोड किए गए ऑन्कोजीन में बड़े पैमाने पर ट्रांसक्रिप्शनल आउटपुट होता है, जो पूरे ट्रांसक्रिप्टोम में शीर्ष 1% जीन में रैंकिंग करता है। बैक्टीरियल प्लास्मिड या माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए के विपरीत, ecDNA क्रोमैटिनीकृत होते हैं, जिनमें सक्रिय हिस्टोन निशान के उच्च स्तर होते हैं, लेकिन दमनकारी हिस्टोन निशान की कमी होती है। ecDNA क्रोमेटिन वास्तुकला में उच्च-क्रम संघनन का अभाव है जो क्रोमोसोमल डीएनए पर उपस्थित है और पूरे कैंसर जीनोम में सबसे सुलभ डीएनए में से एक है।


ईसीडीएनए को नाभिक के भीतर एक साथ क्लस्टर किया जा सकता है, जिसे ईसीडीएनए हब कहा जा सकता है।<ref>{{Cite journal |last1=Hung |first1=King L. |last2=Yost |first2=Kathryn E. |last3=Xie |first3=Liangqi |last4=Shi |first4=Quanming |last5=Helmsauer |first5=Konstantin |last6=Luebeck |first6=Jens |last7=Schöpflin |first7=Robert |last8=Lange |first8=Joshua T. |last9=Chamorro González |first9=Rocío |last10=Weiser |first10=Natasha E. |last11=Chen |first11=Celine |date=December 2021 |title=ecDNA हब सहकारी इंटरमॉलिक्युलर ऑन्कोजीन अभिव्यक्ति को संचालित करता है|journal=Nature |language=en |volume=600 |issue=7890 |pages=731–736 |doi=10.1038/s41586-021-04116-8 |pmid=34819668 |pmc=9126690 |bibcode=2021Natur.600..731H |issn=1476-4687}}</ref> विशेष रूप से, ईसीडीएनए हब ऑन्कोजीन ओवरएक्प्रेशन को बढ़ावा देने के लिए अंतर-आणविक वर्धक-जीन परस्पर क्रिया का कारण बन सकते हैं।
ecDNA को नाभिक के भीतर एक साथ क्लस्टर किया जा सकता है, जिसे ecDNA हब कहा जा सकता है।<ref>{{Cite journal |last1=Hung |first1=King L. |last2=Yost |first2=Kathryn E. |last3=Xie |first3=Liangqi |last4=Shi |first4=Quanming |last5=Helmsauer |first5=Konstantin |last6=Luebeck |first6=Jens |last7=Schöpflin |first7=Robert |last8=Lange |first8=Joshua T. |last9=Chamorro González |first9=Rocío |last10=Weiser |first10=Natasha E. |last11=Chen |first11=Celine |date=December 2021 |title=ecDNA हब सहकारी इंटरमॉलिक्युलर ऑन्कोजीन अभिव्यक्ति को संचालित करता है|journal=Nature |language=en |volume=600 |issue=7890 |pages=731–736 |doi=10.1038/s41586-021-04116-8 |pmid=34819668 |pmc=9126690 |bibcode=2021Natur.600..731H |issn=1476-4687}}</ref> विशेष रूप से, ecDNA हब ऑन्कोजीन ओवरएक्प्रेशन को बढ़ावा देने के लिए अंतर-आणविक वर्धक-जीन परस्पर क्रिया का कारण बन सकते हैं।


== संदर्भ ==
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Latest revision as of 17:14, 8 August 2023

एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (संक्षेप में ecDNA) कोई भी डीएनए है जो किसी कोशिका के केंद्रक के अंदर या बाहर गुणसूत्रों से पाया जाता है। व्यक्तिगत जीनोम में अधिकांश डीएनए नाभिक में उपस्थित गुणसूत्रों में पाया जाता है। एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के कई रूप उपस्थित हैं, और, इनमें से कुछ महत्वपूर्ण जैविक कार्य करते हैं,[1] वे कैंसर जैसी बीमारियों में भी भूमिका निभा सकते हैं।[2][3][4]

प्रोकैरियोट्स में, नॉनवायरल एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए मुख्य रूप से प्लास्मिड में पाया जाता है, जबकि यूकेरियोट्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए मुख्य रूप से ऑर्गेनेल में पाया जाता है।[1] माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए यूकेरियोट्स में इस एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का एक मुख्य स्रोत है।[5] तथ्य यह है कि इस अंगक में अपना स्वयं का डीएनए होता है जो इस परिकल्पना का समर्थन करता है कि माइटोकॉन्ड्रिया की उत्पत्ति पैतृक यूकेरियोटिक कोशिकाओं से घिरे जीवाणु कोशिकाओं के रूप में हुई थी।[6] एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का उपयोग प्रायः प्रतिकृति के अनुसंधान में किया जाता है क्योंकि इसे पहचानना और अलग करना आसान होता है।[1]

