प्लाज्मिड

प्लाज्मिड एक कोशिका के भीतर एक छोटा, एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए अणु होता है जो शारीरिक रूप से डीएनए से अलग होता है और स्वतंत्र रूप से दोहरा सकता है। वे सामान्यतौर पर जीवाणु में छोटे गोलाकार, डबल-स्ट्रैंडेड डीएनए अणुओं के रूप में पाए जाते हैं; चूकि,प्लास्मिड कभी-कभी आर्किया और यूकेरियोट में उपस्थित होते हैं। प्रकृति में,प्लास्मिड में अधिकांशतः ऐसे जीन होते हैं जो जीव के अस्तित्व को लाभ पहुंचाते हैं और एंटीबायोटिक प्रतिरोध जैसे चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। चूकि गुणसूत्र बड़े होते हैं और सामान्य परिस्थितियों में रहने के लिए सभी आवश्यक अनुवांशिक जानकारी होते हैं, प्लास्मिड सामान्यतौर पर बहुत छोटे होते हैं और केवल अतिरिक्त जीन होते हैं जो कुछ स्थितियों या स्थितियों में उपयोगी हो सकते हैं। आणविक क्लोनिंग में कृत्रिम प्लास्मिड का व्यापक रूप से सदिश (आणविक जीव विज्ञान) के रूप में उपयोग किया जाता है, जो मेजबान जीवों के भीतर पुनः संयोजक डीएनए अनुक्रमों की प्रतिकृति को चलाने के लिए काम करता है। प्रयोगशाला में, प्लास्मिड को परिवर्तन (आनुवांशिकी) के माध्यम से एक कोशिका में पेश किया जा सकता है। इंटरनेट पर खरीद के लिए सिंथेटिक प्लास्मिड उपलब्ध होता हैं। प्लास्मिड को प्रतिकृति (आनुवांशिकी) माना जाता है, डीएनए की इकाइयां उपयुक्त मेजबान के भीतर स्वायत्त रूप से प्रतिकृति बनाने में सक्षम होता हैं। चूकि, प्लास्मिड, वाइरस की तरह, जीवन के रूप में वर्गीकृत नहीं होते हैं। प्लास्मिड एक जीवाणु से दूसरे जीवाणु (यहां तक ​​कि अन्य प्रजातियों के भी) में ज्यादातर जीवाणु संयुग्मन के माध्यम से प्रेषित होते हैं। आनुवंशिक सामग्री का यह होस्ट-टू-होस्ट स्थानांतरण क्षैतिज जीन स्थानांतरण का एक तंत्र है, और प्लास्मिड को मोबिलोमा का हिस्सा माना जाता है। वायरस के विपरीत, जो एक कैप्सिड नामक एक सुरक्षात्मक प्रोटीन कोट में अपनी आनुवंशिक सामग्री को घेरते हैं, प्लास्मिड नग्न डीएनए होते हैं और एक नए मेजबान को स्थानांतरित करने के लिए आनुवंशिक सामग्री को घेरने के लिए आवश्यक जीन को एनकोड नहीं करते हैं; चूकि, प्लाज्मिड्स के कुछ वर्ग अपने स्वयं के स्थानांतरण के लिए आवश्यक पाइलस संयुग्मी लिंग पाइल्स को कूटबद्ध करते हैं। प्लास्मिड आकार में 1 से 400 केबेस जोड़ी से भिन्न होते हैं, और एक ही कोशिका (जीव विज्ञान) में समान प्लाज्मिड की संख्या कुछ परिस्थितियों में एक से लेकर हजारों तक कहीं भी हो सकती है।

इतिहास
प्लाज्मिड शब्द 1952 में अमेरिकी आणविक जीव विज्ञान जोशुआ लेडरबर्ग द्वारा किसी भी एक्स्ट्राक्रोमोसोमल वंशानुगत निर्धारक को संदर्भित करने के लिए पेश किया गया था। शब्द के शुरुआती उपयोग में कोई भी जीवाणु आनुवंशिक सामग्री शामिल थी जो अपने प्रतिकृति चक्र के कम से कम भाग के लिए अतिरिक्त क्रोमोसोमल रूप से मौजूद थी, लेकिन क्योंकि उस विवरण में जीवाणु वायरस शामिल हैं, समय के साथ प्लाज्मिड की धारणा को परिष्कृत किया गया ताकि आनुवंशिक तत्वों को शामिल किया जा सके जो स्वायत्त रूप से पुनरुत्पादन करते हैं। बाद में 1968 में, यह निर्णय लिया गया कि प्लाज्मिड शब्द को एक्स्ट्राक्रोमोसोमल आनुवंशिक तत्व के लिए शब्द के रूप में अपनाया जाना चाहिए, और इसे वायरस से अलग करने के लिए, परिभाषा को आनुवंशिक तत्वों तक सीमित कर दिया गया था जो क्रोमोसोम के बाहर विशेष रूप से या मुख्य रूप से मौजूद होते हैं और स्वायत्त रूप से दोहरा सकते हैं।

