क्लैडिस्टिक्स

क्लैडिस्टिक्स या वंशशाखिकी जैविक वर्गीकरण के लिए एक दृष्टिकोण है जिसमें जीवों को समूहों ("क्लैड्स") में वर्गीकृत किया जाता है जो सबसे वर्तमान सामान्य वंश की परिकल्पना पर आधारित होते हैं। परिकल्पित संबंधों के प्रमाण सामान्यतः साझा की गई व्युत्पन्न विशेषताएँ (सिनपोमॉर्फी) हैं जो अधिक दूर के समूहों और पूर्वजों में उपस्थित नहीं हैं। हालांकि एक अनुभव दृष्टिकोण से सामान्य पूर्वज के संबंधों की एक क्लैडिस्टिक परिकल्पना पर आधारित अनुमान हैं, जिनकी चरित्र अवस्था को देखा जा सकता है। सैद्धांतिक रूप से एक अंतिम सामान्य पूर्वज और उसके सभी वंशज एक (न्यूनतम) क्लैड का गठन करते हैं। महत्वपूर्ण विषय यह है कि सभी वंशज अपने व्यापक पैतृक वंश में रहते हैं। उदाहरण के लिए यदि शब्द कृमि या मत्श्य जटिल क्लैडिस्टिक संरचना के भीतर उपयोग किए गए थे, तो इन शब्दों में मनुष्य सम्मिलित होंगे। इनमें से कई शब्द सामान्यतः क्लैडिस्टिक्स के बाहर पैराफाईलेटिक रूप से उपयोग किए जाते हैं। उदाहरण के लिए एक 'ग्रेड' के रूप में जो स्पष्ट रूप से चित्रित करने के लिए व्यर्थ हैं। विशेष रूप से जब विलुप्त प्रजातियों को सम्मिलित किया जाता है। तब द्विभाजन द्वारा नए उपवर्गों की उत्पत्ति में विकिरण का परिणाम सम्मिलित होता है लेकिन व्यवहार में यौन संकरण बहुत निकटता से संबंधित समूहों को अस्पष्ट कर सकता है।

एक परिकल्पना के रूप में क्लैड को केवल तभी अस्वीकृत किया जा सकता है जब कुछ समूहों को स्पष्ट रूप से बाहर रखा गया हो। तब यह प्राप्त किया जा सकता है कि बहिष्कृत समूह वास्तव में समूह के अंतिम सामान्य वंश से निष्कासित है और इस प्रकार समूह के भीतर भ्रामक है, क्योंकि क्लैडिस्टिक्स में सभी वंशज पैतृक समूह में रहते हैं। यह पता चलने पर कि समूह इस प्रकार पैराफाईलेटिक है या तो ऐसे बहिष्कृत समूहों को क्लैड को प्रदान किया जाना चाहिए या समूह को समाप्त कर दिया जाना चाहिए। अगले महत्वपूर्ण (जैसे उपस्थित) समूह के विचलन के लिए नीचे की शाखाओं को क्लैड को तना-समूहीकरण माना जाता है, लेकिन सिद्धांत रूप में प्रत्येक स्तर अपनी क्षमता के कारण उत्पन्न होता है, जिसे एक अद्वितीय नाम दिया जाता है। एक पूरी तरह से द्विभाजित वृक्ष के लिए एक समूह को वृक्ष में जोड़ने से उस शाखा पर एक अतिरिक्त (नामित) क्लैड और एक नया स्तर भी जुड़ जाता है। विशेष रूप से विलुप्त समूहों को भी सदैव एक पार्श्व शाखा पर रखा जाता है। सामान्यतः यह भेद नहीं किया जाता है कि क्या अन्य समूहों का वास्तविक पूर्वज पाया गया था। क्लैडिस्टिक्स की तकनीकों और नामकरण को जीव विज्ञान के अतिरिक्त अन्य विषयों पर प्रयुक्त किया गया है। (वंशावली नामकरण देखें।)