हालाँकि एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए (eccDNA) सामान्य यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाया जाता है, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (ecDNA) विशिष्ट इकाई है जिसे कैंसर कोशिकाओं के नाभिक में पहचाना गया है और ड्राइवर ऑन्कोजीन की कई प्रतियां ले जाने के लिए दिखाया गया है।[7][8][3] ecDNA को जीन प्रवर्धन का एक प्राथमिक तंत्र माना जाता है, जिसके परिणामस्वरूप चालक ऑन्कोजीन की कई प्रतियां और बहुत आक्रामक कैंसर होते हैं।

साइटोप्लाज्म में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए संरचनात्मक रूप से परमाणु डीएनए से भिन्न पाया गया है। साइटोप्लाज्मिक डीएनए नाभिक के भीतर पाए जाने वाले डीएनए की तुलना में कम मिथाइलेटेड होता है। यह भी पुष्टि की गई कि साइटोप्लाज्मिक डीएनए के अनुक्रम एक ही जीव में परमाणु डीएनए से भिन्न थे, जिससे पता चलता है कि साइटोप्लाज्मिक डीएनए केवल परमाणु डीएनए के टुकड़े नहीं हैं।[9] कैंसर कोशिकाओं में, ecDNA को मुख्य रूप से नाभिक से पृथक दिखाया गया है ([2] में समीक्षा की गई है)।

कोशिकाओं में नाभिक के बाहर पाए जाने वाले डीएनए के अलावा, वायरल जीनोम द्वारा संक्रमण भी एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का एक उदाहरण प्रदान करता है।

प्रोकैरियोटिक

ई. कोलाई का pBR32 प्लाज्मिड

यद्यपि प्रोकैरियोटिक जीवों में यूकेरियोट्स की तरह झिल्ली-बद्ध नाभिक नहीं होता है, उनमें न्यूक्लियॉइड क्षेत्र होता है जिसमें मुख्य गुणसूत्र पाया जाता है। एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए न्यूक्लियॉइड क्षेत्र के बाहर गोलाकार या रैखिक प्लास्मिड के रूप में प्रोकैरियोट्स में उपस्थित होता है। बैक्टीरियल प्लास्मिड सामान्यतः छोटे अनुक्रम होते हैं, जिनमें 1 से कुछ सौ किलोबेस (केबी) खंड होते हैं, और इसमें प्रतिकृति की उत्पत्ति होती है जो प्लास्मिड को बैक्टीरिया गुणसूत्र से स्वतंत्र रूप से दोहराने की अनुमति देती है।[10] किसी कोशिका के भीतर किसी विशेष प्लास्मिड की कुल संख्या को प्रतिलिपि संख्या कहा जाता है और यह प्रति कोशिका दो प्रतियों से लेकर प्रति कोशिका कई सौ प्रतियों तक हो सकती है।[11] सर्कुलर बैक्टीरियल प्लास्मिड को प्लास्मिड पर एन्कोड किए गए जीन द्वारा प्रदान किए जाने वाले विशेष कार्यों के अनुसार वर्गीकृत किया जाता है। फर्टिलिटी प्लास्मिड, या एफ प्लास्मिड, संयुग्मन होने की अनुमति देते हैं जबकि प्रतिरोध प्लास्मिड, या आर प्लास्मिड, में ऐसे जीन होते हैं जो विभिन्न प्रकार के एंटीबायोटिक दवाओं जैसे एम्पीसिलीन और टेट्रासाइक्लिन के प्रति प्रतिरोध व्यक्त करते हैं। विषाणु प्लास्मिड में जीवाणुओं को रोगजनक बनने के लिए आवश्यक आनुवंशिक तत्व होते हैं। डिग्रेडेटिव प्लास्मिड में ऐसे जीन होते हैं जो बैक्टीरिया को विभिन्न प्रकार के पदार्थों जैसे कि सुगंधित यौगिकों और ज़ेनोबायोटिक्स को नष्ट करने की अनुमति देते हैं।[12] बैक्टीरियल प्लास्मिड रंगद्रव्य उत्पादन, नाइट्रोजन स्थिरीकरण और भारी धातुओं के प्रतिरोध में भी कार्य कर सकते हैं।[13]

स्वाभाविक रूप से उत्पन्न होने वाले वृत्ताकार प्लास्मिड को बहुप्रतिरोध जीनों और कई अद्वितीय प्रतिबंध साइटों को समाहित करने के लिए संशोधित किया जा सकता है, जिससे वे जैव प्रौद्योगिकी में क्लोनिंग वेक्टर के रूप में मूल्यवान उपकरण बन जाते हैं।[10] सर्कुलर बैक्टीरियल प्लास्मिड भी डीएनए टीकाकरण के उत्पादन का आधार हैं। प्लास्मिड डीएनए टीके जेनेटिक इंजीनियरिंग हैं जिसमें जीन होता है जो एक रोगजनक वायरस, जीवाणु या अन्य परजीवी द्वारा उत्पादित एंटीजन या प्रोटीन के लिए एन्कोड करता है।[14] एक बार मेजबान में वितरित होने के बाद, प्लाज्मिड जीन के उत्पाद मेजबान की सहज प्रतिरक्षा और अनुकूली प्रतिरक्षा दोनों को उत्तेजित करेंगे। मेजबान से प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को बढ़ाने के लिए प्लास्मिड प्रायः डिलीवरी से पहले किसी प्रकार के सहायक के साथ लेपित होते हैं।[15]

