किंगडम (जीव विज्ञान)

जीव विज्ञान में, डोमेन (जीव विज्ञान) के ठीक नीचे, जगत दूसरा सबसे बड़ा टैक्सोनोमिक रैंक है। अवस्था को छोटे समूहों में विभाजित किया जाता है जिन्हें फ़ाइला कहा जाता है।

परंपरागत रूप से, संयुक्त अवस्था अमेरिका और कनाडा की कुछ पाठ्य पुस्तकों में छह अवस्था  (एनीमेलिया, पौधा,  कुकुरमुत्ता ,प्रोटिस्टा, आर्किया/आर्की जीवाण , और बैक्टीरिया या यूबैक्टीरिया) की एक प्रणाली का उपयोग किया गया था; जबकि दुनिया के अन्य हिस्सों में पाठ्य पुस्तकें, जैसे कि यूनाइटेड किंगडम, बांग्लादेश, भारत, ग्रीस, ब्राजील में केवल पाँच अवस्था (एनीमेलिया, प्लांटी, फंगी, प्रोटिस्टा और  धन ) का उपयोग किया जाता है।

आधुनिक क्लेडिस्टिक्स  पर आधारित कुछ हालिया वर्गीकरणों ने स्पष्ट रूप से जगतशब्द को छोड़ दिया है, यह देखते हुए कि कुछ पारंपरिक अवस्था मोनोफेलटिक नहीं हैं, जिसका अर्थ है कि उनमें एक सामान्य पूर्वज के सभी वंशज शामिल नहीं हैं। शब्द 'फ्लोरा' (पौधों के लिए), ' पशुवर्ग ' (जानवर के लिए) और 21वीं सदी में ' सोचना ' (कवक के लिए) भी एक विशेष क्षेत्र या समय में  स्थित जीवन के लिए उपयोग किया जाता है।.

परिभाषा और संबंधित शर्तें
जब कार्ल लिनिअस ने 1735 में जीव विज्ञान में नामकरण की रैंक-आधारित प्रणाली की शुरुआत की, तो सर्वोच्च रैंक को जगत नाम दिया गया और उसके बाद चार अन्य मुख्य या प्रमुख रैंक: वर्ग (जीव विज्ञान), आदेश (जीव विज्ञान), जीनस और प्रजातियां थीं। बाद में दो और मुख्य रैंकों को प्रस्तुत किया गया, जिससे अनुक्रम साम्राज्य, फाइलम, वर्ग (जीव विज्ञान), आदेश (जीव विज्ञान), वर्ग(जीव विज्ञान), जीनस और प्रजातियां बन गईं। 1990 में, डोमेन (जीव विज्ञान) की रैंक को जगतसे ऊपर  प्रस्तुत किया गया था।

उपसर्ग जोड़े जा सकते हैं इसलिए सब जगत(सबरेग्नम) और इन्फ्राजगत(इन्फ्रारेग्नम के रूप में भी जाना जाता है) जगत के ठीक नीचे दो रैंक हैं। सुपर जगत को डोमेन या साम्अवस्था के समकक्ष या साम्अवस्था और डोमेन या सबडोमेन के बीच एक स्वतंत्र रैंक के रूप में माना जा सकता है। कुछ वर्गीकरण प्रणालियों में अतिरिक्त रैंक शाखा (लैटिन: रेमस) को सबजगतऔर इन्फ्राजगतके बीच डाला जा सकता है, उदाहरण के लिए, कैवलियर-स्मिथ के वर्गीकरण में प्रोटोस्टॉमी  और  ड्यूटेरोस्टोमी ।

