कैंसर में दैहिक विकास

दैहिक विकास जीवन भर के दौरान दैहिक कोशिकाओं (जर्म प्लाज़्म और शारीरिक कोशाणू के विपरीत एक शरीर की कोशिकाओं) में उत्परिवर्तन और स्‍तभोपररिचना का संचय है, और उन कोशिकाओं की उपयुक्तता पर उन म्यूटेशन और स्‍तभोपररिचना का प्रभाव है। इस विकासवादी प्रक्रिया को सबसे पहले बर्ट वोगेलस्टीन के पेट के कैंसर के अध्ययन से दर्शाया गया है। उम्र बढ़ने की प्रक्रिया के साथ-साथ कैंसर सहित कुछ बीमारियों के विकास में दैहिक विकास महत्वपूर्ण है।

कैंसर में प्राकृतिक चयन
पूर्व-घातक और घातक नवोप्लाज्म (ट्यूमर) में कोशिकाएं प्राकृतिक चयन द्वारा विकसित होती हैं। यह बताता है कि सामान्य ऊतक से कैंसर कैसे विकसित होता है और इसका इलाज क्यों मुश्किल हो गया है। प्राकृतिक चयन के लिए तीन आवश्यक और पर्याप्त शर्तें हैं, जो सभी नियोप्लाज्म में पूरी होती हैं:
 * 1) जनसंख्या में भिन्नता होनी चाहिए। नियोप्लाज्मा आनुवंशिक और अनुजात दोनों परिवर्तनों के साथ विभिन्न उत्परिवर्ती कोशिकाओं के पच्चीकारी चित्र वर्ण हैं जो उन्हें सामान्य कोशिकाओं से अलग करते हैं।
 * 2) चर लक्षण विरासत में होना चाहिए। जब एक कैंसर कोशिका विभाजित होती है, तो दोनों पुत्री कोशिकाएं मूल कोशिका की आनुवंशिक और अनुजात असामान्यताओं को विरासत में लेती हैं, और कोशिकीय प्रजनन की प्रक्रिया में नई आनुवंशिक और अनुजात असामान्यताएं भी प्राप्त कर सकती हैं।
 * 3) उस भिन्नता को जीवित रहने या प्रजनन (उपयुक्तता) को प्रभावित करना चाहिए। जबकि नियोप्लाज्म में कई आनुवंशिक और अनुजात असामान्यताएं शायद तटस्थ विकास के रूप में हैं, कई को उत्परिवर्ती कोशिकाओं के प्रसार को बढ़ाने या उनकी मृत्यु दर (एपोप्टोसिस) को कम करने के लिए दर्शाया गया है।

नियोप्लाज्म में कोशिकाएं ऑक्सीजन और ग्लूकोज के साथ-साथ अंतरिक्ष जैसे संसाधनों के लिए प्रतिस्पर्धा करती हैं। इस प्रकार, एक कोशिका जो एक उत्परिवर्तन प्राप्त करती है जो अपनी उपयुक्तता को बढ़ाती है, उस उत्परिवर्तन की कमी वाले प्रतिस्पर्धी कोशिकाओं की तुलना में अधिक बेटी कोशिकाओं को उत्पन्न करेगी। इस तरह, उत्परिवर्तित कोशिकाओं की आबादी, जिसे क्लोन कहा जाता है, नियोप्लाज्म में फैल सकती है। क्लोनल विस्तार कैंसर में प्राकृतिक चयन का हस्ताक्षर है।

कैंसर उपचार कृत्रिम चयन के रूप में कार्य करते हैं, संवेदनशील कैंसर कोशिकाओं को मारते हैं, लेकिन प्रतिरोधी कोशिकाओं को पीछे छोड़ देते हैं। प्रायः ट्यूमर उन प्रतिरोधी कोशिकाओं से वापस आ जाएगा, रोगी फिर से जीवित हो जाएगा, और जो चिकित्सा पहले प्रयोग  की गई थी वह अब कैंसर कोशिकाओं को नहीं मार पाएगी। प्रतिरोध के लिए यह चयन एक कीटनाशक के साथ बार-बार फसलों पर छिड़काव करने और प्रतिरोधी कीटों के चयन के समान है जब तक कि कीटनाशक प्रभावी न हो।

जटिल जैविक प्रणालियों में विकास
जैविक विकास का आधुनिक वर्णन प्रायः विकास के प्रमुख योगदान कारकों पर विस्तृत होगा जैसे कि स्थानीय सूक्ष्म वातावरण, उत्परिवर्तनीय मजबूती, आणविक अध: पतन, और गूढ़ आनुवंशिक विविधता का निर्माण। विकास में योगदान देने वाले इन कारकों में से कई को पृथक किया गया है और कैंसर के लिए वर्णित किया गया है।

बहुस्तरीय चयन
कैंसर एक उत्कृष्ट उदाहरण है जिसे विकासवादी जीवविज्ञानी बहुस्तरीय चयन कहते हैं: जीव के स्तर पर, कैंसर प्रायः घातक होता है इसलिए जीन और ऊतकों के संगठन के लिए चयन होता है जो कैंसर को दबाते हैं। सेल के स्तर पर, बढ़े हुए सेल प्रसार और उत्तरजीविता के लिए चयन होता है, जैसे कि एक उत्परिवर्ती सेल जो कैंसर के लक्षणों में से एक को प्राप्त करता है उन कोशिकाओं पर प्रतिस्पर्धात्मक लाभ होगा जिन्होंने बानगी अधिग्रहण नहीं किया है। इस प्रकार, कोशिका के स्तर पर कैंसर के लिए चयन होता है।

प्री-नोवेल और केर्न्स
नियोप्लास्टिक विकास के बारे में प्रारंभिक विचार बोवेरी से आते हैं जिन्होंने प्रस्तावित किया था कि क्रोमोसोमल असामान्यताओं में उत्पन्न होने वाले ट्यूमर बेटी कोशिकाओं में पारित हो जाते हैं। इसके बाद के दशकों में, कैंसर को क्रोमोसोमल विपथन से जुड़े एक क्लोनल मूल के रूप में पहचाना गया था।  आर्मिटेज और डॉल द्वारा कैंसर के प्रारंभिक गणितीय मॉडलिंग ने कैंसर के दैहिक विकासवादी सिद्धांत के भविष्य के विकास के लिए मंच तैयार किया।आर्मिटेज और डॉल ने इस उम्र के एक कार्य के रूप में, दैहिक उत्परिवर्तन (या अन्य दर सीमित चरणों) के अनुक्रमिक संचय की प्रक्रिया के रूप में, कैंसर घटना आंकड़ों की व्याख्या की। साइटोजेनेटिक्स में प्रगति ने नियोप्लाज्म में क्रोमोसोम असामान्यताओं की खोज की सुविधा प्रदान की, जिसमें क्रोनिक माइलोजेनस ल्यूकेमिया में फिलाडेल्फिया क्रोमोसोम और तीव्र मायलोब्लास्टिक ल्यूकेमिया में स्थानान्तरण सम्मिलित हैं। एक ट्यूमर में एक दूसरे को बदलने वाले कैरियोटाइप के अनुक्रमों को प्रगति के रूप में देखा गया। एक ट्यूमर में एक दूसरे की जगह कैरियोटाइप के क्रम देखे गए जैसे-जैसे यह आगे बढ़ता गया   शोधकर्ताओं ने अनुमान लगाया कि कैंसर क्रोमोसोमल म्यूटेशन और चयन के अनुक्रम में विकसित होता है।और यह चिकित्सा आगे क्लोन का चयन कर सकती है