गुण और विशेषताएं
एक कोशिका के भीतर स्वतंत्र रूप से प्लाज्मिड्स को दोहराने के लिए, उनके पास डीएनए का एक खंड होना चाहिए जो प्रतिकृति की उत्पत्ति के रूप में कार्य कर सके। स्व-प्रतिकृति इकाई, इस मामले में, प्लाज्मिड, को रेप्लिकॉन (आनुवांशिकी) कहा जाता है। एक विशिष्ट बैक्टीरियल प्रतिकृति में कई तत्व शामिल हो सकते हैं, जैसे कि प्लाज्मिड-विशिष्ट प्रतिकृति दीक्षा प्रोटीन (रेप) के लिए जीन, दोहराई जाने वाली इकाइयाँ जिन्हें इटरॉन, डीएनएए बॉक्स और एक आसन्न एटी-समृद्ध क्षेत्र कहा जाता है। छोटे प्लास्मिड मेजबान प्रतिकृति एंजाइमों का उपयोग स्वयं की प्रतियां बनाने के लिए करते हैं, जबकि बड़े प्लास्मिड उन प्लास्मिडों की प्रतिकृति के लिए विशिष्ट जीन ले सकते हैं। कुछ प्रकार के प्लास्मिड भी मेजबान गुणसूत्र में सम्मिलित हो सकते हैं, और इन एकीकृत प्लास्मिडों को कभी-कभी प्रोकैरियोट्स में प्रकरण के रूप में संदर्भित किया जाता है। प्लास्मिड में लगभग हमेशा कम से कम एक जीन होता है। प्लाज्मिड द्वारा ले जाने वाले कई जीन मेजबान कोशिकाओं के लिए फायदेमंद होते हैं, उदाहरण के लिए: मेजबान सेल को ऐसे वातावरण में जीवित रहने में सक्षम बनाना जो अन्यथा विकास के लिए घातक या प्रतिबंधित होगा। इनमें से कुछ जीन एंटीबायोटिक प्रतिरोध या भारी धातु के प्रतिरोध के लिए लक्षणों को कूटबद्ध करते हैं, जबकि अन्य उग्रता कारक पैदा कर सकते हैं जो एक जीवाणु को एक मेजबान को उपनिवेश बनाने और इसके बचाव को दूर करने में सक्षम बनाता है या विशिष्ट चयापचय कार्य करता है जो जीवाणु को एक विशेष पोषक तत्व का उपयोग करने की अनुमति देता है, जिसमें शामिल हैं अड़ियल या जहरीले कार्बनिक यौगिकों को नीचा दिखाने की क्षमता। प्लास्मिड बैक्टीरिया को नाइट्रोजन स्थिरीकरण की क्षमता भी प्रदान कर सकते हैं। हालांकि, कुछ प्लास्मिडों का मेजबान कोशिका के फेनोटाइप पर कोई प्रत्यक्ष प्रभाव नहीं होता है या मेजबान कोशिकाओं को इसका लाभ निर्धारित नहीं किया जा सकता है, और इन प्लास्मिडों को क्रिप्टिक प्लास्मिड कहा जाता है। स्वाभाविक रूप से होने वाले प्लास्मिड उनके भौतिक गुणों में बहुत भिन्न होते हैं। उनका आकार 1-किलोबेस जोड़े (केबीपी) से कम के बहुत छोटे मिनी-प्लास्मिड से लेकर कई मेगाबेस जोड़े (एमबीपी) के बहुत बड़े मेगाप्लास्मिड तक हो सकता है। ऊपरी छोर पर, मेगाप्लास्मिड और मिनीक्रोमोसोम के बीच थोड़ा अंतर होता है। प्लास्मिड आमतौर पर गोलाकार होते हैं, लेकिन रैखिक प्लास्मिड के उदाहरण भी ज्ञात हैं। इन रैखिक प्लास्मिडों को अपने सिरों को दोहराने के लिए विशेष तंत्र की आवश्यकता होती है।

प्लाज्मिड अलग-अलग संख्या में एक व्यक्तिगत कोशिका में मौजूद हो सकते हैं, एक से लेकर कई सौ तक। प्लाज्मिड की प्रतियों की सामान्य संख्या जो एक कोशिका में पाई जा सकती है, प्लाज्मिड प्रतिलिपि संख्या कहलाती है, और यह इस बात से निर्धारित होती है कि प्रतिकृति दीक्षा कैसे विनियमित होती है और अणु का आकार। बड़े प्लाज्मिडों की प्रतिलिपी संख्या कम होती है। कोशिका विभाजन पर प्रत्येक जीवाणु में केवल एक या कुछ प्रतियों के रूप में मौजूद कम-प्रतिलिपि-संख्या प्लास्मिड, अलग-अलग बैक्टीरिया में से एक में खो जाने के खतरे में हैं। ऐसे सिंगल-कॉपी प्लास्मिड में ऐसे सिस्टम होते हैं जो सक्रिय रूप से दोनों बेटी कोशिकाओं को कॉपी वितरित करने का प्रयास करते हैं। इन प्रणालियों, जिनमें पैराएबीएस सिस्टम और पैराएमआरसी सिस्टम शामिल हैं, को अक्सर प्लास्मिड विभाजन प्रणाली या प्लास्मिड के विभाजन समारोह के रूप में जाना जाता है।

रैखिक रूप के प्लास्मिड एक अपवाद के साथ फाइटोपैथोजेन के बीच अज्ञात हैं, रोडोकोकस फासियन