क्लैडिस्टिक्स निष्कर्ष वर्गीकरण पद्धति (जीव विज्ञान) के लिए जटिलता उत्पन्न कर रही हैं, जहां स्थिति और जीनस स्थापित समूहों का नामकरण असंगत हो सकता है। क्लैडिस्टिक्स पद्धति अब जीवों को वर्गीकृत करने के लिए सबसे अधिक उपयोग की जाने वाली विधि है।

इतिहास
जर्मन कीटविज्ञानी विली हेनिग के कार्य से प्राप्त क्लैडिस्टिक विश्लेषण और माध्यमिक वर्गीकरण में उपयोग की जाने वाली मूल विधियाँ है जिन्होंने इसे जातिवृत्तीय क्रमबद्धता (उनकी 1966 की पुस्तक का शीर्षक भी) के रूप में संदर्भित किया था "क्लैडिस्टिक्स" और "क्लैड" शब्दों को अन्य शोधकर्ताओं द्वारा लोकप्रिय बनाया गया था। मूल अर्थ में क्लैडिस्टिक्स जातिवृत्तीय विश्लेषण में उपयोग की जाने वाली विधियों के एक विशेष समूह को संदर्भित करता है। हालांकि अब इसे कभी-कभी पूरे क्षेत्र को संदर्भित करने के लिए उपयोग किया जाता है।

जिसे अब क्लैडिस्टिक पद्धति भी कहा जाता है। यह 1901 के प्रारम्भ में पक्षियों के लिए पीटर चाल्मर्स मिशेल के कार्य के साथ और 1921 के बाद में रॉबर्ट जॉन टिलयार्ड (कीड़ों के लिए), और डब्ल्यू ज़िम्मरमैन 1943 (पौधों के लिए) के कार्य के साथ दिखाई दी थी। 1940 में जूलियन हक्सले द्वारा निर्मित किए जाने के बाद 1958 में जूलियन हक्सले द्वारा "क्लेड" शब्द प्रस्तुत किया गया था। 1958 में "क्लैडोजेनेसिस" ,1960 में आर्थर कैन और हैरिसन द्वारा "क्लैडिस्टिक" "क्लैडिस्ट" 1965 में अर्न्स्ट मेयर द्वारा "हेनिग विध्यालय के एक अनुयायी के लिए और 1966 में "क्लैडिस्टिक्स" हेनिग ने अपने स्वयं के दृष्टिकोण को "जातिवृत्तीय क्रमबद्धता" के रूप में संदर्भित किया था। 1970 के दशक के अंत तक अपने मूल सूत्रीकरण के समय से क्लैडिस्टिक्स ने फेनेटिक्स और तथाकथित विकासवादी वर्गीकरण के साथ क्रमबद्धता के लिए एक विश्लेषणात्मक और दार्शनिक दृष्टिकोण के रूप में प्रतिस्पर्धा को प्रस्तुत किया। फेनेटिक्स को इस समय संख्यात्मक वर्गीकरण पीटर स्नेथ, रॉबर्ट मॉर्निंग और अर्नेस्ट मेयर द्वारा विकासवादी वर्गीकरण का विजेता बनाया गया था।

1950 में प्रकाशित एक पुस्तक में विली हेनिग द्वारा मूल रूप से कल्पना की गई, यदि केवल संक्षेप में क्लैडिस्टिक्स 1966 में अंग्रेजी में इसके अनुवाद (लेविन 1997) तक विकसित नहीं हुई थी। वर्तमान के रूपात्मक आँकड़ा से जातिवृत्तीय वृक्षों का अनुमान लगाने के लिए क्लैडिस्टिक्स सबसे लोकप्रिय तरीका है।