स्पिरोचैट की कई प्रजातियों में लीनियर बैक्टीरियल प्लास्मिड की पहचान की गई है, जिसमें जीनस बोरेलिया के सदस्य (जिससे लाइम रोग के लिए जिम्मेदार रोगज़नक़ सम्मिलित है), ग्राम-ऋणात्मक जीवाणु की कई प्रजातियाँ जीनस स्ट्रेप्टोमाइसेस के मिट्टी के बैक्टीरिया और ग्राम में- ऋणात्मक जीवाणु प्रजाति थियोबैसिलस वर्सुटस, जीवाणु जो सल्फर को ऑक्सीकरण करता है। प्रोकैरियोट्स के रैखिक प्लास्मिड या तो हेयरपिन लूप या डीएनए अणु के टेलोमेर सिरों से जुड़े सहसंयोजक बंधन प्रोटीन से युक्त पाए जाते हैं। बोरेलिया बैक्टीरिया के एडेनिन-थाइमिन समृद्ध हेयरपिन लूप का आकार 5 किलोबेस जोड़े (केबी) से लेकर 200 केबी से अधिक तक होता है।[16] और बैक्टीरिया पर प्रमुख सतह प्रोटीन, या एंटीजन के समूह के उत्पादन के लिए जिम्मेदार जीन होते हैं जो इसे अपने संक्रमित मेजबान की प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया से बचने की अनुमति देते हैं।[17] रैखिक प्लास्मिड जिसमें प्रोटीन होता है जो डीएनए स्ट्रैंड के 5' छोर से सहसंयोजक रूप से जुड़ा होता है, इनवर्ट्रोन के रूप में जाना जाता है और इसका आकार 9 केबी से लेकर 600 केबी से अधिक हो सकता है जिसमें उल्टे दोहराव सम्मिलित होते हैं।[16] सहसंयोजक प्रोटीन के साथ रैखिक प्लास्मिड जीवाणु जीवाणु संयुग्मन और प्लास्मिड के जीनोम में एकीकरण के साथ सहायता कर सकते हैं। इस प्रकार के रैखिक प्लास्मिड एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के सबसे बड़े वर्ग का प्रतिनिधित्व करते हैं क्योंकि वे न केवल कुछ बैक्टीरिया कोशिकाओं में उपस्थित होते हैं, बल्कि यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाए जाने वाले सभी रैखिक एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु भी इस इन्वर्ट्रोन संरचना को 5' छोर से जुड़े प्रोटीन के साथ लेते हैं।[16][17]

लंबे, रैखिक "बोर्ग" जो आर्कियोन की प्रजाति के साथ सह-घटित होते हैं - जो उन्हें होस्ट कर सकते हैं और उनके कई जीनों को साझा कर सकते हैं - एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए संरचनाओं का अज्ञात रूप हो सकता है।[18][19]

यूकेरियोटिक

माइटोकॉन्ड्रियल

मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए 37 जीन दिखा रहा है

यूकेरियोटिक कोशिकाओं में उपस्थित माइटोकॉन्ड्रिया में माइटोकॉन्ड्रियल मैट्रिक्स में माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (mtDNA) की कई प्रतियां होती हैं।[20] मनुष्यों सहित बहुकोशिकीय जानवरों में, गोलाकार mtDNA क्रोमोसोम में 13 जीन होते हैं जो प्रोटीन को एनकोड करते हैं जो इलेक्ट्रॉन परिवहन श्रृंखला का हिस्सा होते हैं और अन्य माइटोकॉन्ड्रियल प्रोटीन के लिए 24 जीन होते हैं; ये जीन 2 rRNA जीन और 22 tRNA जीन में टूट जाते हैं।[21] जानवर mtDNA प्लास्मिड का आकार लगभग 16.6 केबी है और, हालांकि इसमें tRNA और mRNA संश्लेषण के लिए जीन सम्मिलित हैं, परमाणु जीन द्वारा कोडित प्रोटीन को अभी भी mtDNA को दोहराने या माइटोकॉन्ड्रियल प्रोटीन का अनुवाद करने के लिए आवश्यक है।[22] माइटोकॉन्ड्रियल गुणसूत्र का केवल एक क्षेत्र है जिसमें कोडिंग अनुक्रम नहीं होता है, 1 केबी क्षेत्र जिसे डी-लूप के रूप में जाना जाता है, जिससे परमाणु नियामक प्रोटीन बंधते हैं।[21] प्रति माइटोकॉन्ड्रिया में mtDNA अणुओं की संख्या प्रजातियों से प्रजातियों के साथ-साथ विभिन्न ऊर्जा मांगों वाली कोशिकाओं के बीच भिन्न होती है। उदाहरण के लिए, मांसपेशियों और यकृत कोशिकाओं में रक्त और त्वचा कोशिकाओं की तुलना में प्रति माइटोकॉन्ड्रिया में mtDNA की अधिक प्रतियां होती हैं।[22] माइटोकॉन्ड्रियल आंतरिक झिल्ली के भीतर इलेक्ट्रॉन परिवहन श्रृंखला की निकटता और प्रतिक्रियाशील ऑक्सीजन प्रजातियों (आरओएस) के उत्पादन के कारण, और इस तथ्य के कारण कि mtDNA अणु हिस्टोन द्वारा बाध्य या संरक्षित नहीं है, mtDNA परमाणु डीएनए की तुलना में डीएनए क्षति के प्रति अधिक संवेदनशील है।[23] ऐसे स्थितियों में जहां mtDNA क्षति होती है, डीएनए को या तो बेस एक्सिशन रिपेयर पाथवे के जरिए ठीक किया जा सकता है, या क्षतिग्रस्त mtDNA अणु को नष्ट कर दिया जाता है (माइटोकॉन्ड्रियन को नुकसान पहुंचाए बिना क्योंकि प्रति माइटोकॉन्ड्रियन में mtDNA की कई प्रतियां होती हैं)।[24]