वर्गीकरण और प्रकार
प्लास्मिड को कई तरीकों से वर्गीकृत किया जा सकता है। प्लास्मिड को मोटे तौर पर संयुग्मी प्लास्मिड और गैर-संयुग्मक प्लास्मिड में वर्गीकृत किया जा सकता है। संयुग्मी प्लास्मिड में स्थानांतरण जीन का एक सेट होता है जो विभिन्न कोशिकाओं के बीच यौन संयुग्मन को बढ़ावा देता है। बैक्टीरियल संयुग्मन की जटिल प्रक्रिया में, प्लास्मिड को एक जीवाणु से दूसरे में पाइलस # कंजुगेटिव पिली के माध्यम से स्थानांतरित किया जा सकता है जो कुछ स्थानांतरण जीनों द्वारा एन्कोड किया गया है (आंकड़ा देखें)। गैर-संयुग्मक प्लास्मिड संयुग्मन आरंभ करने में असमर्थ होते हैं, इसलिए उन्हें केवल संयुग्मी प्लास्मिड की सहायता से स्थानांतरित किया जा सकता है। प्लास्मिड का एक मध्यवर्ती वर्ग गतिशील होता है, और स्थानांतरण के लिए आवश्यक जीन का केवल एक सबसेट ले जाता है। वे एक संयुग्मक प्लाज्मिड को परजीवी बना सकते हैं, केवल इसकी उपस्थिति में उच्च आवृत्ति पर स्थानांतरित कर सकते हैं।

प्लास्मिड को असंगति समूहों में भी वर्गीकृत किया जा सकता है। एक माइक्रोब विभिन्न प्रकार के प्लास्मिडों को आश्रय दे सकता है, लेकिन विभिन्न प्लास्मिड केवल एक जीवाणु कोशिका में ही मौजूद हो सकते हैं यदि वे संगत हों। यदि दो प्लास्मिड संगत नहीं हैं, तो एक या दूसरा कोशिका से तेजी से नष्ट हो जाएगा। इसलिए अलग-अलग प्लास्मिड को अलग-अलग असंगति समूहों को सौंपा जा सकता है, जो इस बात पर निर्भर करता है कि वे एक साथ सह-अस्तित्व में रह सकते हैं या नहीं। असंगत प्लास्मिड (समान असंगति समूह से संबंधित) सामान्य रूप से एक ही प्रतिकृति या विभाजन तंत्र साझा करते हैं और इस प्रकार एक ही सेल में एक साथ नहीं रखा जा सकता है। प्लाज्मिड्स को वर्गीकृत करने का दूसरा तरीका कार्य है। पाँच मुख्य वर्ग हैं:
 * फर्टिलिटी एफ प्लाज्मिड, जिनमें ट्रा जीन होते हैं। वे बैक्टीरियल संयुग्मन में सक्षम हैं और परिणामस्वरूप पाइलस # संयुग्मक पिली की अभिव्यक्ति होती है।
 * प्रतिरोध (आर) प्लास्मिड, जिसमें जीन होते हैं जो एंटीबायोटिक्स या जीवाणुरोधी एजेंटों के खिलाफ प्रतिरोध प्रदान करते हैं। प्लास्मिड की प्रकृति को समझने से पहले ऐतिहासिक रूप से आर-कारक के रूप में जाना जाता है।
 * कोल प्लास्मिड, जिसमें जीन होते हैं जो बैक्टीरियोसिन्स, प्रोटीन के लिए कोड होते हैं जो अन्य जीवाणुओं को मार सकते हैं।
 * अपक्षयी प्लास्मिड, जो असामान्य पदार्थों के पाचन को सक्षम करते हैं, उदा। टोल्यूनि और चिरायता का तेजाब ।
 * विषाणु प्लास्मिड, जो जीवाणु को रोगज़नक़ में बदल देते हैं। उदा. एग्रोबैक्टीरियम ट्यूमेफेशियन्स में आप प्लाज्मिड

प्लास्मिड इनमें से एक से अधिक कार्यात्मक समूहों से संबंधित हो सकते हैं।

आरएनए प्लास्मिड
हालांकि अधिकांश प्लास्मिड डबल-स्ट्रैंडेड डीएनए अणु होते हैं, कुछ में एकल-फंसे डीएनए या मुख्य रूप से डबल फंसे आरएनए होते हैं। आरएनए प्लास्मिड गैर-संक्रामक एक्स्ट्राक्रोमोसोमल रैखिक आरएनए प्रतिकृतियां हैं, जो वायरस जैसे कण और अनकैप्सिडेटेड दोनों हैं, जो कवक और विभिन्न पौधों में, शैवाल से भूमि के पौधों में पाए गए हैं। हालांकि, कई मामलों में, आरएनए प्लास्मिड को आरएनए वायरस और अन्य संक्रामक आरएनए से स्पष्ट रूप से अलग करना मुश्किल या असंभव हो सकता है।

क्रोमिड्स
क्रोमिड ऐसे तत्व हैं जो क्रोमोसोम और प्लास्मिड के बीच की सीमा पर मौजूद होते हैं, जो 2009 तक लगभग 10% जीवाणु प्रजातियों में पाए जाते हैं। ये तत्व कोर जीन ले जाते हैं और क्रोमोसोम के समान कोडन उपयोग करते हैं, फिर भी एक प्लास्मिड-प्रकार प्रतिकृति तंत्र का उपयोग करते हैं जैसे निम्न प्रतिलिपि संख्या RepABC के रूप में। नतीजतन, अतीत में उन्हें मिनीक्रोमोसोम या मेगाप्लास्मिड के रूप में विभिन्न रूप से वर्गीकृत किया गया है। विब्रियो में, जीवाणु एक संरक्षित जीनोम आकार अनुपात द्वारा क्रोमोसोम और क्रोमिड की प्रतिकृति को सिंक्रनाइज़ करता है।