जीवन के दो राज्य
सजीवों का जंतुओं और पौधों में वर्गीकरण प्राचीन है। अरस्तू (384-322 ईसा पूर्व) ने अपने जानवरों के इतिहास में जानवरों की प्रजातियों को वर्गीकृत किया, जबकि उनके शिष्य थियोफ्रेस्टस (सी.-371-सी.-287 ईसा पूर्व) ने पौधों पर एक समानांतर कार्य, हिस्टोरिया प्लांटारम (थियोफ्रेस्टस) लिखा। कार्ल लिनिअस (1707-1778) ने आधुनिक जैविक नामकरण की नींव रखी, जिसे अब 1735 में नामकरण संहिताओं द्वारा विनियमित किया जाता है। उन्होंने जीवित चीजों के दो साम्अवस्था को प्रतिष्ठित किया: रेग्नम एनिमेले ('पशु साम्राज्य') और रेग्नम वेजिटेबल (पौधों के लिए 'वनस्पति साम्राज्य')। लिनिअस ने अपने वर्गीकरण (जीव विज्ञान) में खनिजों को भी शामिल किया, उन्हें एक तीसरे साम्राज्य, मिनरलिया में रखा।

जीवन के तीन राज्य
1674 में, एंटनी वैन ल्यूवेनहोक, जिन्हें अधिकांशतः माइक्रोस्कोपी का जनक कहा जाता है, ने लंदन की रॉयल सोसाइटी को सूक्ष्म एकल-कोशिका वाले जीवों की अपनी पहली टिप्पणियों की एक प्रति भेजी। उस समय तक, ऐसे सूक्ष्म जीवों का अस्तित्व पूर्ण रूप अज्ञात था। इसके बावजूद, लिनिअस ने अपने मूल वर्गीकरण में किसी भी सूक्ष्म जीव को शामिल नहीं किया।

सबसे पहले, सूक्ष्म जीवों को जानवरों और पौधों के साम्अवस्था में वर्गीकृत किया गया था। चूंकि, 19वीं शताब्दी के मध्य तक, यह बहुत से लोगों के लिए स्पष्ट हो गया था कि पौधे और जानवरों के साम्अवस्थाका वर्तमान द्विभाजन अपनी सीमाओं पर तीव्रता से धुंधला हो गया था और पुराना हो गया था। 1860 में जॉन हॉग (जीवविज्ञानी) ने प्रोटोक्टिस्टा का प्रस्ताव रखा, जो सभी निम्नजीवों, या प्राथमिक जैविक प्राणियों से बना जीवन का एक तीसरा साम्अवस्था है; उन्होंने रेग्नम लैपिडियम को खनिजों के चौथे साम्अवस्थाके रूप में बनाए रखा। 1866 में, अर्न्स्ट हेकेल ने तटस्थ जीवों या आदिम रूपों के साम्अवस्थाके लिए जीवन के तीसरे साम्राज्य, protist  का भी प्रस्ताव रखा, जो न तो  प्राणीथे और न ही पौधे; उन्होंने अपनी योजना में रेग्नम लैपिडियम को शामिल नहीं किया। जीवों के एककोशिकीय (प्रोटिस्टा) या बहुकोशिकीय (जानवरों और पौधों) के आधार पर एक विभाजन पर बसने से पहले हेकेल ने इस साम्अवस्थाकी पदार्थ को कई बार संशोधित किया।

चार राज्य
माइक्रोस्कोपी के विकास से उन जीवों के बीच महत्वपूर्ण अंतर का पता चलता है जिनकी कोशिकाओं में एक अलग कोशिका केंद्र (प्रोकैरियोट्स) नहीं होता है और ऐसे जीव जिनकी कोशिकाओं में एक अलग केंद्रक (यूकेरियोट्स) होता है। 1937 में एडवर्ड चैटन ने इन जीवों में अंतर करने के लिए प्रोकैरियोट और यूकेरियोट शब्द प्रस्तुत किए।