नडसन, केर्न्स और नोवेल
1971 में, नुडसन ने रेटिनोब्लास्टोमा के वंशानुगत और छिटपुट मामलों के सांख्यिकीय विश्लेषण के आधार पर उत्परिवर्तन और कैंसर के लिए 2-हिट परिकल्पना प्रकाशित की। उन्होंने पोस्ट किया कि रेटिनोब्लास्टोमा दो उत्परिवर्तन के परिणामस्वरूप विकसित हुआ; जिनमें से एक वंशानुगत या दैहिक हो सकता है और उसके बाद दूसरा दैहिक उत्परिवर्तन हो सकता है। साइटोजेनेटिक अध्ययन ने इस क्षेत्र को क्रोमोसोम 13 की लंबी भुजा में स्थानांतरित कर दिया, और आणविक आनुवंशिक अध्ययनों से पता चला कि ट्यूमरजेनिसिस क्रोमोसोमल तंत्र के साथ जुड़ा हुआ था।जैसे माइटोटिक पुनर्संयोजन या गैर-विघटन, जो उत्परिवर्तन की समरूपता को जन्म दे सकता है। रेटिनोब्लास्टोमा जीन 1986 में क्लोन किया जाने वाला पहला ट्यूमर सप्रेसर जीन था।

केर्न्स ने 1975 में ऊतक संरचना पर आधारित एक अलग, लेकिन पूरक, ट्यूमर के दमन की क्रियाविधि की परिकल्पना की थी, ताकि आंत और अन्य उपकला अंगों जैसे प्रसार करने वाली उपकला आबादी में बढ़ी हुई उपयुक्तता के साथ विभिन्न प्रकार की दैहिक कोशिकाओं के चयन से बचाया जा सके। उन्होंने कहा कि यह स्टेम सेल की संख्या को सीमित करके पूरा किया जा सकता है, उदाहरण के लिए आंतों के क्रिप्ट के आधार पर और आंत में विभेदित आंतों की कोशिकाओं को बहाकर कोशिकाओं के बीच प्रतिस्पर्धा के अवसरों को रोका जा सकता है। इस मॉडल की आवश्यक भविष्यवाणियों की पुष्टि की गई है, यद्यपि  CDKN2A (p16) सहित कुछ ट्यूमर शमन जीनों में उत्परिवर्तन, बैरेट के अन्नप्रणाली जैसी कुछ स्थितियों में बड़ी संख्या में क्रिप्ट्स को सम्मिलित करने वाले क्लोनल विस्तार का अनुमान लगाते हैं। उन्होंने एक अमर DNA स्ट्रैंड को भी पोस्ट किया जिसकी चर्चा अमर DNA स्ट्रैंड परिकल्पना में की गई है।

नोवेल ने आनुवंशिक अस्थिरता और प्राकृतिक चयन की प्रक्रिया के रूप में 1976 में कैंसर के विकासवादी दृष्टिकोण को संश्लेषित किया। होने वाले अधिकांश परिवर्तन कोशिका के लिए हानिकारक होते हैं, और वे क्लोन विलुप्त हो जाते हैं, लेकिन कभी-कभी चुनिंदा लाभकारी उत्परिवर्तन उत्पन्न होते हैं जो क्लोनल विस्तार को जन्म देते हैं। यह सिद्धांत उत्परिवर्तन की यादृच्छिक प्रक्रिया, मानव आबादी में आनुवंशिक बहुरूपता, और चयन में अंतर के कारण प्रत्येक नियोप्लाज्म में एक अद्वितीय आनुवंशिक संरचना की भविष्यवाणी करता है। हस्तक्षेप से विभिन्न रोगियों में अलग-अलग परिणाम होने की भविष्यवाणी की जाती है। क्या यह अधिक महत्वपूर्ण है, सिद्धांत चिकित्सा के चुनिंदा दबावों के तहत प्रतिरोधी क्लोनों के उद्भव की भविष्यवाणी करता है। 1976 से, शोधकर्ताओं ने कई अलग-अलग प्रकार के नियोप्लाज्म के भीतर क्लोनल विस्तार और आनुवंशिक विषमता की पहचान की है         ।

नियोप्लाज्म में आनुवंशिक विषमता
एकल न्यूक्लियोटाइड बहुरूपता (SNP) सहित कैंसर से जुड़ी आनुवंशिक विषमता के कई स्तर हैं, अनुक्रम उत्परिवर्तन, माइक्रोसैटेलाइट शिफ्ट और अस्थिरता, विषमलैंगिकता (LOH) की हानि, प्रतिलिपि संख्या भिन्नता (तुलनात्मक जीनोमिक संकरण (CGH) द्वारा दोनों का पता लगाया गया, और सरणी CGH, ) और कैरियोटाइपिक विविधताएं जिनमें गुणसूत्र संरचनात्मक विपथन और औप्लोइडी सम्मिलित हैं।   इस मुद्दे के अध्ययन ने मुख्य रूप से जीन म्यूटेशन स्तर पर ध्यान केंद्रित किया है, क्योंकि प्रतिलिपि संख्या भिन्नता, LOH और विशिष्ट क्रोमोसोमल ट्रांसलोकेशन को जीन म्यूटेशन के संदर्भ में समझाया गया है। इस प्रकार जटिल प्रणाली और बहुस्तरीय चयन के संदर्भ में आनुवंशिक भिन्नता के कई स्तरों को एकीकृत करना आवश्यक है।

आनुवंशिक विविधता के लिए निकाय अस्थिरता एक प्रमुख योगदान कारक है। अधिकांश कैंसर के लिए, जीनोम अस्थिरता पूरे जीनोम DNA अनुक्रम में उत्परिवर्तन की एक बड़ी आवृत्ति में परिलक्षित होती है (न केवल प्रोटीन कोडिंग क्षेत्र जो जीनोम का केवल 1.5% है ). विभिन्न प्रकार के कैंसर के पूरे जीनोम अनुक्रमण में, दो स्तन कैंसर में बड़ी संख्या में उत्परिवर्तन पाए गए (लगभग 20,000 बिंदु उत्परिवर्तन) ), 25 मेलानोमा (9,000 से 333,000 पॉइंट म्यूटेशन )विभिन्न प्रकार के कैंसर के पूरे जीनोम अनुक्रमण में, दो स्तन कैंसर (लगभग 20,000 पॉइंट म्यूटेशन ). जीनोम अस्थिरता को कैंसर के विकास के अंतिम बिंदुओं को प्राप्त करने के लिए एक सक्षम विशेषता के रूप में भी जाना जाता है।

कई दैहिक विकासवादी अध्ययन परंपरागत रूप से क्लोनल विस्तार पर केंद्रित रहे हैं, क्योंकि उपलब्ध तरीकों के आधार पर विकासवादी पथ को स्पष्ट करने के लिए आवर्तक प्रकार के परिवर्तनों का पता लगाया जा सकता है। प्रत्यक्ष DNA अनुक्रमण और कैरियोटाइप विश्लेषण दोनों से हाल के अध्ययन दैहिक विकास में उच्च स्तर की विषमता के महत्व को दर्शाते हैं। ठोस ट्यूमर के गठन के लिए, क्लोनल और गैर-क्लोनल विस्तार के कई चक्र सम्मिलित होते हैं। विशिष्ट क्लोनल विस्तार चरण में भी, सेल आबादी के भीतर विषमता के महत्वपूर्ण स्तर हैं,यद्यपि अधिकांश का पता तब लगाया जाता है जब आणविक विश्लेषण के लिए कोशिकाओं की मिश्रित आबादी का उपयोग किया जाता है। ठोस ट्यूमर में, अधिकांश जीन उत्परिवर्तन आवर्ती प्रकार नहीं होते हैं, और न ही कैरियोटाइप होते हैं। ये विश्लेषण निष्कर्षों के लिए एक स्पष्टीकरण प्रदान करते हैं कि अधिकांश कैंसर द्वारा साझा किए गए कोई सामान्य उत्परिवर्तन नहीं हैं।

