क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल

क्लोस्ट्रीडियोइड्स डिफिसाइल जिसका पर्यायवाची टैक्सोनॉमी हैं, क्लोस्ट्रीडियम डिफिसाइल एक प्रकार का जीवाणु होता है, जो इस प्रकार गंभीर डायरिया संक्रमण उत्पन्न करने के लिए जाना जाता है, और इसकी अधिकता कोलन कैंसर का कारण भी बन सकता है। इसे सी डिफिसाइल या सी. अंतर के नाम से भी जाना जाता है। '', और [[जीवाणु बीजाणु]] बनाने वाले जीवाणुओं की एक ग्राम पॉजिटिव  प्रजाति है।<संदर्भ नाम = मोरेनो - जून 2013 >क्लॉस्ट्रिडिओइड्स एसपीपी। अवायवीय जीव, गतिशीलता बैक्टीरिया, प्रकृति में सर्वव्यापी और विशेष रूप से मिट्टी में प्रचलित हैं। इसकी कायिक कोशिकाएँ छड़ के आकार की, प्लियोमोर्फिज्म (सूक्ष्मजीवविज्ञान) होती हैं, और जोड़े या छोटी श्रृंखलाओं में होती हैं। माइक्रोस्कोप के तहत, वे लंबी, अनियमित (अक्सर ड्रमस्टिक- या स्पिंडल के आकार की) कोशिकाओं के रूप में दिखाई देते हैं जिनके अंतिम छोर पर एक उभार होता है (सबटर्मिनल बीजाणु बनता है)। ग्राम स्टेनिंग के तहत, सी. डिफिसाइल कोशिकाएं ग्राम-पॉजिटिव होती हैं और ऑक्सीजन की अनुपस्थिति में मानव शरीर के तापमान पर रक्त एगर पर इष्टतम वृद्धि दिखाती हैं। सी. डिफिसाइल केटालेज़ - और सुपरऑक्साइड डिसम्यूटेज़ है, और तीन प्रकार के विषाक्त पदार्थों का उत्पादन करता है: क्लॉस्ट्रिडियम डिफिसाइल टॉक्सिन ए, [[क्लोस्ट्रीडियम डिफिसाइल टॉक्सिन ए]] और क्लोस्ट्रीडियोइड्स डिफिसाइल ट्रांसफरेज (सीडीटी)।तनाव की स्थिति में, बैक्टीरिया बैक्टीरिया बीजाणु उत्पन्न करते हैं जो चरम स्थितियों को सहन करने में सक्षम होते हैं जिन्हें सक्रिय बैक्टीरिया बर्दाश्त नहीं कर सकते हैं।

क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल वर्तमान समय में एक महत्वपूर्ण व उभरता हुआ मानव रोगज़नक़ है, मुख्य रूप से रोग नियंत्रण और रोकथाम केंद्रों के अनुसार, 2017 में संयुक्त राज्य अमेरिका में अस्पताल में भर्ती मरीजों के 223,900 मामले और 12,800 मौतें हुई थी। चूंकि इस प्रकार सी डिफिसाइल को सामान्य रूप से अस्पताल और एंटीबायोटिक से जुड़े रोगज़नक़ के रूप में जाना जाता है, इसके अधिक से अधिक एक तिहाई संक्रमणों का पता अस्पतालों में संक्रमित व्यक्ति से संचरण के कारण लगाया जा सकता है, और केवल कुछ ही एंटीबायोटिक्स क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल संक्रमण के विकास के बढ़ते जोखिम से सीधे तौर पर जुड़े हुए हैं। सी डिफिसाइल संक्रमण (सीडीआई), अर्थात् क्लिंडामाइसिन, फ़्लुओरोक़ुइनोलोनेस और सेफैलोस्पोरिन  अधिकांश संक्रमण अस्पतालों के बाहर से होते हैं, और अधिकांश एंटीबायोटिक दवाओं में संक्रमण का खतरा कई गैर-एंटीबायोटिक खतरों के कारकों के समान होता है, जैसे कि रेचक का उपयोग करना और एनीमा प्राप्त करना इसके प्रमुख उदाहरण हैं।

