जैव सूचना विज्ञान वर्कफ़्लो प्रबंधन प्रणाली

जैव सूचना विज्ञान workflows प्रबंधन प्रणाली वर्कफ़्लो प्रबंधन प्रणाली का एक विशेष रूप है जिसे विशेष रूप से कम्प्यूटेशनल या डेटा हेरफेर चरणों या वर्कफ़्लो की एक श्रृंखला बनाने और निष्पादित करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो जैव सूचना विज्ञान से संबंधित है।

वर्तमान में कई अलग-अलग वर्कफ़्लो प्रणालियाँ हैं। कुछ को खगोल विज्ञान और पृथ्वी विज्ञान जैसे कई अलग-अलग विषयों के वैज्ञानिकों द्वारा उपयोग के लिए वैज्ञानिक कार्यप्रवाह प्रणाली के रूप में अधिक विकसित किया गया है। ऐसी सभी प्रणालियाँ एक अमूर्त प्रतिनिधित्व पर आधारित हैं कि एक निर्देशित ग्राफ के रूप में गणना कैसे आगे बढ़ती है, जहां प्रत्येक नोड निष्पादित होने वाले कार्य का प्रतिनिधित्व करता है और किनारे विभिन्न कार्यों के बीच डेटा प्रवाह या निष्पादन निर्भरता का प्रतिनिधित्व करते हैं। प्रत्येक सिस्टम आम तौर पर एक विज़ुअल फ्रंट-एंड प्रदान करता है, जो उपयोगकर्ता को कम या बिना किसी प्रोग्रामिंग विशेषज्ञता के जटिल एप्लिकेशन बनाने और संशोधित करने की अनुमति देता है।

उदाहरण
वर्णानुक्रम में, जैव सूचना विज्ञान वर्कफ़्लो प्रबंधन प्रणालियों के कुछ उदाहरणों में शामिल हैं:
 * एंडुरिल (वर्कफ़्लो इंजन) जैव सूचना विज्ञान और छवि विश्लेषण
 * बायोबाइक: एक वेब अनुप्रयोग|वेब-आधारित, प्रोग्रामयोग्य, एकीकृत जैविक ज्ञान का आधार
 * सीएलसी बायो, क्यूजेन का एक जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण और वर्कफ़्लो प्रबंधन मंच।
 * साइंस-एड से क्लोन प्रबंधक ।
 * क्यूनिफॉर्म (प्रोग्रामिंग भाषा): बड़े पैमाने पर डेटा विश्लेषण के लिए एक कार्यात्मक वर्कफ़्लो भाषा
 * डिस्कवरी नेट: वैज्ञानिक वर्कफ़्लो प्रणाली के शुरुआती उदाहरणों में से एक, जिसे बाद में इन्फोरसेंस के रूप में व्यावसायीकरण किया गया जिसे बाद में आईडीबीएस द्वारा अधिग्रहित कर लिया गया।
 * गैलेक्सी (कम्प्यूटेशनल जीवविज्ञान): प्रारंभ में जीनोमिक्स पर लक्षित
 * जीनपैटर्न: एक शक्तिशाली वैज्ञानिक वर्कफ़्लो प्रणाली जो सैकड़ों जीनोमिक विश्लेषण उपकरणों तक पहुंच प्रदान करती है।
 * कोंस्टैंज़ सूचना माइनर को KNIME करें
 * टवेर्ना कार्यक्षेत्र पर आधारित ऑनलाइन एचपीसी ऑनलाइन वर्कफ़्लो डिज़ाइनर
 * UGENE एक वर्कफ़्लो प्रबंधन प्रणाली प्रदान करता है जो स्थानीय कंप्यूटर पर स्थापित होती है
 * विज़ट्रेल्स

कार्यप्रवाह प्रणालियों के बीच तुलना
चुनने के लिए बड़ी संख्या में जैव सूचना विज्ञान वर्कफ़्लो सिस्टम के साथ, विभिन्न वर्कफ़्लो प्रणालियों की विशेषताओं को समझना और तुलना करना कठिन हो जाता है। जैव सूचना विज्ञानी के दृष्टिकोण से प्रणालियों के मूल्यांकन और तुलना में बहुत कम काम किया गया है, खासकर जब उन डेटा प्रकारों की तुलना करने की बात आती है जिनसे वे निपट सकते हैं, अंतर्निहित कार्यक्षमताएं जो उपयोगकर्ता को प्रदान की जाती हैं या यहां तक ​​​​कि उनके प्रदर्शन या प्रयोज्यता भी। मौजूदा तुलनाओं के उदाहरणों में शामिल हैं:


 * पेपर वैज्ञानिक वर्कफ़्लो सिस्टम-क्या एक आकार सभी में फिट हो सकता है?, जो उनके नियंत्रण प्रवाह और डेटा प्रवाह गुणों के आधार पर वर्कफ़्लो सिस्टम की तुलना करने के लिए एक उच्च-स्तरीय रूपरेखा प्रदान करता है। तुलना की गई प्रणालियों में डिस्कवरी नेट, टवेर्ना वर्कबेंच, ट्रायना, केप्लर वैज्ञानिक कार्यप्रवाह प्रणाली के साथ-साथ यॉल और व्यवसाय प्रक्रिया निष्पादन भाषा शामिल हैं।
 * पेपर मेटा-वर्कफ़्लोज़: गैलेक्सी और टवेर्ना के बीच पैटर्न-आधारित इंटरऑपरेबिलिटी जो दोनों प्रणालियों के बीच अंतरसंचालनीयता को सक्षम करने के संदर्भ में टवेर्ना वर्कबेंच और गैलेक्सी (कम्प्यूटेशनल बायोलॉजी) के बीच अधिक उपयोगकर्ता-उन्मुख तुलना प्रदान करता है।


 * बायोमेडिकल रिसर्च के लिए आईसीटी इंफ्रास्ट्रक्चर प्रदान करने वाला इंफ्रास्ट्रक्चर पेपर दो वर्कफ़्लो सिस्टम, एंडुरिल (वर्कफ़्लो इंजन) और चिपस्टर की तुलना करता है, क्लाउड-डिलीवरी मॉडल में बुनियादी ढांचे की आवश्यकताओं के संदर्भ में।


 * पेपर जैव सूचनात्मक पाइपलाइन ढांचे की समीक्षा वर्कफ़्लो प्रबंधन प्रणालियों को तीन आयामों के आधार पर वर्गीकृत करने का प्रयास: एक अंतर्निहित या स्पष्ट वाक्यविन्यास का उपयोग करना, एक कॉन्फ़िगरेशन, कन्वेंशन या क्लास-आधारित डिज़ाइन प्रतिमान का उपयोग करना और एक कमांड लाइन या वर्कबेंच इंटरफ़ेस की पेशकश करना।