एपिजेनेटिक्स द्वारा दैहिक विकास
आनुवंशिक परिवर्तन के अलावा, कोशिका की स्थिति को एपिजेनेटिक रूप से बदला जा सकता है। जीन के प्रमोटर क्षेत्रों में न्यूक्लियोटाइड् के CG जोड़े के मिथाइलेशन में परिवर्तन द्वारा ट्यूमर में सबसे अच्छी तरह से समझा जाने वाला एपिजेनेटिक परिवर्तन जीन की अभिव्यक्ति है। इन मेथिलिकरण पैटर्न को नए गुणसूत्रों में नक़ल किया जाता है जब कोशिकाएं अपने जीनोम को दोहराती हैं और इसलिए मेथिलिकरण परिवर्तन आनुवांशिक होते हैं और प्राकृतिक चयन के अधीन होते हैं।इसी तरह, जब DNA की मरम्मत प्रोटीन PMS2 की अभिव्यक्ति की  हानि कोलन कैंसर में होती है, तो यह लगभग 5% समय के उत्परिवर्तन के कारण होता है, जबकि अधिकतर मामलों में अभिव्यक्ति की हानि इसके जोड़ीदार पार्टनर MLH1 के प्रमोटर के मिथाइलेशन के कारण होती है ( MLH1 की अनुपस्थिति में PMS2 अस्थिर है। प्रगति में एपिजेनेटिक परिवर्तन आनुवंशिक परिवर्तनों के साथ परस्पर क्रिया करते हैं। उदाहरण के लिए, DNA(जैसे MLH1 या MSH2) में खराबी या क्षति की मरम्मत के लिए जिम्मेदार जीन की एपिजेनेटिक साइलेंसिंग के परिणामस्वरूप वृद्धि होती है।

डीएनए की मरम्मत करने वाले प्रोटीन PMS2, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6 या BRCA2 की कमी से उत्परिवर्तन आवृत्ति में 100 गुना तक वृद्धि हो सकती है।  DNA की मरम्मत जीन प्रोटीन अभिव्यक्ति में एपिजेनेटिक कमियां कई कैंसर में पाई गई हैं यद्यपि सभी कैंसरों में सभी कमियों का मूल्यांकन नहीं किया गया है। एपिजेनेटिक रूप से कमी वाले DNA मरम्मत प्रोटीन में वर्नर सिंड्रोम ATP-निर्भर हेलिकेज़, O-6-मिथाइलगुआनिन-डीएनए मिथाइलट्रांसफेरेज़, MLH1, MSH2, ERCC1, PMS2, XPF, P53, प्रोलिफेरिंग सेल न्यूक्लियर एंटीजन और ओक्सोगुआनिन ग्लाइकोसिलेज़ सम्मिलित हैं, विभिन्न कैंसर में ये 13% से 100% की आवृत्ति पर कमी पर पाए जाते हैं । (डीएनए की मरम्मत करने वाले जीन में कैंसर एपिजेनेटिक्स एपिम्यूटेशन की आवृत्ति भी देखें।)

अच्छी तरह से अध्ययन किए गए एपिजेनेटिक प्रमोटर मिथाइलेशन के अतिरिक्त, हाल ही में हिस्टोन और क्रोमैटिन आर्किटेक्चर में बदलाव और माइक्रोRNA (माइक्रोRNA या तो संदेशक RNA के क्षरण का कारण बनते हैं या उनके अनुवाद को अवरुद्ध करते हैं) की अभिव्यक्ति में परिवर्तन के कारण कैंसर में एपिजेनेटिक परिवर्तनों के पर्याप्त निष्कर्ष सामने आए हैं। उदाहरण के लिए, माइक्रोRNA MIR-155 के लिए प्रमोटर का हाइपोमेथिलीकरण MIR-155 की अभिव्यक्ति को बढ़ाता है, और यह बढ़ा हुआ MIR-155 DNAमरम्मत जीन MLH1, MSH2 को लक्षित करता है। कैंसर में, जीन की अभिव्यक्ति का नुकसान उत्परिवर्तन की तुलना में ट्रांसक्रिप्शन साइलेंसिंग (CpG द्वीपों के शारीरिक रूप से वंशानुगत प्रमोटर हाइपरमेथिलेशन के कारण) के कारण वोगेलस्टीन एट अल के रूप में लगभग 10 गुना अधिक होता है। ध्यान दें, कोलोरेक्टल कैंसर में प्रायः लगभग 3 से 6 ड्राइवर उत्परिवर्तन और 33 से 66 सहयात्री या यात्री उत्परिवर्तन होते हैं। इसके विपरीत, आसन्न सामान्य दिखने वाले कोलोनिक म्यूकोसा की तुलना में कोलन ट्यूमर में, लगभग 600 से 800 शारीरिक रूप से वंशानुगत भारी मिथाइल होते हैं।  सीपीजी डाइन्यूक्लियोटाइड् के साइटोसिन का मिथाइलेशन एक दैहिक रूप से वंशानुगत और संरक्षित नियामक चिह्न है जो प्रायः  ट्रांसक्रिप्शनल दमन से जुड़ा होता है। CpG द्वीप कई कोशिका पीढ़ियों के माध्यम से अपनी समग्र अन-मिथाइलेटेड अवस्था (या मिथाइलेटेड अवस्था) को बेहद स्थिर रखते हैं।

क्लोनल विस्तार
नियोप्लास्टिक प्रगति की एक सामान्य विशेषता आनुवंशिक या एपिजेनेटिक परिवर्तन के साथ क्लोन का विस्तार है। यह संयोग की बात हो सकती है, लेकिन ऊतक में अन्य कोशिकाओं पर प्रतिस्पर्धात्मक लाभ (या तो प्रजनन या अस्तित्व लाभ) के विस्तार वाले क्लोन के कारण इसकी अधिक संभावना है। चूंकि क्लोनों के जीनोम में प्रायः कई आनुवंशिक और एपिजेनेटिक परिवर्तन होते हैं, इसलिए यह प्रायः स्पष्ट नहीं होता है कि उनमें से कौन सा परिवर्तन प्रजनन या उत्तरजीविता लाभ का कारण बनता है और कौन सा अन्य परिवर्तन क्लोनल विस्तार पर जेनेटिक हिचहाइकिंग या पैसेंजर म्यूटेशन (नीचे शब्दावली देखें) हैं।