1938 में, हर्बर्ट एफ. कोपलैंड ने प्रोकैरियोटिक जीवों का उपन्यास जगतमोनेरा बनाकर चार-जगत वर्गीकरण का प्रस्ताव रखा; प्रोटिस्टा के एक संशोधित संघ मोनेरा के रूप में, इसमें ऐसे जीव शामिल थे जिन्हें अब बैक्टीरिया और आर्किया के रूप में वर्गीकृत किया गया है।अर्न्स्ट हेकेल ने अपनी 1904 की पुस्तक द वंडर्स ऑफ लाइफ में मोनेरा में नीले-हरे शैवाल (या फाइकोक्रोमेशिया) को रखा था; यह धीरे-धीरे स्वीकृति प्राप्त करेगा, और नीले-हरे शैवाल को साइनोबैक्टीरिया संघ में बैक्टीरिया के रूप में वर्गीकृत किया जाएगा। 1960 के दशक में, रोजर स्टैनियर और सी. बी. वैन निएल ने एडौर्ड चैटन के पहले के काम को बढ़ावा दिया और लोकप्रिय बनाया, विशेष रूप से 1962 के उनके लेख में, एक जीवाणु की अवधारणा; इसने पहली बार प्रोकैरियोट्स और यूकेरियोट्स की दो-साम्अवस्थाप्रणाली के साथ राज्य-एक सुपरजगतया साम्अवस्थाके ऊपर एक रैंक बनाया। दो-साम्अवस्थाप्रणाली को बाद में आर्किया, बैक्टीरिया और यूकेरियोटा की तीन-डोमेन प्रणाली में विस्तारित किया जाएगा।

पांच राज्य
कवक और पौधों के रूप में माने जाने वाले अन्य जीवों के बीच अंतर कुछ लोगों द्वारा लंबे समय से पहचाना गया था; हैकेल ने अपने मूल वर्गीकरण के बाद कवक को प्लांटी से प्रोटिस्टा में स्थानांतरित कर दिया था, परन्तु इस अलगाव में अपने समय के वैज्ञानिकों द्वारा अत्यधिकहद तक नजरअंदाज कर दिया गया था। रॉबर्ट Whittaker (पारिस्थितिकी विज्ञानी) ने फंगी के लिए एक अतिरिक्त साम्अवस्थाको मान्यता दी।व्हिटेकर द्वारा 1969 में प्रस्तावित परिणामी पांच-अवस्थाप्रणाली, एक लोकप्रिय मानक बन गया है और कुछ शोधन के साथ अभी भी कई कार्यों में उपयोग किया जाता है और नए बहु-अवस्थाप्रणालियों के लिए आधार बनाता है। यह मुख्य रूप से पोषण में अंतर पर आधारित है; उनके एनिमेलिया बहुकोशिकीय हेटरोट्रॉफ़्स और उनके फंगी बहुकोशिकीय सैप्रोट्रोफ़ थे।

शेष दो साम्अवस्था, प्रोटिस्टा और मोनेरा में एककोशिकीय और सरल कोशिकीय उपनिवेश शामिल थे पांच साम्अवस्था प्रणाली को दो साम्अवस्थाप्रणाली के साथ जोड़ा जा सकता है। व्हिटेकर प्रणाली में, प्लांटी में कुछ शैवाल शामिल थे। अन्य प्रणालियों में, जैसे कि लिन मार्गुलिस की पांच अवस्था की प्रणाली, पौधों में केवल भूमि पौधे ((एम्ब्रियोफाइटा)) शामिल थे, और प्रोटोक्टिस्टा की व्यापक परिभाषा है। व्हिटेकर की प्रणाली के प्रकाशन के बाद, हाई स्कूल जीव विज्ञान की पाठ्यपुस्तकों में पांच-जगत मॉडल का सामान्य रूप से उपयोग किया जाने लगा। [13] परन्तु अधिकांश वैज्ञानिकों के बीच दो अवस्था से पांच तक के विकास के बावजूद, कुछ लेखकों ने 1975 तक जानवरों और पौधों की एक पारंपरिक दो-अवस्थाप्रणाली को नियोजित करना जारी रखा, पौधे के साम्अवस्थाको प्रोकैरियोटा (बैक्टीरिया और साइनोबैक्टीरिया), माइकोटा (कवक और कवक) में विभाजित किया। अनुमानित रिश्तेदार), और क्लोरोटा (शैवाल और भूमि पौधे)।