क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल रोग उत्पन्न किए बिना भी मानव की बड़ी आंत में स्थापित हो सकता है। चूंकि इस प्रकार प्रारंभिक अनुमानों से संकेत मिलता है कि सी डिफिसाइल 2-5% वयस्क आबादी में उपस्थित था, वर्तमान समय में कई शोधों के अंतर्गत यह संकेत मिला है कि उपनिवेशीकरण असंबद्ध डायरिया संबंधी बीमारियों के इतिहास से निकटता से जुड़ा हुआ है, जैसे कि खाद्य विषाक्तता या रेचक दुरुपयोग इसका प्रमुख उदाहरण हैं। इस प्रकार जिन व्यक्तियों में गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल गड़बड़ी का कोई इतिहास नहीं है, उनके स्पर्शोन्मुख वाहक बनने की संभावना नहीं है। इस प्रकार इन वाहकों को संक्रमण का एक प्रमुख भंडार माना जाता है।

वर्गीकरण
इस प्रजाति को 2016 में जीनस क्लोस्ट्रीडियम से क्लॉस्ट्रिडिओइड्स में स्थानांतरित किया गया था, इस प्रकार इसे द्विपद क्लोस्ट्रीडियोइड्स डिफिसाइल दिया गया।  यह नया नाम इस प्रजाति और क्लोस्ट्रीडियम जीनस के सदस्यों के बीच वर्गीकरण संबंधी अंतर को दर्शाता है, जबकि इस प्रकार सामान्य नाम को सी. डिफ के रूप में बनाए रखा गया है। इस नए जीनस में एकमात्र अन्य प्रजाति क्लॉस्ट्रिडिओइड्स मैंजेनोटी (जिसे पहले क्लोस्ट्रीडियम मैंजेनोटी के नाम से जाना जाता था) है।

मानव रोगज़नक़
रोगजनक सी डिफिसाइल उपभेद कई विषाक्त पदार्थों का उत्पादन करते हैं। सबसे अच्छे लक्षण आंत्रजीवविष (क्लोस्ट्रीडियम डिफिसाइल टॉक्सिन ए या सी डिफिसाइल टॉक्सिन ए) और साइटोटोक्सिन  (क्लोस्ट्रीडियम डिफिसाइल टॉक्सिन बी या सी डिफिसाइल टॉक्सिन बी) हैं, जो दोनों संक्रमित रोगियों में दस्त और [[सूजन]]  (क्लोस्ट्रीडियम डिफिसाइल कोलाइटिस या सी डिफिसाइल कोलाइटिस) उत्पन्न कर सकते हैं। चूंकि इस प्रकार उनके सापेक्ष योगदान पर वाद-विवाद हुआ है। इसके दस्त के कुछ दिनों के आंतों के तरल पदार्थ के हानि से लेकर जीवन-घातक स्यूडोमेम्ब्रानस कोलाइटिस तक हो सकता है, जो बृहदान्त्र की तीव्र सूजन और आंतों की श्लैष्मिक सतह पर स्यूडोमेम्ब्रेन के गठन से जुड़ा होता है। इस कारण टॉक्सिन ए और बी ग्लूकोसिलट्रांसफेरेज़ हैं जो जीटीपेज़ के आरएचओ परिवार को लक्षित और निष्क्रिय करते हैं। इस प्रकार टॉक्सिन बी (साइटोटॉक्सिन) कम आणविक द्रव्यमान जीटीपी-बाइंडिंग आरएचओ प्रोटीन के एडीपी-राइबोसाइलेशन में कमी के साथ सहसंबद्ध तंत्र द्वारा एक्टिन डीपोलीमराइजेशन को प्रेरित करता है। इसके कारण छिद्र बनाने वाला विष बाइनरी टॉक्सिन (एबी विष) भी है, किंतु बीमारी में इसकी भूमिका पूर्ण रूप से समझ में नहीं आती है।

इसके अतिरिक्त विषाणु कारकों में एक आसंजन कारक सम्मिलित होता है, जो इस प्रकार मानव कोलोनिक कोशिकाओं और एक हाइलूरोनिडेज़ के बंधन में मध्यस्थता करता है। जीवाणु रासायनिक पैरा-क्रेसोल भी उत्पन्न करता है, जो इसके आसपास के क्षेत्र में अन्य रोगाणुओं के विकास को रोकता है और इसे सामान्य मानव आंत वनस्पतियों से आगे निकलने की अनुमति देता है।