क्लोनल विस्तार प्रायः p53 (TP53) या p16 (CDKN2A/INK4a) ट्यूमर दमन जीन के नुकसान से जुड़े होते हैं। फेफड़ों के कैंसर में, p53 उत्परिवर्तन वाला एक क्लोन एक पूरे फेफड़े की सतह पर और दूसरे फेफड़े में फैलता हुआ देखा गया। मूत्राशय के कैंसर में, p16 की हानि वाले क्लोन मूत्राशय की पूरी सतह पर फैलते हुए देखे गए।  इसी तरह, मौखिक गुहा में और बैरेट के अन्नप्रणाली में p16 की हानि के साथ क्लोनों का बड़ा विस्तार देखा गया है। इसी तरह, मौखिक गुहा। और बैरेट के अन्नप्रणाली में p16 की हानि के साथ क्लोनों का बड़ा विस्तार देखा गया है p53 के निष्क्रिय होने से जुड़े क्लोनल विस्तार त्वचा, , बैरेट घेघा, दिमाग, और किडनी। आगे पेट में क्लोनल विस्तार देखा गया है, मूत्राशय, बृहदान्त्र, फेफड़ा, हेमेटोपोएटिक (रक्त) कोशिकाएं, और प्रोस्टेट। में क्लोनल विस्तार देखा गया  क्लोनल विस्तार कम से कम दो कारणों से महत्वपूर्ण हैं। सबसे पहले, वे उत्परिवर्ती कोशिकाओं की एक बड़ी लक्ष्य आबादी उत्पन्न करते हैं और इस प्रकार संभावना बढ़ जाती है कि कैंसर उत्पन्न करने के लिए आवश्यक कई उत्परिवर्तन उस क्लोन के भीतर प्राप्त हो जाएंगे। दूसरा, कम से कम एक मामले में, p53 की हानि के साथ क्लोन का आकार प्री-मैलिग्नेंट ट्यूमर के कैंसरग्रस्त होने के बढ़ते जोखिम से जुड़ा हुआ है। ऐसा माना जाता है कि कैंसर के विकास की प्रक्रिया में ट्यूमर के भीतर क्लोनल विस्तार की लगातार तरंगें सम्मिलित होती हैं।

क्षेत्र दोष
शब्द "फ़ील्ड कैंसराइज़ेशन" का प्रयोग पहली बार 1953 में एपिथेलियम के एक क्षेत्र या "फ़ील्ड" का वर्णन करने के लिए किया गया था जो कि बड़े पैमाने पर अज्ञात प्रक्रियाओं द्वारा पूर्वनिर्धारित किया गया था ताकि इसे कैंसर के विकास की ओर अग्रसर किया जा सके। तब से, "फ़ील्ड कैंसरकरण" और "फ़ील्ड दोष" शब्दों का उपयोग पूर्व-घातक ऊतक का वर्णन करने के लिए किया गया है जिसमें नए कैंसर उत्पन्न होने की संभावना है।उदाहरण के लिए, गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल (GI) पथ में ट्यूमरजेनसिस के अधीन अधिकांश प्रमुख क्षेत्रों में क्षेत्र दोषों की पहचान की गई है। GIपथ के कैंसर जो कुछ हद तक क्षेत्र दोषों के कारण होते हैं, उनमें सिर और गर्दन स्क्वैमस सेल कार्सिनोमा (HNSCC), ऑरोफरीन्जियल/लेरिन्जियल कैंसर, एसोफेजियल एडेनोकार्सिनोमा और एसोफेजियल स्क्वैमस-सेल कार्सिनोमा, गैस्ट्रिक कैंसर, पित्त नली का कैंसर सम्मिलित हैं इनमे से अग्नाशय कैंसर, छोटी आंत का कैंसर और पेट का कैंसर हैं।

बृहदान्त्र में, एक क्षेत्र दोष संभवतः बृहदान्त्र की आंतरिक सतह पर आंतों के क्रिप्ट में से एक के आधार पर स्टेम कोशिकाओं के बीच एक उत्परिवर्ती या एपिजेनेटिक रूप से परिवर्तित कोशिका के प्राकृतिक चयन से उत्पन्न होता है। एक उत्परिवर्ती या एपिजेनेटिक रूप से परिवर्तित स्टेम सेल, यदि इसमें चयनात्मक लाभ है, तो प्राकृतिक चयन द्वारा अन्य निकटवर्ती स्टेम कोशिकाओं को प्रतिस्थापित कर सकता है। इससे असामान्य ऊतक का पैच या क्षेत्र दोष हो सकता है।इस अनुभाग के चित्र में बृहदान्त्र के एक ताज़ा कटे हुए और लंबाई में खुले खंड की तस्वीर सम्मिलित है जो एक बड़े क्षेत्र दोष का प्रतिनिधित्व कर सकता है जिसमें एक बृहदान्त्र कैंसर और चार जंतु हैं। चार जंतु, कैंसर केअतिरिक्त, प्रजनन संबंधी लाभों के साथ उप-क्लोन का प्रतिनिधित्व कर सकते हैं।

इस संभावित क्षेत्र दोष को जन्म देने वाली घटनाओं का क्रम फोटो के नीचे दर्शाया गया है। योजनाबद्ध आरेख पीले रंग में एक बड़ा क्षेत्र दर्शाता है जो उत्परिवर्ती या एपिजेनेटिक रूप से परिवर्तित कोशिकाओं के एक बड़े पैच को दर्शाता है जो चयनात्मक लाभ के आधार पर प्रारंभिक कोशिका के क्लोनल विस्तार द्वारा गठित होता है। इस पहले बड़े पैच के भीतर, एक दूसरा ऐसा उत्परिवर्तन या एपिजेनेटिक परिवर्तन हुआ हो सकता है जिससे किसी दिए गए स्टेम सेल ने पैच के भीतर अन्य स्टेम कोशिकाओं की तुलना में अतिरिक्त चयनात्मक लाभ प्राप्त कर लिया हो, और यह परिवर्तित स्टेम सेल एक द्वितीयक पैच बनाते हुए क्लोन रूप से विस्तारित हो गया हो, या मूल पैच के भीतर, उप-क्लोन रखे हो। इसे आरेख में बड़े पीले मूल क्षेत्र के भीतर विभिन्न रंगों के चार छोटे पैच द्वारा दर्शाया गया है।इन नए पैच (उप-क्लोन) के भीतर, प्रक्रिया को कई बार दोहराया जा सकता है, जो कि चार माध्यमिक पैच (आरेख में अभी भी अलग-अलग रंगों के साथ) के भीतर छोटे पैच द्वारा इंगित किया गया है, जो क्लोन रूप से विस्तारित हुआ, जब तक कि एक स्टेम सेल उत्पन्न नहीं हुआ जो उत्पन्न हुआ है उनमे या तो छोटे जंतु (जो सौम्य नियोप्लाज्म हो सकते हैं) या फिर घातक नियोप्लाज्म (कैंसर)उपस्थित हैं। फोटो के नीचे दिए गए चित्र में, इन नियोप्लाज्म को 4 छोटे रंगे हुए गोले (जंतु) और एक बड़े लाल क्षेत्र (कैंसर) द्वारा भी दर्शाया गया है।फोटो में कैंसर बृहदान्त्र के सेकल क्षेत्र में हुआ, जहां बृहदान्त्र छोटी आंत से जुड़ता है और जहां परिशिष्ट होता है। फोटो में वसा बृहदान्त्र की बाहरी दीवार के बाहर है। यहां दिखाए गए कोलन के खंड में, कोलन की आंतरिक सतह को उजागर करने और कोलन के आंतरिक उपकला अस्तर के भीतर होने वाले कैंसर और जंतु को प्रदर्शित करने के लिए कोलन को लंबाई में काटा गया था।

वंशावली विश्लेषण
कोशिकाओं के बीच विकासवादी संबंधों को प्रकट करने के लिए फ़ाइलोजेनेटिक्स को ट्यूमर की कोशिकाओं पर लागू किया जा सकता है, जैसे इसका उपयोग जीवों और प्रजातियों के बीच विकासवादी संबंधों को प्रकट करने के लिए किया जाता है। शिबाता, तवरे और सहकर्मियों ने ट्यूमर की शुरुआत और क्लिनिक में इसका पता लगाने के बीच के समय का अनुमान लगाने के लिए इसका उपयोग किया है। लौहेलेनेन एट अल. हेटेरोज़ायोसिटी के नुकसान के आधार पर जीवित ऊतकों की जांच और नमूनों के बीच संबंधों को फिर से बनाने के लिए पारसीमोनी का उपयोग किया गया है। फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों को ऑन्कोजेनेटिक पेड़ों के साथ भ्रमित नहीं किया जाना चाहिए, जो नियोप्लास्टिक प्रगति के दौरान आनुवंशिक घटनाओं के सामान्य अनुक्रमों का प्रतिनिधित्व करते हैं और सामान्य वंश के संबंधों का प्रतिनिधित्व नहीं करते हैं जो फ़ाइलोजेनी के लिए आवश्यक हैं। इस क्षेत्र में नवीनतम समीक्षा के लिए, बास्ट 2012 देखें।