1990 के दशक में प्रभावी पॉलिमिरेज श्रृंखला अभिक्रिया तकनीकों के विकास ने जीवों के जैव रासायनिक और आणविक आनुवंशिक लक्षणों के लिए क्लैडिस्टिक विधियों के अनुप्रयोग की स्वीकृति दी, जिससे जातिवृत्तीयता के लिए उपलब्ध आँकड़ा की मात्रा का विस्तार हुआ। उसी समय क्लैडिस्टिक्स तीव्रता से विकासवादी जीव विज्ञान में लोकप्रिय हो गया था क्योंकि कंप्यूटरों ने जीवों और उनकी विशेषताओं के विषय में बड़ी मात्रा में आँकड़ा संसाधित करना संभव बना दिया था।

कार्य प्रणाली
क्लैडिस्टिक विधि प्रत्येक साझा चरित्र अवस्था परिवर्तन का समूहीकरण करने के लिए संभावित साक्ष्य के रूप में व्याख्या करती है। सिनपोमॉर्फी (साझा, व्युत्पन्न चरित्र अवस्थाएँ) को समूहीकरण के प्रमाण के रूप में देखा जाता है, जबकि सिनपोमॉर्फी (साझा पैतृक चरित्र अवस्थाएँ) नहीं हैं। क्लैडिस्टिक विश्लेषण का परिणाम क्लैडोग्राम वृक्ष के आकार का आरेख (डेंड्रोग्राम) है। जिसकी व्याख्या जातिवृत्तीय संबंधों की सर्वश्रेष्ठ परिकल्पना का प्रतिनिधित्व करने के लिए की जाती है। हालांकि पारंपरिक रूप से इस प्रकार के क्लैडोग्राम बड़े पैमाने पर रूपात्मक वर्णों के आधार पर उत्पन्न होते थे और मूल रूप से इनकी हाथ से गणना की जाती थी। आनुवंशिक अनुक्रमण आँकड़ा और कम्प्यूटेशनल जातिवृत्तीयता को अब सामान्यतः जातिवृत्तीय विश्लेषण में उपयोग किया जाता हैं और अधिक "परिष्कृत" के पक्ष में कई जातिवृत्तीयता द्वारा पारसीमोनी मानदंड को छोड़ दिया गया है। लेकिन चरित्र अवस्था परिवर्तन के अपेक्षाकृत कम विकासवादी मॉडल क्लैडिस्ट का तर्क है कि ये मॉडल अनुप्रयुक्त हैं क्योंकि इस विषय का कोई प्रमाण नहीं है कि वे वास्तविक अनुभवजन्य आँकड़ा समूह से अधिक "सत्य" या "सही" परिणाम प्राप्त करते हैं

प्रत्येक क्लैडोग्राम एक विशेष आँकड़ा समूह पर आधारित होता है जिसका एक विशेष विधि से विश्लेषण किया जाता है। आँकड़ा समूह आणविक, रूपात्मक, नैतिक या अन्य पात्रों और परिचालन वर्गीकरण इकाइयों (ओटीयू) की एक सूची से युक्त तालिकाएँ हैं, जो जीन, व्यक्ति, जनसंख्या, प्रजातियों के रूप मे अधिक वर्गीकृत हो सकते हैं जिन्हें संघीय माना जाता है। इसलिए, सभी को एक साथ बनाने के लिए एक बड़ा क्लैड फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण उस क्लैड के भीतर ब्रांचिंग पैटर्न का अनुमान लगाता है। अलग-अलग आँकड़ा समूह और अलग-अलग तरीकों से उल्लेखित मान्यताओं के उल्लंघन का उल्लेख नहीं किया जाता है, जिसके परिणामस्वरूप प्रायः अलग-अलग क्लैडोग्राम होते हैं। केवल वैज्ञानिक जांच ही बता सकती है कि कौन से क्लैडोग्राम के सही होने की अधिक संभावना है।