वैक्टर
जेनेटिक इंजीनियरिंग में कृत्रिम रूप से निर्मित प्लास्मिड को वेक्टर (आणविक जीव विज्ञान) के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है। ये प्लास्मिड आनुवंशिकी और जैव प्रौद्योगिकी प्रयोगशालाओं में महत्वपूर्ण उपकरण के रूप में काम करते हैं, जहां वे आमतौर पर क्लोन और प्रवर्धित (कई प्रतियां बनाने) या जीन अभिव्यक्ति विशेष जीन के लिए उपयोग किए जाते हैं। इस तरह के उपयोगों के लिए व्यावसायिक रूप से प्लास्मिड की एक विस्तृत विविधता उपलब्ध है। प्रतिकृति किए जाने वाले जीन को आम तौर पर एक प्लाज्मिड में डाला जाता है जिसमें आमतौर पर उनके उपयोग के लिए कई विशेषताएं होती हैं। इनमें एक जीन शामिल है जो विशेष एंटीबायोटिक दवाओं के लिए प्रतिरोध प्रदान करता है (एम्पीसिलीन अक्सर जीवाणु उपभेदों के लिए उपयोग किया जाता है), प्रतिकृति की उत्पत्ति बैक्टीरिया कोशिकाओं को प्लास्मिड डीएनए को दोहराने की अनुमति देती है, और क्लोनिंग के लिए एक उपयुक्त साइट (एक बहु क्लोनिंग साइट के रूप में संदर्भित) ).

डीएनए संरचनात्मक अस्थिरता को सहज घटनाओं की एक श्रृंखला के रूप में परिभाषित किया जा सकता है जो एक अप्रत्याशित पुनर्व्यवस्था, हानि या आनुवंशिक सामग्री के लाभ में परिणत होती है। इस तरह की घटनाओं को अक्सर मोबाइल तत्वों के स्थानान्तरण या गैर-विहित (गैर-बी) संरचनाओं जैसे अस्थिर तत्वों की उपस्थिति से ट्रिगर किया जाता है। बैक्टीरियल रीढ़ से संबंधित गौण क्षेत्र संरचनात्मक अस्थिरता घटना की एक विस्तृत श्रृंखला में संलग्न हो सकते हैं। आनुवंशिक अस्थिरता के जाने-माने उत्प्रेरकों में प्रत्यक्ष, उल्टा और अग्रानुक्रम दोहराव शामिल हैं, जो व्यावसायिक रूप से उपलब्ध क्लोनिंग और अभिव्यक्ति वैक्टर की एक बड़ी संख्या में विशिष्ट होने के लिए जाने जाते हैं। विलोपन (आनुवांशिकी) और पुनर्व्यवस्था, सक्रियण, नीचे नियमन  या पड़ोसी जीन अभिव्यक्ति को निष्क्रिय करने के लिए सम्मिलन अनुक्रम भी प्लाज्मिड फ़ंक्शन और उपज को गंभीर रूप से प्रभावित कर सकते हैं। इसलिए, बाहरी नॉनकोडिंग डीएनए बैकबोन अनुक्रमों की कमी या पूर्ण उन्मूलन ऐसी घटनाओं के होने की प्रवृत्ति को स्पष्ट रूप से कम कर देगा, और इसके परिणामस्वरूप, प्लास्मिड की समग्र पुनः संयोजक क्षमता।



क्लोनिंग
प्लास्मिड सबसे अधिक इस्तेमाल किया जाने वाला बैक्टीरियल क्लोनिंग वैक्टर हैं। इन क्लोनिंग वैक्टर में एक साइट होती है जो डीएनए के टुकड़े डालने की अनुमति देती है, उदाहरण के लिए एक बहु क्लोनिंग साइट या पॉलीलिंकर जिसमें कई सामान्य रूप से उपयोग किए जाने वाले प्रतिबंध स्थल होते हैं जिनमें डीएनए के टुकड़े लिगेशन (आणविक जीव विज्ञान) हो सकते हैं। रुचि के जीन डालने के बाद, प्लास्मिड को बैक्टीरिया में परिवर्तन (आनुवांशिकी) नामक प्रक्रिया द्वारा पेश किया जाता है। इन प्लास्मिडों में एक चयन योग्य मार्कर होता है, आमतौर पर एक एंटीबायोटिक प्रतिरोध जीन होता है, जो बैक्टीरिया को जीवित रहने और विशेष एंटीबायोटिक युक्त चयनात्मक विकास माध्यम में प्रसार करने की क्षमता प्रदान करता है। परिवर्तन के बाद कोशिकाओं को चयनात्मक मीडिया के संपर्क में लाया जाता है, और केवल प्लाज्मिड वाली कोशिकाएं ही जीवित रह सकती हैं। इस तरह, एंटीबायोटिक्स केवल प्लास्मिड डीएनए वाले बैक्टीरिया का चयन करने के लिए एक फिल्टर के रूप में कार्य करते हैं। क्लोन आवेषण के साथ प्लास्मिड के चयन की सुविधा के लिए वेक्टर में अन्य निशान जीन या रिपोर्टर जीन भी हो सकते हैं। प्लास्मिड युक्त बैक्टीरिया को तब बड़ी मात्रा में उगाया जा सकता है, काटा जा सकता है, और फिर प्लास्मिड तैयारी के विभिन्न तरीकों का उपयोग करके ब्याज के प्लास्मिड को अलग किया जा सकता है।