अनुकूली परिदृश्य
एक अनुकूली परिदृश्य एक काल्पनिक सांस्थितिक परिदृश्य है जिस पर विकास होने की कल्पना की जाती है। यह राइट के उपयुक्तता परिदृश्य के समान है जिसमें प्रत्येक बिंदु का स्थान एक जीव के जीनोटाइप का प्रतिनिधित्व करता है और ऊंचाई वर्तमान वातावरण में उस जीव की उपयुक्तता का प्रतिनिधित्व करती है। यद्यपि राइट के कठोर परिदृश्य के विपरीत, अनुकूली परिदृश्य लचीला है। यह जनसंख्या घनत्व और उत्तरजीविता/प्रजनन रणनीतियों में परिवर्तन के साथ आसानी से अपना आकार बदलता है।

विकास का राइट का स्थानांतरण संतुलन सिद्धांत आनुवंशिक बहाव (जीन के संचरण में यादृच्छिक नमूनाकरण त्रुटि) और प्राकृतिक चयन को जोड़ता है जिससे यह समझाया जा सके कि उपयुक्तता परिदृश्य पर एकाधिक चोटियों पर कैसे कब्जा किया जा सकता है या इस परिदृश्य पर एक आबादी उच्च शिखर कैसे प्राप्त कर सकती है। यह सिद्धांत, चयन के प्रमुख रूपों के रूप में घनत्व-निर्भर चयन की धारणा पर आधारित है, जिसका परिणाम एक उपयुक्तता परिदृश्य है जो अपेक्षाकृत कठोर है। एक कठोर परिदृश्य वह है जो अभिक्रिया में नहीं बदलता है।

उपयुक्तता परिदृश्य के विपरीत, अनुकूली परिदृश्य का निर्माण यह मानते हुए किया जाता है कि इसमें घनत्व और आवृत्ति-निर्भर चयन दोनों सम्मिलित हैं (चयन आवृत्ति-निर्भर होता है जब किसी प्रजाति की उपयुक्तता न केवल उस प्रजाति की रणनीति पर बल्कि अन्य सभी प्रजातियों की रणनीति पर भी निर्भर करती है) ). इस प्रकार, रणनीतियों और घनत्वों में छोटे बदलावों के जवाब में अनुकूली परिदृश्य का आकार काफी हद तक बदल सकता है। अनुकूली परिदृश्यों का लचीलापन प्राकृतिक चयन के लिए घाटियों को पार करने और अपनी रणनीतियों में बड़े बदलाव किए बिना कई चोटियों पर कब्जा करने के कई तरीके प्रदान करता है। जनसंख्या गतिशीलता के लिए अंतर या अंतर समीकरण मॉडल के संदर्भ में, एक उपयुक्तता उत्पादन फलन का उपयोग करके वास्तव में एक अनुकूली परिदृश्य का निर्माण किया जा सकता है। यदि कोई प्रजाति विकसित होने में सक्षम है, तो समय के साथ, यह क्रमिक परिवर्तनों के माध्यम से उपयुक्त शिखर की ओर अनुकूली परिदृश्य पर "चढ़" जाएगी।क्योंकि अनुकूली परिदृश्य कठोर नहीं है और विकासवादी प्रक्रिया के दौरान आकार बदल सकता है, यह संभव है कि एक प्रजाति को अनुकूली परिदृश्य पर अधिकतम, न्यूनतम या काठी बिंदु तक ले जाया जा सकता है। अनुकूली परिदृश्य पर वैश्विक अधिकतम आबादी एक विकासात्मक रूप से स्थिर रणनीति (ESS) से मेल खाती है और प्रभावशाली बन जाएगी, जिससे अन्य सभी लोग विलुप्त होने की ओर बढ़ जाएंगे। न्यूनतम या काठी बिंदु पर आबादी आक्रमण के प्रति प्रतिरोधी नहीं है ताकि थोड़ा अलग उत्परिवर्ती तनाव की शुरूआत निर्लिप्त स्थानीय मैक्सिमा की ओर विकासवादी प्रक्रिया को जारी रख सके।

अनुकूली परिदृश्य दैहिक विकास का अध्ययन करने के लिए एक उपयोगी उपकरण प्रदान करता है क्योंकि यह इस प्रक्रिया का वर्णन कर सकता है कि कैसे एक उत्परिवर्ती कोशिका एक छोटे ट्यूमर से एक आक्रामक कैंसर में विकसित होती है। इस प्रक्रिया को अनुकूली परिदृश्य के संदर्भ में समझने से परिदृश्य के आकार में बाहरी हेरफेर के माध्यम से कैंसर पर नियंत्रण हो सकता है।

नियोप्लाज्म में विकासवादी अनुकूलन के रूप में कैंसर की पहचान
,अपने ऐतिहासिक पेपर, द हॉलमार्क्स ऑफ कैंसर में हनाहन और वेनबर्ग का सुझाव है कि बीमारी की जटिलताओं के बावजूद, कैंसर को कुछ अंतर्निहित सिद्धांतों द्वारा वर्णित किया जा सकता है। लेखक वर्णन करते हैं कि कैसे ट्यूमर की प्रगति डार्विनियन विकास के अनुरूप प्रक्रिया के माध्यम से आगे बढ़ती है, जहां प्रत्येक आनुवंशिक परिवर्तन कोशिका को विकास लाभ प्रदान करता है। इन आनुवंशिक परिवर्तनों को छह "हॉलमार्क" में समूहीकृत किया जा सकता है, जो सामान्य कोशिकाओं की आबादी को कैंसर बनने के लिए प्रेरित करते हैं। छह लक्षण छह हॉलमार्क में समूहीकृत किया जा सकता है, जो सामान्य कोशिकाओं की आबादी को कैंसर बनने के लिए प्रेरित करते हैं। छह लक्षण हैं: आनुवंशिक अस्थिरता को एक "सक्षम विशेषता" के रूप में परिभाषित किया गया है जो DNAमरम्मत में दोषों के कारण अन्य उत्परिवर्तन के अधिग्रहण की सुविधा प्रदान करता है।
 * 1) विकास संकेतों में आत्मनिर्भरता
 * 2) एंटीग्रोथ संकेतों के प्रति असंवेदनशीलता
 * 3) एपोप्टोसिस से बचना
 * 4) असीमित प्रतिकृति क्षमता
 * 5) निरंतर एंजियोजेनेसिस, और
 * 6) ऊतक आक्रमण और मेटास्टेसिस।