उदाहरण के लिए, कछुओं, छिपकलियों, मगरमच्छों और पक्षियों के बीच पैतृक संबंधों के शुद्ध प्रतिनिधित्व के रूप में निम्नलिखित जैसे क्लैडोग्राम को सामान्यतः स्वीकृत किया गया है: यदि यह जातिवृत्तीय परिकल्पना सही है, तो कछुओं और पक्षियों के अंतिम सामान्य पूर्वज ▼ के पास की शाखा में छिपकलियों और पक्षियों के अंतिम सामान्य पूर्वज, ♦ के पास रहते थे। हालाँकि, अधिकांश आणविक साक्ष्य इस प्रकार से क्लैडोग्राम का उत्पादन करते हैं: {| class="wikitable" {| class="wikitable" {| class="wikitable"
 * डायप्सिडा ♦
 * rowspan="2" |
 * लेपिडोसॉरिया
 * rowspan="2" |छिपकली
 * आर्कोसौरोमोर्फा▼
 * rowspan="2" |
 * आर्कोसौरोमोर्फा▼
 * rowspan="2" |
 * rowspan="2" |
 * टेस्टुडीन
 * rowspan="2" |कछुआ
 * अर्कोसौरिया
 * rowspan="2" |
 * अर्कोसौरिया
 * rowspan="2" |
 * rowspan="2" |

यदि यह सही है, तो कछुओं और पक्षियों के अंतिम सामान्य पूर्वज छिपकलियों और पक्षियों के अंतिम सामान्य पूर्वज की तुलना में बाद में रहते थे। चूंकि क्लैडोग्राम विकासवादी इतिहास का वर्णन करने के लिए दो परस्पर विभिन्न परिकल्पनाओं को दिखाया जाता हैं जिसमे से प्रायः दोनों सही हैं।
 * }
 * }
 * }

दाईं ओर का क्लैडोग्राम वर्तमान सार्वभौमिक रूप से स्वीकृत परिकल्पना का प्रतिनिधित्व करता है कि सभी नर वानर, जिनमें लेमूर और लोरिस जैसे स्ट्रेप्सिरहाइन सम्मिलित हैं, स्ट्रेप्सिरहाइन एक सामान्य पूर्वज थे जिनके सभी वंशज नर वानर हैं और इसलिए ये एक क्लैड बनाते हैं। इसलिए इस क्लेड के लिए प्राइमेट्स नाम को मान्यता दी गई है। प्राइमेट्स के भीतर सभी एंथ्रोपोइड्स (बंदर, वानर और मनुष्य) की परिकल्पना की जाती है कि उनके सभी वंशज एक सामान्य पूर्वज या एंथ्रोपोइड थे, इसलिए वे एंथ्रोपोइडिया (प्राणिसमूह) नामक क्लैड बनाते हैं। दूसरी ओर "प्रोसीमियन" एक पैराफाईलेटिक टैक्सोन बनाते हैं। प्रोसीमी नाम का प्रयोग जातिवृत्तीय नामकरण में नहीं किया जाता है, जो केवल क्लैड का नाम देता है। इसके अतिरिक्त "प्रोसिमियंस" को क्लेड्स स्ट्रेप्सिरहिनी और हाप्लोरहिनी के बीच विभाजित किया जाता है, जहां बाद वाले में टार्सीफोर्मेस और एंथ्रोपोइडिया होते हैं।

लेमर्स और टार्सियर मनुष्यों के विकासवादी वंश के निकट होने के अर्थ में मनुष्यों की निकटता से संबंधित है। हालाँकि टार्सियर के दृष्टिकोण से मनुष्य और लेमूर ठीक उसी अर्थ में निकट दिखते है जैसे क्लैडिस्टिक्स सभी शाखाओं (उपस्थित या विलुप्त) को एक ही तरीके से मानते हुए एक तटस्थ दृष्टिकोण को बल देता है। यह समूहों के बीच शुद्ध ऐतिहासिक संबंधों के विषय में प्रमाण देने की कोशिश करने और ईमानदारी से निष्कर्षों को ध्यान में रखने के लिए भी प्रेरित करता है।