सी डिफ संक्रमण का एंटीबायोटिक दवाओं उपचार कठिन हो सकता है, एंटीबायोटिक प्रतिरोध और जीवाणु के शारीरिक कारकों (बीजाणु निर्माण, स्यूडोमेम्ब्रेन के सुरक्षात्मक प्रभाव) दोनों के कारण होता हैं। इसके आधार पर सिप्रोफ्लोक्सासिं और  लिवोफ़्लॉक्सासिन जैसे  फ़्लोरोक्विनोलोन एंटीबायोटिक दवाओं के प्रति प्रतिरोधी सी डिफिसाइल के एक नए, अत्यधिक जहरीले तनाव के उद्भव की सूचना 2005 में दी गई थी, जिसके बारे में कहा जाता है कि यह उत्तरी अमेरिका में भौगोलिक रूप से फैले हुए प्रकोप का कारण बन रहा है। इस प्रकार अटलांटा में अमेरिकी रोग नियंत्रण केंद्र ने बढ़ी हुई विषाक्तता, एंटीबायोटिक प्रतिरोध या दोनों के साथ एक महामारी तनाव के उद्भव की चेतावनी दी है। इस प्रकार सीडीआई का उपचार करते समय रोगाणुरोधी दवा की पहली पसंद मेट्रोनिडाजोल जैसे अन्य एंटीबायोटिक दवाओं के प्रति प्रतिरोध 12% क्लिनिकल आइसोलेट्स में देखा गया है, इसलिए जैसे-जैसे विभिन्न एंटीबायोटिक दवाओं के साथ उपचार जारी रहेगा, अधिक विविध और मजबूत प्रतिरोध निरंतर रहेगा। इस प्रकार सी डिफिसाइल आबादी में विकसित होना, प्रभावी उपचार के प्रयासों को और अधिक जटिल बना रहा है।

संचरण
क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल मौखिक मार्ग से मल के माध्यम से एक व्यक्ति या जानवर से दूसरे व्यक्ति में फैलता है। इस प्रकार जीव गर्मी-प्रतिरोधी बीजाणु बनाता है जो अल्कोहल-आधारित हाथ क्लीनर या नियमित सतह की सफाई से नहीं मरते हैं, इस प्रकार, ये बीजाणु लंबे समय तक नैदानिक ​​वातावरण में जीवित रहते हैं। इस प्रकार किसी भी सतह, उपकरण या सामग्री (जैसे, शौचालय, स्नान टब और इलेक्ट्रॉनिक रेक्टल थर्मामीटर) जो मल से दूषित हो जाती है, सी डिफिसाइल बीजाणुओं के लिए भंडार के रूप में कार्य कर सकती है, और इस प्रकार सी डिफिसाइल बीजाणु लंबे समय तक जीवित रह सकते हैं। निम्न सतहों के कारण जीवाणु को लगभग किसी भी सतह से संवर्धित किया जा सकता है। इस प्रकार यहाँ पर जब बीजाणु अंतर्ग्रहण हो जाते हैं, तो उनका एसिड प्रतिरोध उन्हें बिना किसी हानि के पेट से गुजरने की अनुमति देता है। पित्त अम्लों के संपर्क में आने पर वे बृहदान्त्र में अंकुरित होते हैं, और इस प्रकार वनस्पति कोशिकाओं में विकसित होते हैं। इसके परिणामस्वरूप विश्व स्वास्थ्य संगठन बीजाणुओं के प्रसार को सीमित करने के लिए अल्कोहल समाधान के अतिरिक्त साबुन के उपयोग की वकालत करता है। इस प्रकार सी डिफिसाइल के डीएनए मिथाइलट्रांसफेरेज़ कैमा के निष्क्रिय होने के पश्चात स्पोरुलेशन में काफी कमी देखी गई हैं, यह ऐसी दवा विकसित करने की संभावना बढ़ाना जो इस जीवाणु को एक विशिष्ट तरीकों से रोक सके।