एक प्लास्मिड क्लोनिंग वेक्टर का उपयोग आमतौर पर 15 बेस पेयर तक के डीएनए अंशों को क्लोन करने के लिए किया जाता है। डीएनए की लंबी लंबाई को क्लोन करने के लिए, लाइसोजेनी जीन के साथ लैम्ब्डा फेज को हटा दिया जाता है, ब्रह्मांड, बैक्टीरियल कृत्रिम गुणसूत्र या यीस्ट कृत्रिम क्रोमोसोम का उपयोग किया जाता है।

प्रोटीन उत्पादन
प्लास्मिड का एक अन्य प्रमुख उपयोग बड़ी मात्रा में प्रोटीन बनाना है। इस मामले में, शोधकर्ता रुचि के जीन को शरण देने वाले प्लाज्मिड युक्त बैक्टीरिया विकसित करते हैं। जिस तरह जीवाणु अपने एंटीबायोटिक प्रतिरोध को प्रदान करने के लिए प्रोटीन का उत्पादन करता है, उसे सम्मिलित जीन से बड़ी मात्रा में प्रोटीन का उत्पादन करने के लिए भी प्रेरित किया जा सकता है। यह प्रोटीन के बड़े पैमाने पर उत्पादन का एक सस्ता और आसान तरीका है, उदाहरण के लिए, इंसुलिन।

जीन थेरेपी
पित्रैक उपचार में संभावित उपचार के रूप में जीन ट्रांसफर के लिए प्लास्मिड का भी उपयोग किया जा सकता है ताकि यह कोशिकाओं में कमी वाले प्रोटीन को व्यक्त कर सके। जीन थेरेपी के कुछ रूपों में मानव जीनोम के भीतर पूर्व-चयनित गुणसूत्र लक्ष्य स्थलों पर उपचारात्मक जीनों को सम्मिलित करने की आवश्यकता होती है। प्लास्मिड वैक्टर कई दृष्टिकोणों में से एक हैं जिनका उपयोग इस उद्देश्य के लिए किया जा सकता है। जिंक फिंगर न्यूक्लियस ़ (ZFNs) डीएनए जीनोम के लिए साइट-विशिष्ट  डबल स्ट्रैंड टूटना  का कारण बनता है और समरूप पुनर्संयोजन का कारण बनता है। जेडएफएन एन्कोडिंग प्लास्मिड्स एक विशिष्ट साइट पर चिकित्सीय जीन देने में मदद कर सकता है ताकि सेल क्षति, कैंसर पैदा करने वाले उत्परिवर्तन, या प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया से बचा जा सके।

रोग मॉडल
चूहे के आनुवंशिक रोग मॉडल बनाने के लिए चूहों के भ्रूण स्टेम कोशिकाओं को आनुवंशिक रूप से इंजीनियर करने के लिए प्लास्मिड का ऐतिहासिक रूप से उपयोग किया गया था। प्लाज्मिड-आधारित तकनीकों की सीमित दक्षता ने अधिक सटीक मानव कोशिका मॉडल के निर्माण में उनके उपयोग को रोक दिया। हालांकि, एडेनो-जुड़े वायरस पुनर्संयोजन तकनीकों और जिंक फिंगर न्यूक्लीज में विकास ने आइसोजेनिक मानव रोग मॉडल की एक नई पीढ़ी के निर्माण को सक्षम किया है।

एपिसोड्स
1958 में फ्रेंकोइस जैकब और एली वोलमैन द्वारा एपिसोम शब्द पेश किया गया था, जो अतिरिक्त-क्रोमोसोमल आनुवंशिक सामग्री को संदर्भित करता है जो स्वायत्त रूप से दोहरा सकता है या क्रोमोसोम में एकीकृत हो सकता है। चूँकि यह शब्द पेश किया गया था, हालाँकि, इसका उपयोग बदल गया है, क्योंकि प्लाज्मिड स्वायत्त रूप से एक्स्ट्राक्रोमोसोमल डीएनए की प्रतिकृति के लिए पसंदीदा शब्द बन गया है। लंदन में 1968 की एक संगोष्ठी में कुछ प्रतिभागियों ने सुझाव दिया कि एपिसोड शब्द को छोड़ दिया जाना चाहिए, हालांकि अन्य लोगों ने अर्थ में बदलाव के साथ इस शब्द का उपयोग जारी रखा। आज, कुछ लेखक प्रोकैरियोट्स के संदर्भ में एक प्लाज्मिड का उल्लेख करने के लिए एपिसोड का उपयोग करते हैं जो क्रोमोसोम में एकीकृत करने में सक्षम है। एकीकृत प्लास्मिड को दोहराया जा सकता है और कई पीढ़ियों के माध्यम से एक सेल में स्थिर रूप से बनाए रखा जा सकता है, लेकिन कुछ स्तर पर, वे एक स्वतंत्र प्लास्मिड अणु के रूप में मौजूद रहेंगे। यूकेरियोट्स के संदर्भ में, एपिसोम शब्द का उपयोग एक गैर-एकीकृत एक्स्ट्राक्रोमोसोमल क्लोज्ड सर्कुलर डीएनए अणु के लिए किया जाता है जिसे नाभिक में दोहराया जा सकता है। वायरस इसके सबसे आम उदाहरण हैं, जैसे कि दाद, एडिनोवायरस और पोलिओमावायरस, लेकिन कुछ प्लास्मिड हैं। अन्य उदाहरणों में असामान्य क्रोमोसोमल टुकड़े शामिल हैं, जैसे कि दोहरा मिनट, जो कृत्रिम जीन प्रवर्धन या पैथोलॉजिक प्रक्रियाओं (जैसे, कैंसर कोशिका परिवर्तन) के दौरान उत्पन्न हो सकते हैं। यूकेरियोट्स में एपिसोड प्रोकैरियोट्स में प्लास्मिड्स के समान व्यवहार करते हैं जिसमें डीएनए को मेजबान सेल के साथ स्थिर रूप से बनाए रखा जाता है और दोहराया जाता है। साइटोप्लाज्मिक वायरल एपिसोड (poxvirus संक्रमण के रूप में) भी हो सकते हैं। कुछ एपिसोड्स, जैसे कि हर्पीसविरस,  जीवाणुभोजी  (बैक्टीरिया फेज वायरस) के समान एक घूमता हुआ घेरा तंत्र में दोहराते हैं। अन्य एक द्विदिश प्रतिकृति तंत्र (थीटा प्रकार प्लास्मिड) के माध्यम से दोहराते हैं। किसी भी मामले में, एपिसोड होस्ट सेल क्रोमोसोम से शारीरिक रूप से अलग रहते हैं।  एपस्टीन बार वायरस  और कपोसी के सरकोमा से जुड़े हर्पीसवायरस सहित कई कैंसर वायरस, कैंसर कोशिकाओं में अव्यक्त, क्रोमोसोमली विशिष्ट एपिसोड के रूप में बनाए रखे जाते हैं, जहां वायरस कैंसर सेल प्रसार को बढ़ावा देने वाले ओंकोजीन को व्यक्त करते हैं। कैंसर में, जब कोशिका विभाजित होती है तो ये एपिसोड मेजबान गुणसूत्रों के साथ निष्क्रिय रूप से दोहराते हैं। जब ये वायरल एपिसोड कई वायरस कणों को उत्पन्न करने के लिए लाइटिक चक्र शुरू करते हैं, तो वे आम तौर पर सेलुलर सहज प्रतिरक्षा रक्षा तंत्र को सक्रिय करते हैं जो मेजबान सेल को मार देते हैं।