चरित्र अवस्थाओ के लिए शब्दावली
निम्नलिखित शब्द हेनिग द्वारा निर्मित किया गया है। समूहों के बीच साझा या विशिष्ट चरित्र अवस्थाओ की पहचान करने के लिए उपयोग किया जाता है:
 * आसन्नरूप ("निकट रूप") या पैतृक अवस्था एक चरित्र अवस्था है जिसे टैक्सोन ने अपने पूर्वजों से सुरक्षित रखा है। जब दो या दो से अधिक टैक्सा जो एक दूसरे के भीतर स्थिर नहीं होते हैं तब आसन्नरूप साझा करते हैं, यह एक साधारण सियोमॉर्फी (syn-) है। सिम्प्लेसीओमॉर्फियों का अर्थ यह नहीं है कि टैक्सा जो कि चरित्र अवस्था को प्रदर्शित करता है, आवश्यक यह है कि वे सूक्ष्मता से संबंधित हों। उदाहरण के लिए रेप्टीलिया पारंपरिक रूप से (अन्य विषयों के अतिरिक्त) शीत-रक्त वाले होते हैं अर्थात, शरीर के तापमान को निरंतर बनाए नहीं रखते है जबकि पक्षी गर्म-रक्त वाले होते हैं। चूँकि शीत-रक्तता एक आसन्नरूप है, जो पारंपरिक रेप्टीलिया और पक्षियों के सामान्य पूर्वज से पैतृक रूप में प्राप्त हुई है और इस प्रकार कछुओं, सांपों और मगरमच्छों (दूसरों के बीच) की एक सियोमॉर्फी है। इसका अर्थ यह नहीं है कि कछुए, सांप और मगरमच्छ एक क्लैड बनाते हैं जो कि कछुओं या पक्षियों को बाहर करता है।
 * एपोमॉर्फी ("अलग रूप") या व्युत्पन्न अवस्था एक नवीनता है। इस प्रकार इसका उपयोग एक क्लैड का निदान करने के लिए किया जा सकता है या यहां तक ​​कि जातिवृत्तीय नामकरण में एक क्लैड नाम को परिभाषित करने में सहायता करने के लिए भी किया जाता है। विशेषताएँ जो व्यक्तिगत टैक्सा (एकल प्रजाति या समूह जो किसी दिए गए जातिवृत्तीय विश्लेषण में एकल टर्मिनल द्वारा प्रस्तुत की जाती हैं) में प्राप्त होती हैं, उन्हें ऑटोपोमॉर्फी (ऑटो-, "सेल्फ") कहा जाता है। ऑटापोमॉर्फी समूहों के बीच संबंधों के विषय में कुछ भी व्यक्त नहीं हैं क्लैड्स की पहचान (या परिभाषित) सिनापोमोर्फियों (syn-) द्वारा की जाती है। उदाहरण के लिए होमोसेपियन्स के समरूप अंकों का आधिपत्य कशेरुकियों के भीतर एक पर्यायवाची है। टेट्रोपोड्स को पहले कशेरुकी के रूप में सम्मिलित किया जा सकता है, जो होमो सेपियन्स के समरूप अंकों के साथ-साथ इस कशेरुकी के सभी वंशों के साथ एपोमोर्फी-आधारित जातिवृत्तीय परिभाषा के साथ मिलते हैं। महत्वपूर्ण रूप से सांप और अन्य टेट्रापोड जिनमें अंक नहीं होते हैं, फिर भी टेट्रापोड होते हैं: अन्य लक्षण, जैसे कि एमनियोटिक अंडे और डायप्सिड मस्तिष्क को इंगित करते हैं कि वे पूर्वजों से उत्पन्न थे जिनके पास ऐसे अंक थे जो हमारे साथ सजातीय हैं।
 * एक चरित्र अवस्था होमोप्लास्टिक या "होमोप्लासी का एक उदाहरण" है यदि यह दो या दो से अधिक जीवों द्वारा साझा किया जाता है, लेकिन उनके सामान्य पूर्वज से या बाद के पूर्वज से जीवों में से एक के लिए अग्रणी होता है। इसलिए यह अभिसरण या उत्क्रमण द्वारा विकसित होने का अनुमान लगाया गया है। स्तनधारी और पक्षी दोनों एक उच्च स्थिर शरीर के तापमान को बनाए रखने में सक्षम हैं (अर्थात, वे गर्म रक्त वाले हैं)। हालांकि, उनकी महत्वपूर्ण विशेषताओं की व्याख्या करते हुए स्वीकृत क्लैडोग्राम इंगित करता है कि उनके सामान्य पूर्वज इस चरित्र अवस्था की कमी वाले समूह में हैं, इसलिए अवस्था को दो समूहों में स्वतंत्र रूप से विकसित होना चाहिए। गर्म-रक्तता अलग-अलग स्तनधारियों (या बड़ा क्लैड) और पक्षियों का एक सिनापोमॉर्फी है, लेकिन यह इन दोनों क्लैड सहित किसी भी समूह का सिनापोमॉर्फी नहीं है। हेंनिग के सहायक सिद्धांत में कहा गया है कि साझा चरित्र अवस्थाओ को समूहीकरण का प्रमाण माना जाना चाहिए जब तक कि वे अन्य प्रमाणों के भार से खण्डन न करें। इस प्रकार एक समूह के सदस्यों के बीच कुछ विशेषताओं का होमोप्लासी केवल उस समूह के लिए एक फाईलोजेनेटिक परिकल्पना स्थापित होने के बाद ही अनुमान लगाया जा सकता है।