हॉलमार्क "विकास संकेतों में आत्मनिर्भरता" इस अवलोकन का वर्णन करता है कि ट्यूमर कोशिकाएं अपने स्वयं के कई विकास संकेतों का उत्पादन करती हैं और इस तरह अब सूक्ष्म-पर्यावरण से प्रसार संकेतों पर निर्भर नहीं रहती हैं। सामान्य कोशिकाओं को विकासरोधी संकेतों द्वारा अविभाजित अवस्था में बनाए रखा जाता है, जिससे कैंसर कोशिकाएं आनुवंशिक परिवर्तन उत्पन्न करके बचना सीखती हैं।एक सामान्य कोशिका DNAक्षति, ऑन्कोजीन ओवरएक्प्रेशन और उत्तरजीविता कारक अपर्याप्तता जैसे संकेतों के जवाब में क्रमादेशित कोशिका मृत्यु (एपोप्टोसिस) प्रारम्भ करती है, लेकिन एक कैंसर कोशिका "एपोप्टोसिस से बचना" सीखती है, जिससे असामान्य कोशिकाओं का संचय होता है। अधिकांश स्तनधारी कोशिकाएँ टेलोमेर के क्रमिक रूप से छोटे होने के कारण सीमित संख्या में ही प्रतिकृति बना सकती हैं; वस्तुतः सभी घातक कैंसर कोशिकाएं अपने टेलोमेरेस को बनाए रखने की क्षमता हासिल कर लेती हैं, जिससे "असीम प्रतिकृति क्षमता" मिलती है।चूँकि कोशिकाएँ रक्त आपूर्ति से 100 μm से अधिक की दूरी पर जीवित नहीं रह सकती हैं, कैंसर कोशिकाओं को "निरंतर एंजियोजेनेसिस" की प्रक्रिया के माध्यम से अपने विकास का समर्थन करने के लिए नई रक्त वाहिकाओं का निर्माण शुरू करना होगा। अधिकांश कैंसर के विकास के दौरान, प्राथमिक ट्यूमर कोशिकाएं "आक्रमण और मेटास्टेसिस" से गुजरने की क्षमता हासिल कर लेती हैं, जिससे वे आसपास के ऊतकों में स्थानांतरित हो जाती हैं और शरीर में दूर के स्थानों पर जाकर द्वितीयक ट्यूमर बनाती हैं।

कोशिकाएं घातक कैंसर बनने की ओर जो मार्ग अपनाती हैं, वे मार्ग परिवर्तनशील होते हैं, और जिस क्रम में लक्षण प्राप्त होते हैं वह ट्यूमर से ट्यूमर में भिन्न हो सकता है। ट्यूमरजेनिसिस में प्रारंभिक आनुवंशिक घटनाओं को चिकित्सकीय रूप से मापना मुश्किल है, लेकिन ज्ञात जीव विज्ञान के अनुसार इसका अनुकरण किया जा सकता है। मैक्रोस्कोपिक ट्यूमर का वर्णन अब उनके अंतर्निहित आनुवंशिक परिवर्तनों के संदर्भ में किया जाने लगा है, जो द हॉलमार्क्स ऑफ कैंसर में वर्णित रूपरेखा को परिष्कृत करने के लिए अतिरिक्त आंकड़े  प्रदान करता है।

कैंसर की उत्पत्ति का एकक्लोनी सिद्धांत
कैंसर की एकक्लोनी उत्पत्ति के बारे में सिद्धांत बताता है कि प्रायः, नियोप्लाज्म उत्पत्ति की एक ही कोशिका से उत्पन्न होते हैं। यद्यपि  यह संभव है कि कुछ कार्सिनोजेन एक साथ एक से अधिक कोशिकाओं को उत्परिवर्तित कर सकते हैं, ट्यूमर द्रव्यमान प्रायः एक कोशिका या बहुत कम कोशिकाओं की संतान का प्रतिनिधित्व करता है। किसी कोशिका को सामान्य से पूर्व-घातक और फिर कैंसर कोशिका में बदलने के लिए कार्सिनोजेनेसिस की प्रक्रिया में उत्परिवर्तन की एक श्रृंखला की आवश्यकता होती है। उत्परिवर्तित जीन प्रायः देखभाल करने वाले, द्वारपाल, भूस्वामी या कई अन्य जीनों के वर्गों से संबंधित होते हैं। उत्परिवर्तन अंततः कैंसर के दस लक्षणों के अधिग्रहण की ओर ले जाता है।

कैंसर स्टेम कोशिकाएं
पहली घातक कोशिका, जो ट्यूमर को जन्म देती है, उसे प्रायः कैंसर स्टेम कोशिका का नाम दिया जाता है।

कैंसर स्टेम-कोशिका परिकल्पना इस तथ्य पर निर्भर करती है कि बहुत सारे ट्यूमर विषमांगी होते हैं - ट्यूमर में कोशिकाएं फेनोटाइप और कार्यों के अनुसार भिन्न होती हैं।   वर्तमान शोध से पता चलता है कि कई कैंसर में कोशिकाओं के बीच स्पष्ट पदानुक्रम होता है।   सामान्य तौर पर, ट्यूमर में कोशिकाओं की एक छोटी आबादी होती है - लगभग 0.2%-1%[88] - जो स्टेम सेल जैसे गुणों को प्रदर्शित करती है। - इन कोशिकाओं में ट्यूमर ऊतक में विभिन्न प्रकार की कोशिकाओं को जन्म देने, अनिश्चित काल तक स्व-नवीनीकरण करने और स्थानांतरित होने पर नए ट्यूमर बनाने की क्षमता होती है। परिकल्पना के अनुसार, कैंसर स्टेम कोशिकाएँ ही एकमात्र कोशिकाएँ हैं जो ट्यूमरजनन में सक्षम हैं -ये एक नए ट्यूमर की शुरुआत कर सकती हैं। कैंसर स्टेम कोशिका परिकल्पना मेटास्टेसिस और रिमिशन जैसी घटनाओं की व्याख्या कर सकती है।

कैंसर का एकक्लोनी मॉडल और कैंसर स्टेम-कोशिका मॉडल परस्पर अनन्य नहीं हैं। कैंसर स्टेम कोशिका नियोप्लाज्म में उच्चतम उपयुक्तता वाले सेल के चयन के परिणामस्वरूप क्लोनल विकास द्वारा उत्पन्न होता है। इस तरह, नियोप्लाज्म की विषम प्रकृति को दो प्रक्रियाओं द्वारा समझाया जा सकता है - क्लोनल विकास, या कोशिकाओं का पदानुक्रमित भेदभाव, जो कैंसर स्टेम कोशिकाओं द्वारा नियंत्रित होता है। सभी कैंसर दैहिक विकास के परिणामस्वरूप उत्पन्न होते हैं, लेकिन उनमें से केवल कुछ ही कैंसर स्टेम सेल में फिट होते हैं। जब ट्यूमर में कैंसर स्टेम कोशिकाओं की आबादी उत्पन्न हो जाती है तो विकासवादी प्रक्रियाएं बंद नहीं होती हैं। कैंसर उपचार दवाएं कैंसर स्टेम कोशिकाओं सहित ट्यूमर में सभी प्रकार की कोशिकाओं पर एक मजबूत चयनात्मक शक्ति उत्पन्न करती हैं, जो उपचार के लिए प्रतिरोध विकसित करने के लिए मजबूर होंगी। कीमोथेरेपी से बचने और उसके बाद फिर से उभरने के लिए कैंसर स्टेम कोशिकाओं को हमेशा ट्यूमर की कोशिकाओं के बीच उच्चतम प्रतिरोध की आवश्यकता नहीं होती है। जीवित कोशिकाएं एक विशेष सूक्ष्म वातावरण में हो सकती हैं, जो उनकी रक्षा करती है।

वर्तमान में यह स्पष्ट नहीं है कि क्या कैंसर स्टेम कोशिकाएँ वयस्क स्टेम कोशिका परिवर्तन, पूर्वज कोशिकाओं की परिपक्वता की गिरफ्तारी या परिपक्व कोशिकाओं के विभेदन के परिणामस्वरूप उत्पन्न होती हैं।

चिकित्सीय प्रतिरोध में दैहिक विकास
कैंसर चिकित्सा की शुरुआत से ही उपचार के लगभग हर रूप में चिकित्सीय प्रतिरोध देखा गया है। प्रायः सभी मामलों में, उपचार दवा द्वारा लक्षित जीन या मार्गों में उत्परिवर्तन का चयन करते प्रतीत होते हैं।