छह राज्य
1977 में, कार्ल वोइस और उनके सहयोगियों ने राइबोसोमल आरएनए संरचना के आधार पर प्रोकैरियोट्स के मौलिक उपखंड को यूबैक्टीरिया (जिसे बाद में बैक्टीरिया कहा जाता है) और आर्कबैक्टीरिया (जिसे बाद में आर्किया कहा जाता है) में प्रस्तावित किया यह बाद में बैक्टीरिया, आर्किया और यूकेरियोटा के जीवन के तीन "डोमेन" के प्रस्ताव की ओर ले जाएगा। पांच-जगत मॉडल के साथ मिलकर, इसने एक छह-जगत मॉडल बनाया, जहां साम्अवस्थामोनेरा को बैक्टीरिया और आर्किया साम्अवस्था द्वारा प्रतिस्थापित किया गया। यह छह-अवस्थामॉडल सामान्यतः हाल ही में अमेरिकी हाई स्कूल जीव विज्ञान की पाठ्यपुस्तकों में उपयोग किया जाता है, परन्तु वर्तमान वैज्ञानिक सहमति से समझौता करने के लिए आलोचना की गई है। परन्तु दो अवस्था में प्रोकैरियोट्स का विभाजन थॉमस कैवलियर-स्मिथ की हाल की सात साम्अवस्था की योजना के उपयोग में बना हुआ है, 	चूंकि यह मुख्य रूप से अलग है कि प्रोटिस्टा को प्रोटोजोआ और कलरिस्ट द्वारा प्रतिस्थापित किया गया है।

आठ राज्य
थॉमस कैवलियर-स्मिथ ने उस समय आम सहमति का समर्थन किया, कि यूबैक्टीरिया और आर्कबैक्टीरिया के बीच का अंतर इतना बड़ा था (विशेष रूप से राइबोसोमल जीन की आनुवंशिक दूरी पर विचार करते हुए) कि प्रोकैरियोट्स को दो अलग-अलग अवस्था में अलग करने की आवश्यकता थी। इसके बाद उन्होंने यूबैक्टीरिया को दो उपसमूहों में विभाजित किया: नेगिबैक्टीरिया (ग्राम नकारात्मक बैक्टीरिया) और पोसिबैक्टीरिया (ग्राम पॉजिटिव बैक्टीरिया)। इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी में तकनीकी प्रगति ने क्रोमिस्टा को प्लांटी साम्अवस्थासे अलग करने की अनुमति दी। यद्यपि, क्रोमिस्ट्स का क्लोरोप्लास्ट साइटोसोल के अतिरिक्त  अन्तः प्रदव्ययी जलिका  के लुमेन में स्थित होता है। इसके अतिरिक्त, केवल क्रोमिस्ट में क्लोरोफिल सी होता है तब से, प्रोटिस्टों के कई गैर-प्रकाश संश्लेषक संघ, जिनके बारे में माना जाता है कि उन्होंने अपने क्लोरोप्लास्ट को गौण रूप से खो दिया था, को क्रोमिस्टा साम्अवस्थामें एकीकृत किया गया था।

अंत में, माइटोकॉन्ड्रिया की कमी वाले कुछ प्रोटिस्ट खोजे गए। जैसा कि माइटोकॉन्ड्रिया एक प्रोटीओबैक्टीरियम के एंडोसिम्बायोसिस के परिणाम के रूप में जाना जाता था, यह सोचा गया था कि ये एमिटोकॉन्ड्रिएट यूकेरियोट्स आदिम रूप से यूकेरियोजेनेसिस में एक महत्वपूर्ण चरणको चिह्नित करते हैं। फलस्वरूप, इन अमाइटोकॉन्ड्रिएट प्रोटिस्ट को प्रोटिस्ट साम्अवस्थासे अलग कर दिया गया, जिससे एक ही समय में, सुपरजगतऔर अर्चेज़ोआ साम्अवस्थाका उदय हुआ। यह सुपरजगतमेटाकार्योटा सुपरजगतके विरोध में था, जो पांच अन्य यूकेरियोटिक साम्अवस्था (एनिमलिया, प्रोटोजोआ, फंगी, प्लांटे और क्रोमिस्टा) को एक साथ समूहित करता था। इसे आर्केज़ोआ परिकल्पना के रूप में जाना जाता था, जिसे तब से छोड़ दिया गया है; बाद की योजनाओं में आर्केज़ोआ-मेटाकैरियोटा विभाजन शामिल नहीं था।