ऐसा प्रतीत होता है कि उपनिवेशीकरण की संवेदनशीलता डायरिया संबंधी बीमारियों से उत्पन्न होती है, जैसे कि खाद्य-विषाक्तता या रेचक दुरुपयोग, जिन लोगों में डायरिया संबंधी बीमारियों का इतिहास नहीं है, जो सी डिफिसाइल बीजाणुओं के संपर्क में हैं, यह आवश्यक नहीं हैं कि वे इसके वाहक बनें। इस प्रकार एक बार जब लोग सी डिफिसाइल द्वारा उपनिवेशित हो जाते हैं, तो वे साल भर के समय के पैमाने पर वाहक बने रहते हैं, किंतु सी डिफिसाइल की दिन-प्रतिदिन प्रचुरता में काफी उतार-चढ़ाव होता है, इसका पता लगाने की सीमा से नीचे होने से लेकर एक दिन से उच्च स्तर के बहाव तक उतार-चढ़ाव होता है। इसपर वाहकों में जठरांत्र संबंधी रोग के कारण स्राव में वृद्धि की अवधि प्रारंभ हो जाती है जो संचरण के लिए महत्वपूर्ण कारक हो सकता है।

होस्ट रेंज
क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल सूअरों, बछड़ों और मनुष्यों को संक्रमित करता है, और मिट्टी, घरेलू जानवरों और मनुष्यों के मल, मल, मानव आंत्र पथ और खुदरा मांस के प्राकृतिक भंडार में रहता है।

2015 के सीडीसी अध्ययन में अनुमान लगाया गया है कि सी. ने लगभग आधे मिलियन अमेरिकियों को पीड़ित किया और 2011 में 29,000 लोगों की मौत हुई। इस प्रकार इस अध्ययन का अनुमान यह है कि 40% स्थितियों में नर्सिंग होम या सामुदायिक स्वास्थ्य देखभाल सेटिंग्स में प्रारंभ हुए, जबकि 24% अस्पतालों में हुए थे।

क्लोस्ट्रीडियोइड्स डिफिसाइल मानव पाचन तंत्र में आम है। चूंकि, यह एक ख़राब प्रतियोगी है, और अक्सर पाचन तंत्र में अन्य जीवाणुओं द्वारा पोषक तत्वों की स्थिति में मात खा जाता है। परिणामस्वरूप, सी डिफिसाइल को एक प्रबंधनीय संख्या में रखा जाता है। यदि एंटीबायोटिक का अचानक परिचय माइक्रोबायोम को बाधित करता है, तो इस प्रकार सी डिफिसाइल अपने कई प्रतिस्पर्धियों के मारे जाने के परिणामस्वरूप बढ़ने में सक्षम हो सकता है। ऊष्मायन अवधि 5-10 दिन है, जिसमें एंटीबायोटिक से जुड़े दस्त के लिए एंटीबायोटिक उपचार के बाद 1 दिन से लेकर सप्ताह तक का समय होता है। इसके अतिरिक्त, उच्च स्तर के विषाक्त पदार्थों के साथ सी डिफिसाइल का संचरण छोटे बच्चों में आम है, जबकि बीमारी दुर्लभ है। लक्षण उत्पन्न करने के लिए एक या दोनों विषाक्त पदार्थों का उत्पादन सदैव पर्याप्त नहीं होता है।

संकेत और लक्षण
सी डिफिसाइल संक्रमण के लक्षणों में सम्मिलित हैं: दस्त (जो कि दिन में कम से कम तीन बार मल त्यागना), निर्जलीकरण, पेट में दर्द जो गंभीर हो सकता है, भूख न लगना और मतली इत्यादि हो सकती हैं।