मानक आनुवंशिक कोड जिसके द्वारा परमाणु जीन का अनुवाद किया जाता है, सार्वभौमिक है, जिसका अर्थ है कि डीएनए का प्रत्येक 3-आधार अनुक्रम एक ही अमीनो एसिड के लिए कोड करता है, चाहे डीएनए किसी भी प्रजाति से आता हो। हालाँकि, यह कोड काफी सार्वभौमिक है और कवक, जानवरों, प्रोटिस्ट और पौधों के माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए में थोड़ा अलग है।[20] जबकि इन जीवों के mtDNA में अधिकांश 3-बेस अनुक्रम (कोडन) परमाणु आनुवंशिक कोड के समान अमीनो एसिड के लिए कोड करते हैं, कुछ भिन्न होते हैं।

विभिन्न जीवों के mtDNA अनुक्रमों में कोडिंग अंतर
जेनेटिक कोड अनुवाद सारणी डीएनए कोडन सम्मिलित आरएनए कोडन सम्मिलित इस कोड के साथ अनुवाद यूनिवर्सल कोड से तुलना
कशेरुकी माइटोकॉन्ड्रियल 2 AGA AGA Ter (*) Arg (R)
AGG AGG Ter (*) Arg (R)
ATA AUA Met (M) Ile (I)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
यीस्ट माइटोकॉन्ड्रियल 3 ATA AUA Met (M) Ile (I)
CTT CUU Thr (T) Leu (L)
CTC CUC Thr (T) Leu (L)
CTA CUA Thr (T) Leu (L)
CTG CUG Thr (T) Leu (L)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
CGA CGA absent Arg (R)
CGC CGC absent Arg (R)
मोल्ड, प्रोटोजोअन, और सीलेन्टरेट माइटोकॉन्ड्रियल 4 and 7 TGA UGA Trp (W) Ter (*)
अकशेरूकी माइटोकॉन्ड्रियल 5 AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Ser (S) Arg (R)
ATA AUA Met (M) Ile (I)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
एकिनोडर्म और फ्लैटवर्म माइटोकॉन्ड्रियल 9 AAA AAA Asn (N) Lys (K)
AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Ser (S) Arg (R)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
एस्किडियन माइटोकॉन्ड्रियल 13 AGA AGA Gly (G) Arg (R)
AGG AGG Gly (G) Arg (R)
ATA AUA Met (M) Ile (I)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
वैकल्पिक फ़्लैटवॉर्म माइटोकॉन्ड्रियल 14 AAA AAA Asn (N) Lys (K)
AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Ser (S) Arg (R)
TAA UAA Tyr (Y) Ter (*)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
क्लोरोफाइशियन माइटोकॉन्ड्रियल 16 TAG UAG Leu (L) Ter (*)
ट्रेमेटोड माइटोकॉन्ड्रियल 21 TGA UGA Trp (W) Ter (*)
ATA AUA Met (M) Ile (I)
AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Ser (S) Arg (R)
AAA AAA Asn (N) Lys (K)
सीनेडेसमस ओब्लिकस माइटोकॉन्ड्रियल 22 TCA UCA Ter (*) Ser (S)
TAG UAG Leu (L) Ter (*)
थ्रोस्टोचिट्रियम माइटोकॉन्ड्रियल 23 TTA UUA Ter (*) Leu (L)
टेरोब्रैन्चिया माइटोकॉन्ड्रियल 24 AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Lys (K) Arg (R)
TGA UGA Trp (W) Ter (*)
अमीनो एसिड के जैव रासायनिक गुण अध्रुवीय ध्रुवीय मूलभूत एसिडिक समापन: कोडन बंद करो

ऐसा माना जाता है कि कोडिंग अंतर ट्रांसफर आरएनए में रासायनिक संशोधनों का परिणाम है जो mtDNA अनुक्रमों को लिखने के परिणामस्वरूप उत्पन्न मैसेंजर आरएनए के साथ बातचीत करते हैं।[25]