प्लास्मिड रखरखाव
कुछ प्लास्मिड या माइक्रोबियल होस्ट में इशरीकिया कोली में प्लास्मिड आर 1 की होक / सोक सिस्टम | होक / सोक (मेजबान हत्या / हत्या का शमन) प्रणाली के रूप में एक लत मॉड्यूल या पोस्टसेग्रेगेशनल किलिंग सिस्टम (पीएसके) शामिल है। यह वैरिएंट एक लंबे समय तक रहने वाले जहर और एक अल्पकालिक मारक दोनों का उत्पादन करता है। साहित्य में कई प्रकार के प्लास्मिड एडिक्शन सिस्टम (टॉक्सिन / एंटीटॉक्सिन, मेटाबॉलिज्म-आधारित, ओआरटी सिस्टम) का वर्णन किया गया था और बायोटेक्निकल (किण्वन) या बायोमेडिकल (वैक्सीन थेरेपी) अनुप्रयोगों में उपयोग किया जाता है। बेटी कोशिकाएं जो प्लास्मिड की एक प्रति को बनाए रखती हैं, जीवित रहती हैं, जबकि एक बेटी कोशिका जो प्लास्मिड को विरासत में पाने में विफल रहती है, मर जाती है या पैरेंट सेल से लंबे समय तक रहने वाले जहर के कारण विकास दर कम हो जाती है। अंत में, समग्र उत्पादकता को बढ़ाया जा सकता है।

इसके विपरीत, जैव प्रौद्योगिकी में उपयोग किए जाने वाले प्लास्मिड, जैसे कि pUC18, pBR322 और व्युत्पन्न वैक्टर, में शायद ही कभी विष-प्रतिविष व्यसन प्रणालियाँ होती हैं, और इसलिए प्लास्मिड हानि से बचने के लिए एंटीबायोटिक दबाव में रखने की आवश्यकता होती है।

खमीर प्लास्मिड
खमीर स्वाभाविक रूप से विभिन्न प्लास्मिडों को आश्रय देते हैं। उनमें से उल्लेखनीय हैं 2μm प्लास्मिड—खमीर की जेनेटिक इंजीनियरिंग के लिए अक्सर उपयोग किए जाने वाले छोटे गोलाकार प्लास्मिड—और क्लुवेरोमाइसेस लैक्टिस से लीनियर पीजीकेएल प्लास्मिड, जो हत्यारा फेनोटाइप के लिए जिम्मेदार हैं। अन्य प्रकार के प्लास्मिड अक्सर यीस्ट क्लोनिंग वैक्टर से संबंधित होते हैं जिनमें शामिल हैं:
 * खमीर एकीकृत प्लास्मिड (YIp), खमीर वैक्टर जो जीवित रहने और प्रतिकृति के लिए मेजबान गुणसूत्र में एकीकरण पर भरोसा करते हैं, और आमतौर पर एकल जीन की कार्यक्षमता का अध्ययन करते समय या जीन के विषाक्त होने पर उपयोग किया जाता है। जीन URA3 से भी जुड़ा हुआ है, जो पाइरीमिडीन न्यूक्लियोटाइड्स (T, C) के जैवसंश्लेषण से संबंधित एक एंजाइम को कोड करता है;
 * यीस्ट रेप्लिकेटिव प्लास्मिड (YRp), जो क्रोमोसोमल डीएनए के अनुक्रम को ट्रांसपोर्ट करता है जिसमें प्रतिकृति की उत्पत्ति शामिल है। ये प्लास्मिड कम स्थिर होते हैं, क्योंकि ये नवोदित होने के दौरान खो सकते हैं।