प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया
सी डिफिसाइल स्रावित विषाक्त पदार्थ ए (टीसीडीए) और बी (टीसीडीबी) में इम्युनोजेनिक एंटीजन होते हैं जिन्हें एंटीबॉडी और टी कोशिकाओं द्वारा पहचाना जाता है। चूंकि, एंटी-टीसीडीए और -टीसीडीबी आईजीजी एंटीबॉडी का स्तर स्वस्थ व्यक्तियों को सी डिफिसाइल संक्रमण वाले रोगियों से अलग करने में सक्षम नहीं है, जिसका अर्थ है कि उनका नैदानिक ​​उपयोग सीमित है। वर्तमान समय के कार्य से पता चला है कि इन विषाक्त पदार्थों को सहायक Cd4+ टी कोशिकाओं द्वारा भी पहचाना जाता है, मुख्य रूप से टी हेल्पर 17 कोशिका या टीh द्वारा की जाती हैं। इस प्रकार17 सहायक कोशिकाएँ, जो आंत के स्वस्थ वातावरण को बनाए रखने में महत्वपूर्ण हैं, चूंकि गंभीर संक्रमण वाले रोगियों में ये कोशिकाएँ क्षीण हो जाती हैं। यहाँ पर रोचक बात यह है कि गंभीर सी डिफिसाइल संक्रमण वाले व्यक्तियों में हल्के संक्रमण वाले लोगों की तुलना में अत्यधिक विष-विशिष्ट टी कोशिकाएं थीं, जो दर्शाता है कि टी कोशिकाएं इस संक्रमण से लड़ने में महत्वपूर्ण भूमिका निभा रही हैं। इस प्रकार यह प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया माइक्रो आरएनए अभिव्यक्ति को और अधिक ख़राब कर सकती है। गंभीर बीमारी वाले रोगियों के फेकल माइक्रोबायोटा प्रत्यारोपण के बाद विष-विशिष्ट Th17 कोशिकाओं और माइक्रोआरएनए अभिव्यक्ति की पुनर्प्राप्ति से इसका प्रमाण मिलता है।

उपचार
इस कारण किसी प्रकार के लक्षण प्रारंभ होने पर एंटीबायोटिक दवाओं से उपचार करा रहे मरीजों को यदि संभव हो तो उन्हें लेना बंद कर देना चाहिए। इस प्रकार एंटीबायोटिक थेरेपी में यह रुकावट कभी-कभी लक्षणों के सहज समाधान का कारण बन सकती है। इस प्रकार जिन मरीजों पर ब्रॉड-स्पेक्ट्रम एंटीबायोटिक दवाओं के बंद होने पर कोई प्रतिक्रिया नहीं होती है, उन्हें सी डिफिसाइल बीजाणुओं को मारने में सक्षम एंटीबायोटिक दवाओं से उपचार करने की आवश्यकता होगी। इसके आधार पर प्राथमिक संक्रमणों का उपचार सामान्य रूप से वैनकोमाइसिन से किया जाता है, जिसकी सामान्य खुराक हर 6 घंटे में 125 मिलीग्राम होती है। वैनकॉमायसिन आहार ने अपनी अधिक प्रभावकारिता, सुरक्षा प्रोफ़ाइल और कम पुनरावृत्ति दर के कारण मेट्रोनाइडाजोल के पारंपरिक उपयोग को प्रतिस्थापित कर दिया है। उन रोगियों में जो वैनकोमाइसिन को सहन नहीं कर सकते हैं, फ़िडाक्सोमिसिन समान प्रभावकारिता और वैनकोमाइसिन की तुलना में कम पुनरावृत्ति दर के साथ एक स्वीकार्य विकल्प है। इस प्रकार फुलमिनेंट सीडीआई के मामलों में, पैरेंट्रल मेट्रोनिडाजोल प्लस ओरल वैनकोमाइसिन या फिडाक्सोमिसिन के साथ सहायक चिकित्सा का सुझाव दिया जाता है।

लगभग 20% मरीज़ जो मेट्रोनिडाज़ोल या वैनकोमाइसिन के साथ प्राथमिक संक्रमण का उपचार सफलतापूर्वक पूरा करते हैं, उन्हें दोबारा संक्रमण का अनुभव होगा। उन रोगियों का एक भाग क्रमशः संक्रमण की पुनरावृत्ति का अनुभव करेगा। सी डिफिसाइल की पहली पुनरावृत्ति का उपचार सामान्य रूप से उसी एंटीबायोटिक से किया जाता है जिसका उपयोग प्राथमिक संक्रमण के उपचार के लिए किया जाता है। इसके बाद के किसी भी संक्रमण का उपचार मेट्रोनिडाजोल से नहीं किया जाना चाहिए। इस प्रकार कभी-कभी, मौखिक वैनकोमाइसिन का मानक 10-दिवसीय कोर्स कार्य नहीं करेगा। इन स्थितियों में, वैनकोमाइसिन टेपर पसंदीदा उपचार है। संक्रमण की गंभीरता के आधार पर, मरीज़ 3 महीने तक की अवधि में वैनकोमाइसिन की घटती खुराक लेते हैं।