छह साम्अवस्था(1998)
1998 में, कैवेलियर-स्मिथ ने एक छह-अवस्थामॉडल प्रकाशित किया,जिसे बाद के पत्रों में संशोधित किया गया है। 2009 में प्रकाशित संस्करण नीचे दिखाया गया है। कैवलियर-स्मिथ ने अब मौलिक यूबैक्टीरिया-आर्कबैक्टीरिया डिवाइड के महत्व को स्वीकार नहीं किया है जिसे वोइस और अन्य लोगों द्वारा आगे रखा गया है और हाल के शोध द्वारा समर्थित है। जगतबैक्टीरिया (साम्अवस्थाप्रोकैर्योसाइटों का एकमात्र साम्राज्य) को उनकी झिल्ली  सांस्थिति के अनुसार दो उप-साम्अवस्था में विभाजित किया गया था: यूनीबैक्टीरिया को फाइला आर्कबैक्टीरिया और पॉसिबैक्टीरिया में विभाजित किया गया था; द्विझिल्लीदार-अविच्छेदी संक्रमण को आर्कीबैक्टीरिया की आनुवंशिक दूरी की लंबी शाखा की तुलना में कहीं अधिक मौलिक माना जाता था, जिसे कोई विशेष जैविक महत्व नहीं माना जाता था।

कैवलियर-स्मिथ वैध होने के लिए टैक्सा के मोनोफिलेटिक ("होलोफिलेटिक" उनकी शब्दावली में) होने की आवश्यकता को स्वीकार नहीं करता है। वह प्रोकैरियोटा, बैक्टीरिया, नेगिबैक्टीरिया, यूनिबैक्टीरिया और पॉसिबैक्टीरिया को वैध पैराफिला के रूप में परिभाषित करता है (इसलिए "मोनोफिलेटिक" अर्थ में वह इस शब्द का उपयोग करता है) टैक्सा, जैविक महत्व के महत्वपूर्ण नवाचारों को चिह्नित करता है (जैविक आला की अवधारणा के संबंध में)।

उसी तरह, उनके पैराफाईलेटिक साम्अवस्थाप्रोटोजोआ में एनिमेलिया, फंगी, प्लांटे और क्रोमिस्टा के पूर्वज शामिल हैं। फाइलोजेनेटिक अध्ययन की प्रगति ने कैवलियर-स्मिथ को यह महसूस करने की अनुमति दी कि सभी फ़ाइला को आर्किज़ोअन्स (अर्थात आदिम एमिटोकॉन्ड्रिएट यूकेरियोट्स) माना जाता है, वास्तव में उनके माइटोकॉन्ड्रिया को खो दिया था, सामान्यतः उन्हें नए ऑर्गेनेल में बदलकर: हाइड्रोजनोसोम । इसी तरह, उनके पैराफिलेटिक एम्पायर प्रोटोजोआ में एनिमिया, फंगी, प्लांटे और क्रोमिस्टा के पूर्वज शामिल हैं। फ़ाइल जेनेटिक अध्ययन की प्रगति ने कैवलियर-स्मिथ को यह महसूस करने की अनुमति दी कि सभी फ़ाइला को आर्किज़ोन्स (अर्थात आदिम एमिटोकॉन्ड्रिएट यूकेरियोट्स) माना जाता है, वास्तव में उनके माइटोकॉन्ड्रिया को खो दिया था, सामान्यतः उन्हें नए ऑर्गनेल में विभाजित करते हैं: हाइड्रोजेनेल। अन्य को जगतप्रोटोजोआ में पुनर्वर्गीकृत किया गया, जैसे मेटामोनडा जो अब इन्फ्राजगतउत्खनन का भाग है।

क्योंकि कैवलियर-स्मिथ पैराफिली की अनुमति देता है, नीचे दिया गया आरेख एक 'संगठन चार्ट' है, न कि 'पूर्वज चार्ट', और एक विकासवादी वृक्ष का प्रतिनिधित्व नहीं करता है।