संयंत्र माइटोकॉन्ड्रियल प्लास्मिड
कई उच्च पौधों के माइटोकॉन्ड्रिया में रेप्लिकॉन (आनुवांशिकी) होते हैं | स्व-प्रतिकृति, अतिरिक्त-क्रोमोसोमल रैखिक या परिपत्र डीएनए अणु जिन्हें प्लास्मिड माना जाता है। इनका आकार 0.7 केबी से लेकर 20 केबी तक हो सकता है। प्लास्मिड को आम तौर पर दो श्रेणियों में वर्गीकृत किया गया है- परिपत्र और रैखिक। सर्कुलर प्लास्मिड को अलग किया गया है और कई अलग-अलग पौधों में पाया गया है, बाकला और चेनोपोडियम एल्बम में सबसे अधिक अध्ययन किया गया है और जिनकी प्रतिकृति का तंत्र ज्ञात है। वृत्ताकार प्लाज्मिड प्रतिकृति के θ मॉडल (जैसा कि विसिया फैबा में है) और रोलिंग सर्कल प्रतिकृति (सी.एल्बम के अनुसार) के माध्यम से दोहरा सकते हैं। कुछ पौधों की प्रजातियों जैसे बीटा वल्गरिस, ब्रैसिका नैपस, मक्का आदि में लीनियर प्लास्मिड की पहचान की गई है, लेकिन वे अपने गोलाकार समकक्षों की तुलना में दुर्लभ हैं।

इन प्लास्मिडों का कार्य और उत्पत्ति काफी हद तक अज्ञात है। यह सुझाव दिया गया है कि परिपत्र प्लास्मिड एक सामान्य पूर्वज साझा करते हैं, माइटोकॉन्ड्रियल प्लास्मिड में कुछ जीनों के परमाणु डीएनए में समकक्ष होते हैं जो इंटर-कम्पार्टमेंट एक्सचेंज का सुझाव देते हैं। इस बीच, रैखिक प्लास्मिड वायरल डीएनए और फंगल प्लास्मिड के साथ इनवर्ट्रोन जैसी संरचनात्मक समानताएं साझा करते हैं, जैसे कि फंगल प्लास्मिड में भी जीसी सामग्री कम होती है, इन टिप्पणियों ने कुछ परिकल्पनाओं को जन्म दिया है कि इन रैखिक प्लास्मिडों में वायरल उत्पत्ति है, या पौधे माइटोकॉन्ड्रिया में समाप्त हो गए हैं। रोगजनक कवक से क्षैतिज जीन स्थानांतरण के माध्यम से।

प्लास्मिड डीएनए निष्कर्षण
प्लास्मिड का उपयोग अक्सर एक विशिष्ट अनुक्रम को शुद्ध करने के लिए किया जाता है, क्योंकि उन्हें शेष जीनोम से आसानी से शुद्ध किया जा सकता है। वैक्टर के रूप में उनके उपयोग के लिए, और क्लोनिंग के लिए # आणविक क्लोनिंग, प्लास्मिड को अक्सर अलग करने की आवश्यकता होती है।

बैक्टीरिया से प्लास्मिड तैयार करने की कई विधियाँ हैं, जिनमें प्लास्मिड तैयारी # आकार द्वारा तैयारी शामिल है। पूर्व का उपयोग जल्दी से यह पता लगाने के लिए किया जा सकता है कि प्लाज्मिड कई जीवाणु क्लोनों में से किसी में सही है या नहीं। उपज अशुद्ध प्लाज्मिड डीएनए की एक छोटी मात्रा है, जो प्रतिबंध डाइजेस्ट द्वारा विश्लेषण और कुछ क्लोनिंग तकनीकों के लिए पर्याप्त है।

उत्तरार्द्ध में, जीवाणु निलंबन के बहुत अधिक मात्रा में उगाए जाते हैं जिससे मैक्सी-प्रेप किया जा सकता है। संक्षेप में, यह अतिरिक्त शुद्धिकरण के बाद बढ़ाया गया मिनीप्रेप है। इसका परिणाम अपेक्षाकृत बड़ी मात्रा में (कई सौ माइक्रोग्राम) बहुत शुद्ध प्लास्मिड डीएनए में होता है।

विभिन्न पैमानों, शुद्धता और स्वचालन के स्तरों पर प्लाज्मिड निष्कर्षण करने के लिए कई वाणिज्यिक किट बनाए गए हैं।