सी डिफिसाइल की प्रत्येक बाद की पुनरावृत्ति पिछले संक्रमणों की तुलना में अधिक गंभीर होती है। इस प्रकार प्रोबायोटिक्स, विशेष रूप से सैक्रोमाइसेस बौलार्डी के साथ पूरक वैनकोमाइसिन टेपर के साथ दीर्घकालिक उपचार, सफलता की उच्च दर के साथ जुड़ा हुआ है।

तीन पुनरावृत्तियों के बाद, रोगियों को मौखिक फ़िडाक्सोमिसिन, एक संकीर्ण-स्पेक्ट्रम एंटीबायोटिक, के साथ उपचार किया जा सकता है। सामान्य खुराक 10 दिनों के लिए दिन में दो बार मौखिक रूप से 200 मिलीग्राम है। इसके कारण गंभीर सीडीआई के लिए फिडाक्सोमिसिन को वैनकोमाइसिन से उत्तम माना जाता है। फ़िडाक्सोमिसिन से उपचार का प्रमुख नकारात्मक पक्ष दवा की लागत है। 10-दिवसीय पाठ्यक्रम की लागत US$3500 तक हो सकती है।

जिन मरीजों पर पारंपरिक एंटीबायोटिक थेरेपी का प्रभाव नहीं होता, वे फेकल माइक्रोबायोटा ट्रांसप्लांट (एफएमटी) के लिए पात्र हो सकते हैं। इस प्रकार की स्वास्थ्य सेवा प्रदाता बार-बार सीडीआई वाले रोगी के मल को एक स्वस्थ व्यक्ति से रोगी के बृहदान्त्र में स्थानांतरित कर सकते हैं। यह प्रक्रिया लगभग 93% उपचार दर के साथ गंभीर सीडीआई के लिए सबसे सफल उपचार है। एफएमटी से उपचारित रोगियों में सीडीआई की पुनरावृत्ति दर सामान्यतः कम, लगभग 19% होती है, जो इसे पुराने सीडीआई स्थितियों के उपचार में बहुत प्रभावी बनाती है। चूंकि इस प्रकार कुछ स्थितियों में, सूजन आंत्र रोग की भड़कना उपचार का एक संभावित दुष्प्रभाव है। इस प्रकार एफएमटी के दीर्घकालिक प्रभाव अज्ञात हैं, क्योंकि प्रक्रिया को 2011 से केवल एफडीए-अनुमोदित किया गया है और अपेक्षाकृत कुछ प्रक्रियाएं निष्पादित की गई हैं। यदि प्रत्यारोपण कोई विकल्प नहीं है, तो बृहदान्त्र के संक्रमित हिस्से को हटाने से सीडीआई ठीक हो सकता है।

उपभेद
2005 में, आणविक विश्लेषण से सी डिफिसाइल स्ट्रेन प्रकार की पहचान हुई, जिसे प्रतिबंध एंजाइम विश्लेषण द्वारा समूह बीआई के रूप में जाना जाता है। स्पंदित-क्षेत्र जेल वैद्युतकणसंचलन द्वारा उत्तरी अमेरिकी पल्स-फील्ड-प्रकार एनएपी1 के रूप में और रिबोटाइपिंग 027 के रूप में, अलग-अलग शब्दावली महामारी विज्ञान टाइपिंग के लिए उपयोग की जाने वाली प्रमुख तकनीकों को दर्शाती है। इस स्ट्रेन को सी डिफिसाइल बीआई/एनएपी1/027 कहा जाता है।

2016 तक, ब्रिटिश कोलंबिया के कुछ क्षेत्रों में एनएपी1 स्ट्रेन को नए स्ट्रेन से बदल दिया गया है। इस प्रकार इन नवीन उपभेदों में एनएपी2 और एनएपी4 सम्मिलित हैं, और कुछ उपभेदों में एनएपी पदनाम नहीं है। इस प्रकार अध्ययन किए गए एक क्षेत्र में इन नए उपभेदों की आवृत्ति 2008 से 2013 तक बढ़ गई थी, जिससे मूल रूप से अधिक सामान्य और पहचाने जाने योग्य एनएपी1 बैक्टीरिया विस्थापित हो गए थे।