सात राज्य
कैवलियर-स्मिथ और उनके सहयोगियों ने 2015 में अपने वर्गीकरण को संशोधित किया। इस योजना में उन्होंने प्रोकैरियोटा और यूकेरियोटा के दो सुपरजगतऔर सात अवस्था की शुरुआत की। प्रोकैरियोटा के दो साम्अवस्थाहैं: बैक्टीरिया और आर्किया। (यह जीवाणु वर्गीकरण  और जीवन की सूची में आम सहमति पर आधारित था)। यूकेरियोटा में पांच अवस्थाहैं: प्रोटोजोआ, क्रोमिस्टा, प्लांटी, फंगी और एनिमलिया। इस वर्गीकरण में एक प्रोटिस्ट यूकेरियोटिक एककोशिकीय जीवों में से कोई भी है।

सारांश
इस दृष्टिकोण के साथ कुछ समस्याओं के बावजूद, जीवन का राज्य-स्तरीय वर्गीकरण अभी भी जीवों को समूहीकृत करने के एक उपयोगी तरीके के रूप में व्यापक रूप से नियोजित है:
 * प्रोटोजोआ जैसे अवस्थाक्लेड के अतिरिक्त विकासवादी ग्रेड का प्रतिनिधित्व करते हैं, और इसलिए फ़िलेजिनेटिक वर्गीकरण प्रणालियों द्वारा खारिज कर दिया जाता है।
 * सबसे हालिया शोध किसी भी मानक प्रणाली में यूकेरियोट्स के वर्गीकरण का समर्थन नहीं करता है।अप्रैल 2010 तक, व्यापक स्वीकृति प्राप्त करने के लिए अवस्था का कोई भी समूह अनुसंधान द्वारा पर्याप्त रूप से समर्थित नहीं है। 2009 में, एंड्रयू रोजर और एलिस्टेयर सिम्पसन ने नई खोजों के विश्लेषण में परिश्रम की आवश्यकता पर जोर दिया: "जीवन के यूकेरियोट वृक्ष की हमारी समझ में परिवर्तन की वर्तमान गति के साथ, हमें सावधानी से आगे बढ़ना चाहिए।"

पारंपरिक साम्अवस्था से परे
जबकि कुछ टैक्सोनोमिस्टों द्वारा साम्अवस्था की अवधारणा का उपयोग जारी है, पारंपरिक साम्अवस्था से एक आंदोलन दूर हो गया है, क्योंकि अब उन्हें क्लैडिस्टिक्स वर्गीकरण प्रदान करने के रूप में नहीं देखा जाता है,, जहां जीवों को प्राकृतिक समूहों में व्यवस्थित करने पर जोर दिया जाता है।

जीवन के तीन क्षेत्र
1970 के दशक के मध्य से आणविक स्तर पर जीनों की तुलना पर जोर दिया जाने लगा (शुरुआत में राइबोसोम रीबोन्यूक्लीक एसिड  जीन)वर्गीकरण में प्राथमिक कारक के रूप में; बाहरी दिखावे और व्यवहार पर आनुवंशिक समानता पर जोर दिया गया।अवस्था सहित टैक्सोनोमिक रैंक, एक सामान्य पूर्वज वाले जीवों के समूह थे, चाहे संघीय (एक सामान्य पूर्वज के सभी वंशज) या पेराफाईलेटिक (एक सामान्य पूर्वज के केवल कुछ वंशज)।

ऐसे आरएनए अध्ययनों के आधार पर, कार्ल वोइस ने सोचा कि जीवन को तीन बड़े विभागों में विभाजित किया जा सकता है और उन्हें "तीन प्राथमिक साम्राज्य" मॉडल या "अर्किंगडम" मॉडल के रूप में संदर्भित किया जाता है।