आसन्नरूप और एपोमॉर्फी शब्द सापेक्ष हैं। जिसका अनुप्रयोग वृक्ष के भीतर समूह की स्थिति पर निर्भर करता है। उदाहरण के लिए जब यह तय करने की कोशिश की जा रही है कि क्या टेट्रापोड एक क्लैड बनाते हैं, तो एक महत्वपूर्ण सवाल यह है कि क्या चार अंगों का होना टेट्रापोडा के भीतर सम्मिलित किए जाने वाले प्रारम्भिक टैक्सा का एक सिनापोमॉर्फी है क्या टेट्रापोडा के सभी प्रारम्भिक सदस्य एक सामान्य पूर्वज से चार अंग प्राप्त करते हैं, जबकि अन्य सभी कशेरुकियों ने नहीं प्राप्त किया है या कम से कम सजातीय रूप से नहीं प्राप्त किया है। इसके विपरीत, टेट्रापोड्स के भीतर एक समूह के लिए जैसे पक्षी, जिनके चार अंग होते हैं एक आसन्नरूप है। इन दो शब्दों का उपयोग करने से समरूपता की चर्चा में अधिक शुद्धता आती है, विशेष रूप से विभिन्न सजातीय विशेषताओं के बीच पदानुक्रमित संबंधों की स्पष्ट अभिव्यक्ति की स्वीकृति प्राप्त होती है।

यह तय करना जटिल हो सकता है कि क्या चरित्र अवस्था वास्तव में एक ही है और इस प्रकार एक सिनापोमोर्फी के रूप में वर्गीकृत किया जा सकता है, जो एक संघीय समूह की पहचान कर सकता है या क्या यह केवल वही प्रतीत होता है कि इस प्रकार यह एक होमोप्लासी है जो समूह इस प्रकार की पहचान नहीं कर सकता है। वह कोशिकीय तर्क के लिए जोखिम उत्पन्न करता है। जातिवृत्तीय वृक्ष के आकार के विषय में मान्यताओं का उपयोग चरित्र अवस्थाओ के विषय में निर्णयों को सही सिद्ध करने के लिए किया जाता है जो वृक्ष के आकार के प्रमाण के रूप में उपयोग किए जाते हैं। जातिवृत्तीय ऐसे प्रश्नों को तय करने के लिए पारसीमोनी के विभिन्न रूपों का उपयोग करता है। निष्कर्ष प्रायः आँकड़ा समूह और विधियों पर निर्भर करते हैं। अनुभवजन्य विज्ञान की प्रकृति ऐसी ही है और इस कारण से अधिकांश क्लैडिस्ट अपने क्लैडोग्राम को संबंध की परिकल्पना के रूप में संदर्भित करते हैं। क्लैडोग्राम जो बड़ी संख्या और विभिन्न प्रकार के पात्रों द्वारा समर्थित होते हैं उन्हें अधिक सीमित प्रमाणों के आधार पर अधिक जटिल माना जाता है।