दो उपभेद, राइबोटाइप आरटी078 और आरटी027, चीनी ट्रीहाल्सो की कम सांद्रता पर जीवित रह सकते हैं, 2000 के दशक के प्रारंभ में ट्रेहलोज़ को खाद्य योज्य के रूप में प्रस्तुत किए जाने के पश्चात दोनों उपभेद अधिक आम हो गए, जिससे आहार में ट्रेहलोज़ का सेवन बढ़ गया।

जीनोम
सी डिफिसाइल स्ट्रेन का पहला पूर्ण जीनोम अनुक्रम 2005 में यूके में सेंगर संस्थान द्वारा प्रकाशित किया गया था। इस प्रकार यह दबाव 630 का था, जो 1982 में स्विट्ज़रलैंड में अलग किया गया एक विषैला और कई दवा-प्रतिरोधी स्ट्रेन था। इस प्रकार सेंगर इंस्टीट्यूट के वैज्ञानिकों ने 454 लाइफ साइंसेज और इलुमिना (कंपनी) की अगली पीढ़ी की अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके लगभग 30 सी डिफिसाइल आइसोलेट्स के जीनोम को अनुक्रमित किया है।

मॉन्ट्रियल में मैकगिल विश्वविद्यालय के शोधकर्ताओं ने अल्ट्रा-हाई थ्रूपुट अनुक्रमण तकनीक का उपयोग करके 2005 में सी डिफिसाइल के अत्यधिक विषैले क्यूबेक तनाव के जीनोम को अनुक्रमित किया गया था। इस प्रकार परीक्षणों में जीवाणु के जीनोम की 400,000 डीएनए समानांतर-अनुक्रमण प्रतिक्रियाएं करना सम्मिलित था, जिन्हें इस प्रकार अनुक्रमण के लिए खंडित किया गया था। इस प्रकार संपूर्ण जीनोम अनुक्रम बनाने के लिए इन अनुक्रमों को कम्प्यूटेशनल रूप से एकत्रित किये गये थे।

2012 में, ऑक्सफ़ोर्ड विश्वविद्यालय के वैज्ञानिकों ने इलुमिना की अगली पीढ़ी की अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके ऑक्सफ़ोर्डशायर में चार वर्षों में उत्पन्न हुए 486 स्थितियों से सी डिफिसाइल जीनोम का अनुक्रमित किया गया था।

एपिजेनोम
क्लॉस्ट्रिडिओइड्स डिफिसाइल में अत्यधिक विविध एपिजेनोम है, जिसमें अब तक 17 उच्च-गुणवत्ता वाले मेथिलिकरण रूपांकनों की सूचना दी गई है, जिनमें से अधिकांश 6मिलीएम्पियर प्रकार से संबंधित हैं। इस प्रकार इन रूपांकनों में से एक - सीएएएएए, पर मिथाइलेशन को स्पोरुलेशन पर प्रभाव डालने के लिए दिखाया गया था, जो सी डिफिसाइल रोग संचरण में महत्वपूर्ण कदम है, इसके साथ ही कोशिका की लंबाई, बायोफिल्म निर्माण और मेजबान उपनिवेशण भी है।

जीवाणुभोजी
कम से कम आठ मुख्य रूप से शीतोष्णता (वायरोलॉजी) बैक्टीरियोफेज को सी डिफिसाइल से अलग किया गया है, जिनका जीनोम आकार लगभग 30 से लेकर लगभग 60 बेस पेयर तक है। इस प्रकार पर्यावरण और चिकित्सकीय रूप से व्युत्पन्न सी डिफिसाइल उपभेदों में विविध और प्रचलित प्रसार का समूह होता है।

बाहरी संबंध

 * Pathogen Safety Data Sheets: Infectious Substances – Clostridium Difficile, Public Health Agency, Canada, 10 September 2014.
 * Type strain of Clostridium difficile, BacDive - the Bacterial Diversity Metadatabase.