11990 में, "डोमेन" नाम उच्चतम रैंक के लिए प्रस्तावित किया गया था। [5] यह शब्द 1974 में मूर द्वारा प्रस्तुत किए गए डोमिनियन (अव्य। डोमिनियम) की श्रेणी के लिए एक पर्याय का प्रतिनिधित्व करता है। मूर के विपरीत, वोइस एट अल। (1990) ने इस श्रेणी के लिए एक लैटिन शब्द का सुझाव नहीं दिया, जो यथार्त  रूप से  प्रस्तुत किए गए शब्द डोमिनियन का समर्थन करने वाले एक और तर्क का प्रतिनिधित्व करता है।मूर के विपरीत, वोइस एट अल। (1990) ने इस श्रेणी के लिए एक लैटिन शब्द का सुझाव नहीं दिया, जो यथार्त  रूप से  प्रस्तुत किए गए शब्द डोमिनियन का समर्थन करने वाले एक और तर्क का प्रतिनिधित्व करता है।वोइस ने प्रोकैरियोट्स (पहले जगतमोनेरा के रूप में वर्गीकृत) को दो समूहों में विभाजित किया, जिन्हें यूबैक्टीरिया और आर्कबैक्टीरिया कहा जाता है, इस बात पर जोर देते हुए कि इन दोनों समूहों के बीच उतना ही आनुवंशिक अंतर था जितना कि उनमें से किसी और सभी यूकेरियोट्स के बीच।

आनुवंशिक डेटा के अनुसार, 	चूंकि यूकेरियोट समूह जैसे कि पौधे, कवक और प्राणीअलग-अलग दिख सकते हैं, वे यूबैक्टेरिया या आर्किया की तुलना में एक-दूसरे से अधिक निकटता से संबंधित हैंयह भी पाया गया कि यूकेरियोट्स यूबैक्टीरिया की तुलना में आर्किया से अधिक निकटता से संबंधित हैं।यद्यपि यूबैक्टीरिया-आर्किया विभाजन की प्रधानता पर सवाल उठाया गया है, इसे बाद के शोधों द्वारा बरकरार रखा गया है। वोइस द्वारा प्रस्तावित वर्गीकरण योजना में कितने अवस्था का अस्तित्व है, इस पर कोई सहमति नहीं है।

यूकेरियोटिक सुपरग्रुप
2004 में, सिम्पसन और रोजर के एक समीक्षा लेख ने नोट किया कि प्रोटिस्टा "सभी यूकेरियोट्स के लिए एक हड़पने वाला थैला था जो जानवर, पौधे या कवक नहीं हैं"। उनका मानना था कि केवल मोनोफिलेटिक समूहों को एक वर्गीकरण में औपचारिक रैंक के रूप में स्वीकार किया जाना चाहिए और - जबकि यह दृष्टिकोण पहले अव्यावहारिक था ("सचमुच दर्जनों यूकेरियोटिक 'अवस्था' की आवश्यकता") - अब यूकेरियोट्स को "सिर्फ" में विभाजित करना संभव हो गया था। कुछ प्रमुख समूह जो संभवत: सभी मोनोफिलेटिक हैं". इस आधार पर, आरेख के विपरीत (उनके लेख से फिर से खींचा गया) ने यूकेरियोट्स के वास्तविक "अवस्था" (उनके उद्धरण चिह्नों) को दिखाया। इस दृष्टिकोण का अनुसरण करने वाला एक वर्गीकरण 2005 में इंटरनेशनल सोसाइटी ऑफ प्रोटिस्टोलॉजिस्ट के लिए एक समिति द्वारा तैयार किया गया था, जिसने "कई समाजों के विशेषज्ञों के सहयोग से काम किया"। यूकेरियोट्स को समान छह "सुपरग्रुप्स" में विभाजित किया। प्रकाशित वर्गीकरण में जानबूझकर औपचारिक टैक्सोनॉमिक रैंक का उपयोग नहीं किया गया, जिसमें "राज्य" भी शामिल है।

इस प्रणाली में बहुकोशिकीय प्राणी(मेटाज़ोआ) एक ही पूर्वज से निकले हैं, एक ही पूर्वज से निकले हैं, जो कि एककोशिकीय चोएनोफ्लैगलेट्स और कवक दोनों हैं, जो ओपिसथोकोंटा का निर्माण करते हैं। पौधों को जानवरों और कवक से अधिक दूर से संबंधित माना जाता है।

चूंकि, उसी वर्ष जब इंटरनेशनल सोसाइटी ऑफ प्रोटिस्टोलॉजिस्ट्स का वर्गीकरण प्रकाशित हुआ था (2005), संदेह व्यक्त किया जा रहा था कि क्या इनमें से कुछ सुपरग्रुप्स मोनोफिलेटिक थे, विशेष रूप से क्रोमाल्वियोलेटा, [45] और 2006 में एक समीक्षा में कमी का उल्लेख किया गया था। छह प्रस्तावित सुपरग्रुप्स में से कई के लिए साक्ष्य।