टैक्सा के लिए शब्दावली
पोलिफ़ैग्मा और  मोनो-, पैरा-  टैक्सा को वृक्ष के आकार (जैसा कि ऊपर किया गया है) के साथ-साथ उनके चरित्र अवस्थाओ के आधार पर समझा जा सकता है। इनकी तुलना नीचे दी गई तालिका में की गई है।

समीक्षावाद
क्लैडिस्टिक्स की सामान्यतः या विशिष्ट अनुप्रयोगों में प्रारम्भ से ही समीक्षा की गई है। इस संबंध में निर्णय कि क्या विशेष चरित्र अवस्था सजातीय हैं, उनके पर्यायवाची होने की एक पूर्व शर्त है जो परिपत्र तर्क और व्यक्तिपरक निर्णयों को सम्मिलित करने के रूप में निर्देशित है। लेकिन साक्ष्य की संभावित अविश्वसनीयता किसी भी व्यवस्थित पद्धति के लिए या उस स्थिति में किसी भी अनुभवजन्य वैज्ञानिक प्रयास के लिए एक समस्या है।

1970 के दशक के अंत में रूपांतरित क्लैडिस्टिक्स का प्रारम्भ हुआ और क्लैडिस्टिक विश्लेषण से जातिवृत्त के विषय में एक प्राथमिक धारणा को हटाकर इनमें से कुछ समस्याओं को हल करने के प्रयास में यह अलोकप्रिय बना हुआ है।

पूर्वज
क्लैडिस्टिक विधि किसी क्लेड के वास्तविक पूर्वजों के रूप में जीवाश्म प्रजातियों की पहचान नहीं करती है। इसके अतिरिक्त जीवाश्म टैक्सा को अलग-अलग विलुप्त शाखाओं के संबंध के रूप में पहचाना जाता है। जबकि एक जीवाश्म प्रजाति एक क्लैड का वास्तविक पूर्वज हो सकता है। यह जानने का कोई तरीका नहीं है। इसलिए एक अधिक रूढ़िवादी परिकल्पना यह है कि जीवाश्म टैक्सोन अन्य जीवाश्म और उपस्थित टैक्सा से संबंधित है, जैसा कि साझा एनामॉर्फिक विशेषताओं के पैटर्न द्वारा निहित है।

विलुप्त होने की अवस्था
किसी भी उपस्थित वंश के साथ एक अन्य विलुप्त समूह शाब्दिक रूप से विलुप्त नहीं माना जाता है उदाहरण के लिए विलुप्त होने की कोई तिथि नहीं है।

संकरण, अंतः प्रजनन
जीव विज्ञान और प्रजनन से संबंधित कुछ जटिल अव्यवस्थिताए है जो क्लैडिस्टिक्स मे कोई अपवाद नहीं है। कई प्रजातियां लैंगिक रूप से प्रजनन करती हैं और लाखों वर्षों तक परस्पर प्रजनन करने में सक्षम हैं। ऐसी अवस्था के समय कई शाखाएँ विकीर्ण हो सकती हैं और उन्हें केवल दो मिनट तक सिमटने में करोड़ों साल लग सकते हैं। केवल तभी कोई सैद्धांतिक रूप से उन समूहों के उपयुक्त अंतिम सामान्य पूर्वजों को निर्दिष्ट कर सकता है जो गलती से पिछली शाखाओं को सम्मिलित नहीं करते हैं। वास्तविक क्लैडिस्टिक द्विभाजन की प्रक्रिया इस प्रकार सामान्यतः ज्ञात होने की तुलना में कहीं अधिक विस्तारित समय ले सकती है। व्यावहारिक रूप से हाल के विकिरणों के लिए क्लैडिस्टिक रूप से निर्देशित निष्कर्ष केवल जटिलता का एक सामान्य अनुभव हैं। अधिक विस्तृत विवरण समूहों के बीच अंतर्मुखीकरण के अंशों और यहां तक ​​कि उनकी भौगोलिक विविधताओं के विषय में विवरण देता है। यह पैराफाईलेटिक समूह के उपयोग के लिए एक तर्क के रूप में प्रयुक्त किया गया है। लेकिन सामान्यतः अन्य कारणों को भी विकसित किया जाता है।