क्लोरोप्लास्ट

यूकेरियोटिक क्लोरोप्लास्ट, साथ ही अन्य पौधों के प्लास्टिड्स में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु भी होते हैं। अधिकांश क्लोरोप्लास्ट अपनी सभी आनुवंशिक सामग्री को एक ही चक्राकार गुणसूत्र में रखते हैं, हालाँकि कुछ प्रजातियों में कई छोटे चक्राकार प्लास्मिड के प्रमाण मिलते हैं।[26][27][28] एक हालिया सिद्धांत जो अंगूठी के आकार के क्लोरोप्लास्ट डीएनए (सीपीडीएनए) के वर्तमान मानक मॉडल पर सवाल उठाता है, सुझाव देता है कि सीपीडीएनए सामान्यतः एक रैखिक आकार ले सकता है।[29] सीपीडीएनए के एक अणु में 100-200 जीन हो सकते हैं[30] और विभिन्न प्रजातियों के आकार में भिन्नता होती है। उच्च पौधों में सीपीडीएनए का आकार लगभग 120-160 केबी होता है।[20] mRNA के लिए सीपीडीएनए कोड पर पाए जाने वाले जीन प्रकाश संश्लेषक मार्ग के आवश्यक घटकों के उत्पादन के साथ-साथ tRNA, rRNA, आरएनए पोलीमरेज़ सबयूनिट और राइबोसोमल प्रोटीन सबयूनिट के लिए कोडिंग के लिए जिम्मेदार हैं।[31] mtDNA की तरह, सीपीडीएनए पूरी तरह से स्वायत्त नहीं है और क्लोरोप्लास्ट प्रोटीन की प्रतिकृति और उत्पादन के लिए परमाणु जीन उत्पादों पर निर्भर करता है। क्लोरोप्लास्ट में सीपीडीएनए की कई प्रतियां होती हैं और संख्या न केवल प्रजातियों से प्रजातियों या कोशिका प्रकार से कोशिका प्रकार तक भिन्न हो सकती है, बल्कि कोशिका की आयु और विकास के चरण के आधार पर एक कोशिका के भीतर भी भिन्न हो सकती है। उदाहरण के लिए, युवा कोशिकाओं के क्लोरोप्लास्ट में सीपीडीएनए सामग्री, विकास के प्रारंभिक चरणों के दौरान, जहां क्लोरोप्लास्ट अस्पष्ट प्रोप्लास्टिड के रूप में होते हैं, उस समय उपस्थित कोशिकाओं की तुलना में बहुत अधिक होती है जब वह कोशिका परिपक्व होती है और विस्तारित होती है, जिसमें पूरी तरह से परिपक्व प्लास्टिड होते हैं।[32]

सर्कुलर

Main article: एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए

एक्स्ट्राक्रोमोसोमल सर्कुलर डीएनए (eccDNA) सभी यूकेरियोटिक कोशिकाओं में उपस्थित होते हैं, सामान्यतः जीनोमिक डीएनए से प्राप्त होते हैं, और क्रोमोसोम के कोडिंग और गैर-कोडिंग दोनों क्षेत्रों में पाए जाने वाले डीएनए के दोहराव वाले अनुक्रमों से बने होते हैं। eccDNA का आकार 2000 से कम बेस जोड़े से लेकर 20,000 से अधिक बेस जोड़े तक हो सकता है।[33] पौधों में, eccDNA में उन अनुक्रमों के समान बार-बार अनुक्रम होते हैं जो गुणसूत्रों के सेंट्रोमेरिक क्षेत्रों और दोहराए जाने वाले उपग्रह डीएनए में पाए जाते हैं।[34] जानवरों में, eccDNA अणुओं में दोहराव वाले अनुक्रम पाए जाते हैं जो उपग्रह डीएनए, 5S राइबोसोमल डीएनए और टेलोमेयर डीएनए में देखे जाते हैं।[33] कुछ जीव, जैसे कि यीस्ट, eccDNA का उत्पादन करने के लिए क्रोमोसोमल डीएनए प्रतिकृति पर निर्भर होते हैं[34] जबकि eccDNA का गठन अन्य जीवों, जैसे स्तनधारियों, में प्रतिकृति प्रक्रिया से स्वतंत्र रूप से हो सकता है।[35] eccDNA के कार्य का व्यापक रूप से अध्ययन नहीं किया गया है, लेकिन यह प्रस्तावित किया गया है कि जीनोमिक डीएनए अनुक्रमों से eccDNA तत्वों का उत्पादन यूकेरियोटिक जीनोम की प्लास्टिसिटी को बढ़ाता है और जीनोम स्थिरता, कोशिका उम्र बढ़ने और गुणसूत्रों के विकास को प्रभावित कर सकता है।[36]