2010 तक, इस बात पर व्यापक सहमति है कि राइजेरिया स्ट्रैमेनोपाइल्स और अल्वेलाटा से संबंधित है जिसे एसएआर सुपरग्रुप करार दिया गया है, ताकि Rhizaria मुख्य यूकेरियोट समूहों में से एक न हो।   इसके अतिरिक्त कोई सहमति बनती नजर नहीं आ रही है। रोगोज़िन एट अल। 2009 में उल्लेख किया गया कि "यूकेरियोट्स की गहरी फाइलोजेनी एक अत्यंत कठिन और विवादास्पद समस्या है। दिसंबर 2010 तक, एक आम सहमति प्रतीत होती है कि 2005 में प्रस्तावित छह सुपरग्रुप मॉडल यूकेरियोट्स के वास्तविक फाइलोजेनी को प्रतिबिंबित नहीं करते हैं और इसलिए उन्हें कैसे वर्गीकृत किया जाना चाहिए, चूंकि मॉडल के बारे में कोई सहमति नहीं है जो इसे प्रतिस्थापित करे।

शीर्ष स्तर के वर्गीकरण की तुलना
कुछ लेखकों ने अपने वर्गीकरण में गैर-कोशिकीय जीवन को जोड़ा है। यह गैर-सेलुलर जीवन का एसिटोटा नामक एक सुपरडोमेन बना सकता है, जिसे अपनोबिओंटा भी कहा जाता है; अन्य सुपरडोमेन साइटोटा या सेलुलर जीवन के साथ।इओसाइट परिकल्पना का प्रस्ताव है कि यूकेरियोट्स आर्किया के भीतर एक फाइलम से उभरे हैं जिसे थर्मोप्रोटोटा कहा जाता है (जिसे पहले ईसाइट्स या क्रैनार्कियोटा के रूप में जाना जाता था)।

वायरस
विषाणुओं के वर्गीकरण पर अंतर्राष्ट्रीय समिति विषाणुओं के वर्गीकरण के लिए वर्गिकी रैंक जगतका उपयोग करती है (प्रत्यय -विरा के साथ); परन्तु यह दायरे (वायरोलॉजी) और सबरेल्म के शीर्ष स्तर के वर्गीकरण के नीचे है। इस बात पर बहस चल रही है कि क्या वायरस को जीवन के पेड़ में शामिल किया जा सकता है।इसके खिलाफ तर्कों में यह तथ्य शामिल है कि वे बाध्यकारी इंट्रासेल्यूलर परजीवी हैं जिनमें चयापचय की कमी होती है और मेजबान सेल के बाहर प्रतिकृति करने में सक्षम नहीं होते हैं। एक और तर्क यह है कि पेड़ में उनका स्थान समस्याग्रस्त होगा, क्योंकि यह संदेह है कि वायरस कई बार उत्पन्न हुए हैं, और उनके पास अपने मेजबानों से न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों की कटाई के लिए एक प्रवृत्ति है।

दूसरी ओर, तर्क उनके शामिल किए जाने के पक्ष में हैं। एक असामान्य रूप से बड़े और जटिल वायरस की खोज से आता है, जैसे कि मिमिवायरस, जिसमें विशिष्ट कोशिकीय जीन होते हैं।

यह भी देखें

 * क्लैडिस्टिक्स
 * फाइलोजेनेटिक्स
 * व्यवस्थित
 * वर्गीकरण (जीव विज्ञान)

अग्रिम पठन

 * Pelentier, B. (2007-2015). Empire Biota: a comprehensive taxonomy, . [Historical overview.]
 * Peter H. Raven and Helena Curtis (1970), Biology of Plants, New York: Worth Publishers. [Early presentation of five-kingdom system.]

बाहरी संबंध

 * A Brief History of the Kingdoms of Life at Earthling Nature
 * The five kingdom concept
 * Whittaker's classification