मेथोट्रेक्सेट का प्रतिरोध
अधिग्रहीत चिकित्सीय प्रतिरोध के आनुवंशिक आधार के कुछ पहले साक्ष्य मेथोट्रेक्सेट के अध्ययन से प्राप्त हुए। मेथोट्रेक्सेट डायहाइड्रोफोलेट रिडक्टेस (DHFR) जीन को रोकता है। यद्यपि, मेथोट्रेक्सेट थेरेपी DHFR की अतिरिक्त प्रतियों (प्रवर्धन) वाली कोशिकाओं का चयन करती प्रतीत होती है, जो मेथोट्रेक्सेट के प्रति प्रतिरोधी हैं। यह सेल कल्चर और मेथोट्रेक्सेट से इलाज किए गए रोगियों के ट्यूमर के नमूनों दोनों में देखा गया था।

5-फ्लूरोरासिल का प्रतिरोध
विभिन्न प्रकार के कैंसर में उपयोग की जाने वाली एक सामान्य साइटोटॉक्सिक कीमोथेरेपी, 5-फ्लूरोरासिल (5-FU), TYMS मार्ग को लक्षित करती है और प्रतिरोध TYMS की अतिरिक्त प्रतियों के विकास के माध्यम से विकसित हो सकता है, जिससे दवा का प्रभाव कम हो जाता है।

BCR-ABL लक्षित दवाओं का प्रतिरोध
ग्लीवेक (इमैटिनिब) के मामले में, जो क्रोनिक माइलॉयड ल्यूकेमिया में BCR-ABL फ्यूजन जीन को लक्षित करता है, प्रतिरोध प्रायः एक उत्परिवर्तन के माध्यम से विकसित होता है जो दवा के बंधन स्थल के आकार को बदल देता है। दवाओं के अनुक्रमिक अनुप्रयोग से प्रत्येक दवा में प्रतिरोध उत्परिवर्तन का क्रमिक विकास हो सकता है। ग्लीवेक उतना चयनात्मक नहीं है जितना मूल रूप से सोचा गया था। यह पता चला है कि यह अन्य टायरोसिन कीनेस जीन को लक्षित करता है और इसका उपयोग गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल स्ट्रोमल ट्यूमर (GIST) को नियंत्रित करने के लिए किया जा सकता है जो c-KIT में उत्परिवर्तन द्वारा संचालित होते हैं। यद्यपि GIST वाले मरीज़ कभी-कभी c-KIT में अतिरिक्त उत्परिवर्तन के साथ दोबारा हो जाते हैं जो कैंसर कोशिकाओं को ग्लीवेक के प्रति प्रतिरोधी बना देते हैं।

EGFR लक्षित दवाओं का प्रतिरोध
गेफिटिनिब (इरेसा) और एर्लोटिनिब (टारसेवा) एपिडर्मल ग्रोथ फैक्टर ग्राही (EGFR) टायरोसिन कीनेज अवरोधक हैं जिनका उपयोग गैर-छोटे सेल फेफड़ों के कैंसर रोगियों के लिए किया जाता है जिनके ट्यूमर में EGFR में दैहिक उत्परिवर्तन होता है। यद्यपि,अधिकांश रोगियों के ट्यूमर अंततः इन दवाओं के प्रति प्रतिरोधी हो जाते हैं। जिन रोगियों में गेफिटिनिब या एर्लोटिनिब के प्रति नैदानिक ​​प्रतिरोध विकसित हो गया है, उनमें अर्जित प्रतिरोध के दो प्रमुख तंत्र खोजे गए हैं: और MET का प्रवर्धन, एक अन्य ग्राही टायरोसिन किने इन मुद्दों को संबोधित करने के लिए, नैदानिक ​​​​परीक्षण वर्तमान में अपरिवर्तनीय EGFR अवरोधकों (जो EGFR में उत्परिवर्तन के साथ सेल लाइनों में भी विकास को रोकते हैं), EGFRऔर MET काइनेज अवरोधकों का संयोजन, और Hsp90 अवरोधकों (EGFR और MET दोनों की आवश्यकता होती है) का आकलन कर रहे हैं।ज, जो सेल में  अधः प्रवाह संकेतन  को सक्रिय करने के लिए EGFRको उपमार्ग कर सकता है। प्रारंभिक अध्ययन में, गेफिटिनिब या एर्लोटिनिब के प्रति अर्जित प्रतिरोध वाले 22% ट्यूमर में MET प्रवर्धन था, EGFRऔर MET काइनेज अवरोधकों और Hsp90 अवरोधकों का संयोजन (EGFRऔर MET दोनों को ठीक से मोड़ने के लिए Hsp90 प्रोटीन की आवश्यकता होती है)। इसके अतिरिक्त, इन दवाओं के प्रति प्रतिरोधक क्षमता विकसित होने पर मरीजों की बार-बार ट्यूमर बायोप्सी लेने से ट्यूमर की गतिशीलता को समझने में मदद मिलेगी।

चयनात्मक एस्ट्रोजन ग्राही न्यूनाधिक दवाओं का प्रतिरोध
चयनात्मक एस्ट्रोजन ग्राही अधिमिश्रक (SERM) एस्ट्रोजन-ग्राही धनायन (ERα+) स्तन कैंसर में प्रायः प्रयोग की जाने वाली सहायक चिकित्सा है और बीमारी के उच्च जोखिम वाली महिलाओं के लिए एक निवारक उपचार है।SERM प्रतिरोध के कई संभावित तंत्र हैं, यद्यपि प्रत्येक के सापेक्ष नैदानिक ​​महत्व पर बहस चल रही है। इनमें सम्मिलित हैं:
 * एस्ट्रोजेन रिसेप्टर अल्फा (ERα) की हानि
 * हालांकि यह महिलाओं के अल्पमत में प्रतिरोध का एक तंत्र हो सकता है, अधिकांश ERα+ ट्यूमर जो SERMS के लिए प्रतिरोधी बन जाते हैं, ERα+ बने रहते हैं
 * ERα की तुलना में ERβ की बढ़ी हुई सापेक्ष अभिव्यक्ति
 * ईजीएफआर/एचईआर2 जैसे विकास कारक सिग्नलिंग मार्गों के साथ हस्तक्षेप/क्रॉस-टॉक
 * एस्ट्रोजन ग्राही में उत्परिवर्तन
 * सह-नियामक प्रोटीन में परिवर्तन
 * SERM, ER, और सह-नियामक प्रोटीन के बीच पारस्परिक क्रिया प्रभावित कर सकती है कि क्या SERM एस्ट्रोजेन प्रतिपक्षी के रूप में कार्य करता है या एस्ट्रोजेन एगोनिस्ट के रूप में।
 * टेमोक्सीफेन की चयापचय सक्रियता में कमी
 * CYP2D6 में बहुरूपता टेमोक्सीफेन के सक्रिय, एंटी-एस्ट्रोजेनिक रूप में रूपांतरण की परिवर्तनशील दरों को दर्शाता है।