एक विशिष्ट प्रकार का एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए, जिसे ecDNA के रूप में जाना जाता है, सामान्यतः मानव कैंसर कोशिकाओं में देखा जाता है।[2][3][4] कैंसर कोशिकाओं में पाए जाने वाले ecDNA में एक या एक से अधिक जीन होते हैं जो चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। ecDNA, eccDNA से बहुत बड़े होते हैं और प्रकाश माइक्रोस्कोपी द्वारा दृश्यमान होते हैं। कैंसर में ecDNA सामान्यतः 1-3 एमबी और उससे अधिक आकार का होता है।[2] मानव कैंसर कोशिकाओं के नाभिक में बड़े ecDNA अणु पाए गए हैं और यह दिखाया गया है कि वे चालक ऑन्कोजीन की कई प्रतियां ले जाते हैं, जो ट्यूमर कोशिकाओं में स्थानांतरित हो जाते हैं। इस साक्ष्य के आधार पर यह माना जाता है कि ecDNA कैंसर के विकास में योगदान देता है।

विशिष्ट उपकरण उपस्थित हैं जो ecDNA की पहचान करने की अनुमति देते हैं, जैसे

  • पॉल मिशेल और विनीत बाफना द्वारा विकसित सॉफ्टवेयर जो सूक्ष्म छवियों में ecDNA को पहचानने की अनुमति देता है।
  • "सर्कल-सेक, कोशिकाओं से ecDNA को भौतिक रूप से अलग करने, एंजाइमों के साथ किसी भी शेष रैखिक डीएनए को हटाने और जो गोलाकार डीएनए रहता है उसे अनुक्रमित करने की एक विधि", कोपेनहेगन विश्वविद्यालय में बिरगिट रेगेनबर्ग और उनकी टीम द्वारा विकसित की गई।[37]


वायरल

वायरल डीएनए एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का उदाहरण है। वायरस के विकास और उत्परिवर्तन को समझने के लिए वायरल जीनोम को समझना बहुत महत्वपूर्ण है।[38] कुछ वायरस, जैसे कि एचआईवी और ऑन्कोजेनिक वायरस, अपने स्वयं के डीएनए को मेजबान कोशिका के जीनोम में सम्मिलित करते हैं।[39] वायरल जीनोम सिंगल स्ट्रैंडेड डीएनए (एसएसडीएनए), डबल स्ट्रैंडेड डीएनए (डीएसडीएनए) से बना हो सकता है और रैखिक और गोलाकार दोनों रूपों में पाया जा सकता है।[40]

एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के रूप में गठित वायरस के संक्रमण का एक उदाहरण ह्यूमन पेपिलोमावायरस (एचपीवी) है। एचपीवी डीएनए जीनोम प्रतिकृति के तीन अलग-अलग चरणों से होकर गुजरता है: स्थापना, रखरखाव और प्रवर्धन। एचपीवी एनोजिनिटल ट्रैक्ट और मौखिक गुहा में उपकला कोशिकाओं को संक्रमित करता है। सामान्यतः, एचपीवी का पता लगाया जाता है और प्रतिरक्षा प्रणाली द्वारा उसे ख़त्म कर दिया जाता है। वायरल डीएनए की पहचान प्रतिरक्षा प्रतिक्रियाओं का एक महत्वपूर्ण भाग है। इस वायरस के बने रहने के लिए, कोशिका विभाजन के दौरान वृत्ताकार जीनोम को दोहराया जाना चाहिए और वंशानुक्रम में मिला होना चाहिए।[41]

मेजबान कोशिका द्वारा अनुभूति

कोशिकाएँ विदेशी साइटोप्लास्मिक डीएनए को पहचान सकती हैं। पहचान के मार्गों को समझने से रोगों की रोकथाम और उपचार पर प्रभाव पड़ता है।[42] कोशिकाओं में सेंसर होते हैं जो विशेष रूप से वायरल डीएनए जैसे टोल-लाइक रिसेप्टर (टीएलआर) मार्ग को पहचान सकते हैं।[43]

टोल पाथवे को, सबसे पहले कीड़ों में, एक ऐसे मार्ग के रूप में मान्यता दी गई थी जो कुछ प्रकार की कोशिकाओं को विभिन्न प्रकार के बैक्टीरिया या वायरल जीनोम और पीएमपीएस (रोगज़नक़ से जुड़े आणविक पैटर्न) का पता लगाने में सक्षम सेंसर के रूप में कार्य करने की अनुमति देता है। पीएएमपी को जन्मजात प्रतिरक्षा सिग्नलिंग के शक्तिशाली सक्रियकर्ता के रूप में जाना जाता है। लगभग 10 मानव टोल-लाइक रिसेप्टर्स (टीएलआर) हैं। मनुष्यों में अलग-अलग टीएलआर अलग-अलग पीएएमपीएस का पता लगाते हैं: टीएलआर4 द्वारा लिपोपॉलीसेकेराइड, टीएलआर3 द्वारा वायरल डीएसआरएनए, टीएलआर7/टीएलआर8 द्वारा वायरल एसएसआरएनए, टीएलआर9 द्वारा वायरल या बैक्टीरियल अनमिथाइलेटेड डीएनए। टीएलआर9 सामान्यतः बैक्टीरिया और वायरस में पाए जाने वाले सीपीजी डीएनए का पता लगाने और आईएफएन (प्रकार I इंटरफेरॉन) और अन्य साइटोकिन्स का उत्पादन प्रारम्भ करने के लिए विकसित हुआ है।[43]