अनुरूपता
प्लास्मिड डीएनए पांच में से एक अनुरूपता में प्रकट हो सकता है, जो (किसी दिए गए आकार के लिए) agarose gel वैद्युतकणसंचलन के दौरान एक जेल में विभिन्न गति से चलता है। इलेक्ट्रोफोरेटिक गतिशीलता (किसी दिए गए लागू वोल्टेज के लिए गति) के क्रम में सबसे धीमी से सबसे तेज़ क्रम में नीचे सूचीबद्ध हैं:
 * निक (डीएनए) | निकेड ओपन-सर्कुलर डीएनए में एक स्ट्रैंड कट है।
 * रिलैक्स्ड सर्कुलर डीएनए दोनों स्ट्रैंड्स के साथ पूरी तरह से बरकरार है, लेकिन इसे एंजाइमेटिक रूप से रिलैक्स किया गया है (सुपरकोइल्स को हटा दिया गया है)। यह एक मुड़े हुए एक्स्टेंशन कॉर्ड  को खोलने और आराम करने और फिर इसे अपने आप में प्लग करने के द्वारा तैयार किया जा सकता है।
 * रैखिक डीएनए के मुक्त सिरे होते हैं, या तो क्योंकि दोनों किस्में काट दी गई हैं या क्योंकि डीएनए विवो में रैखिक था। यह एक विद्युत विस्तार कॉर्ड के साथ तैयार किया जा सकता है जो स्वयं में प्लग नहीं है।
 * डीएनए सुपरकॉइल (या सहसंयोजक बंद-परिपत्र) डीएनए पूरी तरह से बरकरार है, दोनों किस्में बिना काटे, और एक अभिन्न मोड़ के साथ, जिसके परिणामस्वरूप एक कॉम्पैक्ट रूप है। यह एक एक्सटेंशन कॉर्ड को घुमाकर और फिर इसे अपने आप में प्लग करके तैयार किया जा सकता है।
 * सुपरकोल्ड विकृतीकरण (बायोकेमिस्ट्री) डीएनए सुपरकोल्ड डीएनए की तरह है, लेकिन इसमें अयुग्मित क्षेत्र हैं जो इसे थोड़ा कम कॉम्पैक्ट बनाते हैं; यह प्लाज्मिड तैयारी के दौरान अत्यधिक क्षारीयता का परिणाम हो सकता है।

छोटे रेखीय अंशों के लिए प्रवास की दर कम वोल्टेज पर लागू वोल्टेज के सीधे आनुपातिक होती है। उच्च वोल्टेज पर, बड़े टुकड़े लगातार अलग-अलग दरों पर बढ़ते हुए माइग्रेट करते हैं। इस प्रकार, बढ़े हुए वोल्टेज के साथ एक जेल का रिज़ॉल्यूशन घट जाता है।

एक निर्दिष्ट, कम वोल्टेज पर, छोटे रैखिक डीएनए अंशों की प्रवासन दर उनकी लंबाई का एक कार्य है। बड़े रैखिक टुकड़े (20 केबी या उससे अधिक) लंबाई की परवाह किए बिना एक निश्चित निश्चित दर पर माइग्रेट करते हैं। ऐसा इसलिए है क्योंकि अणु 'श्वसन' करते हैं, अणु के थोक के साथ जेल मैट्रिक्स के माध्यम से अग्रणी अंत होता है। शुद्ध प्लास्मिड का विश्लेषण करने के लिए प्रतिबंध डाइजेस्ट का अक्सर उपयोग किया जाता है। ये एंजाइम विशेष रूप से कुछ छोटे क्रमों में डीएनए को तोड़ते हैं। परिणामी रेखीय टुकड़े जेल वैद्युतकणसंचलन के बाद 'बैंड' बनाते हैं। जेल के बैंड को काटकर और डीएनए के टुकड़े को मुक्त करने के लिए जेल को भंग करके कुछ अंशों को शुद्ध करना संभव है।

इसकी तंग रचना के कारण, सुपरकोल्ड डीएनए रैखिक या खुले-वृत्ताकार डीएनए की तुलना में एक जेल के माध्यम से तेजी से पलायन करता है।

जैव सूचना विज्ञान और डिजाइन के लिए सॉफ्टवेयर
आणविक जीव विज्ञान में एक तकनीक के रूप में प्लास्मिड का उपयोग जैव सूचना विज्ञान सॉफ़्टवेयर  द्वारा समर्थित है। ये कार्यक्रम प्लाज्मिड वैक्टर के डीएनए अनुक्रम को रिकॉर्ड करते हैं, प्रतिबंध एंजाइमों की कट साइटों की भविष्यवाणी करने में मदद करते हैं, और जोड़तोड़ की योजना बनाते हैं। सॉफ्टवेयर पैकेज के उदाहरण जो प्लास्मिड मैप्स को संभालते हैं, वे हैं ApE,  क्लोन प्रबंधक, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, सीरियल क्लोनर, वेक्टरफ्रेंड्स, वेक्टर NTI और WebDSV। सॉफ्टवेयर के ये टुकड़े गीले प्रयोग करने से पहले सिलिको में संपूर्ण प्रयोग करने में मदद करते हैं।

प्लाज्मिड संग्रह
वर्षों में कई प्लास्मिड बनाए गए हैं और शोधकर्ताओं ने गैर-लाभकारी संगठनों Addgene और जैसे प्लास्मिड डेटाबेस को प्लास्मिड दिए हैं। यूएस/बीसीसीएम-एलबीएमपी बीसीसीएम/एलएमबीपी। शोध के लिए कोई भी उन डेटाबेस से प्लास्मिड ढूंढ और अनुरोध कर सकता है। शोधकर्ता अक्सर NCBI डेटाबेस पर प्लाज्मिड अनुक्रम भी अपलोड करते हैं, जिससे विशिष्ट प्लास्मिड के अनुक्रम प्राप्त किए जा सकते हैं।

यह भी देखें
• Bacterial artificial chromosome

• Bacteriophage

• DNA recombination

• Plasmidome

• Provirus

• Secondary chromosome

• Segrosome

• Transposon

• Triparental mating

• VectorDB

बाहरी संबंध

 * International Society for Plasmid Biology and other Mobile Genetic Elements
 * What is Biotechnology
 * History of Plasmids with timeline