विरोधी रोगोपचार का प्रतिरोध
अधिकांश प्रोस्टेट कैंसर उन कोशिकाओं से उत्पन्न होते हैं जो एण्ड्रोजन द्वारा बढ़ने के लिए प्रेरित होती हैं। इसलिए अधिकांश प्रोस्टेट कैंसर उपचार एण्ड्रोजन को हटाने या अवरुद्ध करने पर आधारित होते हैं। एंटी-एण्ड्रोजन प्रतिरोधी प्रोस्टेट कैंसर में एण्ड्रोजन ग्राही (AR) में उत्परिवर्तन देखा गया है जो एण्ड्रोजन के उपचार के बाद बचे एण्ड्रोजन के निम्न स्तर के प्रति AR को अतिसंवेदनशील बनाता है। इसी तरह, एंटी-एण्ड्रोजन प्रतिरोधी प्रोस्टेट कैंसर में AR जीन (प्रवर्धन) की अतिरिक्त प्रतियां देखी गई हैं। ऐसा माना जाता है कि जीन की ये अतिरिक्त प्रतियां कोशिका को एण्ड्रोजन के निम्न स्तर के प्रति अतिसंवेदनशील बनाती हैं और इसलिए उन्हें एंटी-एण्ड्रोजन रोगोपचार के तहत बढ़ने की अनुमति देती हैं।

रेडियोथेरेपी का प्रतिरोध
रेडियोथेरेपी के प्रति प्रतिरोध भी प्रायः देखा जाता है। यद्यपि,आज तक, विकिरण के संपर्क से चयनित आनुवंशिक और अनुजात परिवर्तनों की पहचान करने के लिए रेडियोथेरेपी से पहले और बाद में घातक ऊतकों की तुलना नहीं की गई है। ग्लियोमास में, मस्तिष्क कैंसर का एक रूप, विकिरण चिकित्सा स्टेम कोशिकाओं के लिए चयन करती प्रतीत होती है, यद्यपि यह स्पष्ट नहीं है कि क्या ट्यूमर चिकित्सा के बाद कैंसर स्टेम कोशिकाओं के पूर्व-चिकित्सा अनुपात में लौट आता है या यदि रेडियोथेरेपी एक के लिए चयन करती है जो स्टेम सेल अवस्था में ग्लियोमा कोशिकाओं को रखता है।

चिकित्सा विज्ञान में विकास का दोहन
आजकल प्रायः उपयोग की जाने वाली कैंसर की दवाएं और उपचार विकासवादी निष्क्रिय हैं और एक मजबूत चयन शक्ति का प्रतिनिधित्व करते हैं, जो इसे दवा प्रतिरोध की ओर ले जाता है। इससे बचने का एक संभावित तरीका एक ऐसे उपचार कारक का उपयोग करना है जो कैंसर कोशिकाओं के साथ-साथ विकसित होगा।

आनॉक्सीय जीवाणु
आनॉक्सीय जीवाणु को ट्यूमर के भीतर कमी वाले वातावरण में प्रतिस्पर्धी या शिकारी के रूप में प्रयोग किया जा सकता है। वैज्ञानिक 150 से अधिक वर्षों से आनॉक्सीय जीवाणु के उपयोग के विचार में रुचि रखते हैं, लेकिन अभी तक इस क्षेत्र में बहुत कम प्रगति हुई है। जैन और फोर्ब्स के अनुसार, कुशल कैंसर रोधी जीवाणु के रूप में अर्हता प्राप्त करने के लिए कोशिकाओं को कई आवश्यकताओं को पूरा करना पड़ता है
 * जीवाणु मेज़बान के लिए विषैला नहीं हो सकता।
 * इसकी जनसंख्या को ट्यूमर द्रव्यमान तक ही सीमित रखा जाना चाहिए।
 * इसे पूरे नियोप्लाज्म में समान रूप से फैलने में सक्षम होना चाहिए।
 * उपचार के अंत में जीवाणु को मेजबान से आसानी से समाप्त किया जाना चाहिए।
 * इससे गंभीर प्रतिरक्षा अभिक्रिया उत्पन्न नहीं होनी चाहिए।
 * यह पोषक तत्वों के लिए प्रतिस्पर्धा के माध्यम से ट्यूमर कोशिकाओं की मृत्यु का कारण बनने में सक्षम होना चाहिए।

उपचार की प्रक्रिया में, कैंसर कोशिकाओं में जीवाणु उपचार के प्रति किसी प्रकार का प्रतिरोध विकसित होने की संभावना सबसे अधिक होती है।यद्यपि एक जीवित जीव होने के नाते, जीवाणु ट्यूमर कोशिकाओं के साथ मिलकर विकसित होंगे, जिससे संभावित रूप से प्रतिरोध की संभावना समाप्त हो जाएगी।

संभावित सीमाएँ
चूंकि जीवाणु आनॉक्सीय वातावरण पसंद करते हैं, इसलिए वे ट्यूमर की परिधि पर कोशिकाओं को खत्म करने में कुशल नहीं होते हैं, जहां ऑक्सीजन की आपूर्ति कुशल होती है। रासायनिक दवाओं के साथ जीवाणु उपचार के संयोजन से ट्यूमर के नष्ट होने की संभावना बढ़ जाएगी।

अर्बुदनाशी विषाणु
अर्बुदनाशी विषाणु को कैंसर कोशिकाओं को संक्रमित करने के लिए अभियंत्रित किया जाता है। उस पद्धति की सीमाओं में विषाणु के प्रति प्रतिरक्षा अभिक्रिया और वायरस के रोगज़नक़ में विकसित होने की संभावना सम्मिलित है।

प्राकृतिक चयन
ट्यूमर के वातावरण में हेरफेर करके, कीमोथेरेपी दवाओं के प्रति कम से कम प्रतिरोध वाली कोशिकाओं के लिए अनुकूल परिस्थितियां बनाना संभव है ताकि वे अधिक उपयुक्त हो सकें और बची हुई आबादी से प्रतिस्पर्धा कर सकें। इसके बाद दी जाने वाली कीमोथेरेपी से प्रमुख ट्यूमर कोशिकाओं का सफाया हो जाना चाहिए।

शब्दावली

 * कैंसर जीव विज्ञान और विकासवादी जीव विज्ञान के सामान्य शब्दों के बीच मानचित्रण:
 * चालक उत्परिवर्तन - एक उत्परिवर्तन जो किसी हूबहू दिखने वाले को उसके अस्तित्व या प्रजनन को बढ़ाकर, उसके सूक्ष्म वातावरण में चयनात्मक लाभ प्रदान करता है। चालक उत्परिवर्तन क्लोनल विस्तार का कारण बनते हैं।
 * यात्री उत्परिवर्तन - एक उत्परिवर्तन जिसका क्लोन की उपयुक्तता पर कोई प्रभाव नहीं पड़ता है लेकिन यह क्लोनल विस्तार से जुड़ा हो सकता है क्योंकि यह ड्राइवर उत्परिवर्तन के साथ एक ही जीनोम में होता है। इसे विकासवादी जीव विज्ञान में जेनेटिक हिचहाइकिंग के रूप में जाना जाता है।
 * प्रतिरूपण - कोशिकाओं का एक समूह जो सभी एक सामान्य पूर्वज कोशिका से निकलते हैं। एक प्रतिरूपण को प्रायः पूर्वज कोशिका में हुए एक विशिष्ट आनुवंशिक घाव (उत्परिवर्तन) की विरासत के माध्यम से पहचाना जाता है।
 * नवद्रव्यीय प्रगति - दैहिक विकासवादी प्रक्रिया जिसके द्वारा सामान्य ऊतक घातक (कैंसरयुक्त) ऊतक में बदल जाता है।

यह भी देखें

 * ट्यूमर विषमता
 * कैंसर
 * कैंसर अनुसन्धान
 * कैंसरजनन
 * प्राकृतिक चयन

बाहरी संबंध

 * Santa Fe Institute working group on evolution in cancer
 * Darryl Shibata's lab, focusing on research in evolution in cancer and somatic evolution
 * Carlo Maley's lab, focusing on research in evolution in cancer
 * John Pepper's research in somatic evolution
 * The Seattle Barrett's Esophagus Research Program