वंशानुक्रम

मनुष्यों में माइटोकॉन्ड्रियल वंशानुक्रम: mtDNA और इसके उत्परिवर्तन मातृ संचरित होते हैं।

एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए का वंशानुक्रम गुणसूत्रों में पाए जाने वाले परमाणु डीएनए के वंशानुक्रम से भिन्न होता है। क्रोमोसोम के विपरीत, ecDNA में सेंट्रोमियर नहीं होते हैं और इसलिए यह एक गैर-मेंडेलियन वंशानुक्रम पैटर्न प्रदर्शित करता है जो विषम कोशिका आबादी को जन्म देता है। मनुष्यों में, वस्तुतः संपूर्ण कोशिकाद्रव्य माँ के अंडे से वंशानुक्रम में मिलता है।[44] इस कारण से, mtDNA समेत ऑर्गेनेल डीएनए मां से वंशानुक्रम में मिला है। mtDNA या अन्य साइटोप्लाज्मिक डीएनए में उत्परिवर्तन भी मां से वंशानुक्रम में मिलेगा। यह एकतरफा वंशानुक्रम गैर-मेंडेलियन वंशानुक्रम का एक उदाहरण है। पौधे एकपक्षीय mtDNA वंशानुक्रम भी दर्शाते हैं। अधिकांश पौधों को mtDNA मातृ रूप से वंशानुक्रम में मिलता है, जिसमें एक उल्लेखनीय अपवाद रेडवुड सिकोइया सेपरविरेन्स है जो mtDNA पैतृक रूप से वंशानुक्रम में मिलता है।[45]

ऐसे दो सिद्धांत हैं कि क्यों पैतृक mtDNA शायद ही कभी संतानों में प्रसारित होता है। एक तो बस यह तथ्य है कि पैतृक mtDNA मातृ mtDNA की तुलना में इतनी कम सांद्रता पर है और इस प्रकार संतानों में इसका पता नहीं लगाया जा सकता है। दूसरा, अधिक जटिल सिद्धांत, वंशानुक्रम को रोकने के लिए पैतृक mtDNA का पाचन सम्मिलित है। यह सिद्धांत दिया गया है कि mtDNA की एकतरफा वंशानुक्रम, जिसमें उच्च उत्परिवर्तन दर है, साइटोप्लाज्मिक डीएनए की होमोप्लाज्मी को बनाए रखने के लिए एक तंत्र हो सकती है।[45]

चिकित्सीय महत्व

कभी-कभी ईई कहा जाता है, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल तत्व, यूकेरियोट्स में जीनोमिक अस्थिरता से जुड़े हुए हैं। छोटे पॉलीडिस्पर्ड डीएनए (एसपीसीडीएनए), एक प्रकार का eccDNA, सामान्यतः जीनोम अस्थिरता के साथ पाए जाते हैं। एसपीसीडीएनए उपग्रह डीएनए, रेट्रोवायरस जैसे डीएनए तत्वों और जीनोम में ट्रांसपोज़ेबल तत्वों जैसे दोहराव अनुक्रमों से प्राप्त होते हैं। ऐसा माना जाता है कि ये जीन पुनर्व्यवस्था के उत्पाद हैं।

कैंसर में पाए जाने वाले एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए (ecDNA) को ऐतिहासिक रूप से डबल मिनट क्रोमोसोम (डीएम) के रूप में जाना जाता है, जो प्रकाश माइक्रोस्कोपी के तहत युग्मित क्रोमैटिन निकायों के रूप में उपस्थित होते हैं। डबल मिनट क्रोमोसोम एकल निकायों सहित ecDNA के ~30% कैंसर युक्त स्पेक्ट्रम का प्रतिनिधित्व करते हैं और इसमें एकल निकायों के समान जीन सामग्री पाई गई है।[3] ecDNA संकेतन कैंसर कोशिकाओं में पाए जाने वाले बड़े, ऑन्कोजीन युक्त, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के सभी रूपों को सम्मिलित करता है। इस प्रकार का ecDNA सामान्यतः विभिन्न हिस्टोलॉजी की कैंसर कोशिकाओं में देखा जाता है, लेकिन सामान्य कोशिकाओं में लगभग कभी नहीं देखा जाता है।[3] ऐसा माना जाता है कि ecDNA गुणसूत्रों में डबल-स्ट्रैंड टूटने या किसी जीव में डीएनए की अत्यधिक प्रतिकृति के माध्यम से उत्पन्न होता है। अध्ययनों से पता चलता है कि कैंसर और अन्य जीनोमिक अस्थिरता के स्थितियों में, ईई के उच्च स्तर देखे जा सकते हैं।[5]

माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए विभिन्न तरीकों से बीमारी की प्रारम्भ में भूमिका निभा सकता है। mtDNA में या वैकल्पिक जीन व्यवस्था में बिंदु उत्परिवर्तन कई बीमारियों से जुड़ा हुआ है जो हृदय, केंद्रीय तंत्रिका तंत्र, अंतःस्रावी तंत्र, जठरांत्र संबंधी मार्ग, आंख और गुर्दे को प्रभावित करते हैं।[21] माइटोकॉन्ड्रिया में उपस्थित mtDNA की मात्रा के नुकसान से माइटोकॉन्ड्रियल डिप्लेशन सिंड्रोम (एमडीडी) नामक बीमारियों का एक पूरा उपसमूह हो सकता है, जो मनुष्यों में यकृत, केंद्रीय और परिधीय तंत्रिका तंत्र, चिकनी मांसपेशियों और श्रवण को प्रभावित करता है।[22] ऐसे अध्ययनों में मिश्रित और कभी-कभी परस्पर विरोधी परिणाम सामने आए हैं, जो mtDNA कॉपी संख्या को कुछ कैंसर के विकास के जोखिम से जोड़ने का प्रयास करते हैं। अध्ययन किए गए हैं जो बढ़े हुए और घटे हुए mtDNA स्तरों और स्तन कैंसर के विकास के बढ़ते जोखिम के बीच संबंध दिखाते हैं। बढ़े हुए mtDNA स्तर और गुर्दे के ट्यूमर के विकास के बढ़ते जोखिम के बीच एक सकारात्मक संबंध देखा गया है, लेकिन mtDNA स्तर और पेट के कैंसर के विकास के बीच कोई संबंध नहीं दिखता है।[46]

एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए एपिकॉम्प्लेक्सा में पाया जाता है, जो प्रोटोजोआ का एक समूह है। मलेरिया परजीवी (जीनस प्लाज़मोडियम), एड्स से संबंधित रोगज़नक़ (टैक्सोप्लाज्मा और क्रिप्टोस्पोरिडियम) दोनों एपिकॉम्प्लेक्सा समूह के सदस्य हैं। मलेरिया परजीवी में माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (mtDNA) पाया गया।[47] मलेरिया परजीवियों में एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए के दो रूप पाए जाते हैं। इनमें से एक 6-केबी रैखिक डीएनए है और दूसरा 35-केबी गोलाकार डीएनए है। इन डीएनए अणुओं पर एंटीबायोटिक दवाओं के लिए संभावित न्यूक्लियोटाइड लक्ष्य साइटों के रूप में शोध किया गया है।[48]

कैंसर में ecDNA की भूमिका

जीन प्रवर्धन ऑन्कोजीन सक्रियण के सबसे सामान्य तंत्रों में से एक है। कैंसर में जीन प्रवर्धन प्रायः एक्स्ट्राक्रोमोसोमल, वृत्ताकार तत्वों पर होता है।[49][4] कैंसर में ecDNA का एक प्राथमिक कार्य ट्यूमर को तेजी से उच्च प्रतिलिपि संख्या तक पहुंचने में सक्षम बनाना है, साथ ही तेजी से, बड़े पैमाने पर सेल-टू-सेल आनुवंशिक विविधता को बढ़ावा देना है।[3][8] कैंसर में सबसे सामान्यतः प्रवर्धित ऑन्कोजीन ecDNA पर पाए जाते हैं और इन्हें अत्यधिक गतिशील दिखाया गया है, जो गैर-देशी गुणसूत्रों में सजातीय धुंधला क्षेत्रों के रूप में फिर से एकीकृत (एचएसआर)[50][51] और विभिन्न दवा उपचारों के जवाब में कॉपी संख्या और संरचना में परिवर्तन है।[52][7][53] ecDNA बड़ी संख्या में अधिक उन्नत और सबसे गंभीर कैंसरों के साथ-साथ कैंसर-रोधी दवाओं के प्रतिरोध के लिए जिम्मेदार है।[54]

ecDNA का गोलाकार आकार सार्थक तरीकों से क्रोमोसोमल डीएनए की रैखिक संरचना से भिन्न होता है जो कैंसर रोगजनन को प्रभावित करता है।[55] ecDNA पर एन्कोड किए गए ऑन्कोजीन में बड़े पैमाने पर ट्रांसक्रिप्शनल आउटपुट होता है, जो पूरे ट्रांसक्रिप्टोम में शीर्ष 1% जीन में रैंकिंग करता है। बैक्टीरियल प्लास्मिड या माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए के विपरीत, ecDNA क्रोमैटिनीकृत होते हैं, जिनमें सक्रिय हिस्टोन निशान के उच्च स्तर होते हैं, लेकिन दमनकारी हिस्टोन निशान की कमी होती है। ecDNA क्रोमेटिन वास्तुकला में उच्च-क्रम संघनन का अभाव है जो क्रोमोसोमल डीएनए पर उपस्थित है और पूरे कैंसर जीनोम में सबसे सुलभ डीएनए में से एक है।

ecDNA को नाभिक के भीतर एक साथ क्लस्टर किया जा सकता है, जिसे ecDNA हब कहा जा सकता है।[56] विशेष रूप से, ecDNA हब ऑन्कोजीन ओवरएक्प्रेशन को बढ़ावा देने के लिए अंतर-आणविक वर्धक-जीन परस्पर क्रिया का कारण बन सकते हैं।

संदर्भ

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