क्षैतिज जीन स्थानांतरण
क्षैतिज जीन स्थानांतरण विभिन्न जीवों के बीच आनुवंशिक जानकारी की गतिशीलता है जो पारस्परिक होस्ट के लिए शीघ्र या विलंबित प्रभाव डाल सकता है। प्रकृति में कई प्रक्रियाएँ हैं जो क्षैतिज जीन स्थानांतरण का कारण बन सकती हैं। यह सामान्यतः प्रत्यक्ष जीव के वंश में हस्तक्षेप नहीं करती है लेकिन उस वंश के निर्धारण को जटिल बना सकती है। एक अन्य स्तर पर क्लैडिस्टिक्स का उपयोग करके व्यक्तिगत जीनों के जातिवृत्त का निर्धारण करके क्षैतिज जीन स्थानांतरण प्रक्रियाओं को चित्रित किया जा सकता है।

नामकरण स्थिरता
यदि आपसी संबंध में अस्पष्टता है तो बहुत से संभावित क्लैड हैं। प्रत्येक संभावित क्लैड को नाम देना विवेकपूर्ण नहीं हो सकता है। इसके अतिरिक्त क्लैडिस्टिक्स में स्थापित नामों को निरस्त कर दिया जाता है या वैकल्पिक रूप से ऐसे अर्थ ले लिए जाते हैं जो अब धारण नहीं कर सकते हैं, जैसे कि जब उनमें अतिरिक्त समूह पाए जाते हैं। नामकरण परिवर्तन आपसी संबंधों की मान्यता में परिवर्तन का प्रत्यक्ष परिणाम है जो प्रायः अभी भी प्रवाह में है, विशेष रूप से विलुप्त प्रजातियों के लिए पुराने नामकरण या अर्थों पर स्थिर रहना व्युत्क्रमित उत्पादक है, क्योंकि वे सामान्यतः वास्तविक पारस्परिक संबंधों को पूर्णतः प्रतिबिंबित नहीं करते हैं उदाहरण के लिए आर्किया, असगर्ड आर्किया, प्रजीव, अवपंक फफूंदी, कृमि, अकशेरूकीय, मछलियां, सरीसृप, बंदर, अर्डीपिथेकस, ऑस्ट्रेलोपिथेकस, होमो इरेक्टस सभी में होमो सेपियन्स क्लैडिस्टिक रूप से होते हैं। कोशिकीय लेटो अर्थ में मूल रूप से विलुप्त स्टेम समूहों के लिए सेंसु लेटो का अर्थ सामान्यतः पहले से सम्मिलित समूहों को शुद्धता से रखना है जो तब जीवित प्रजातियों को भी सम्मिलित कर सकते हैं। एक छँटाई हुई सेंसु का अर्थ को प्रायः इसके अतिरिक्त अपनाया जाता है, लेकिन समूह को तने पर एक ही शाखा तक सीमित रखने की आवश्यकता होगी। अन्य शाखाओं को तब अपना नाम और स्तर मिलता है। यह इस तथ्य के अनुरूप है कि अधिक वरिष्ठ तना शाखाएं वास्तव में अधिक बेसल तना शाखाओं की तुलना में परिणामी समूह से संबंधित हैं कि वे तने की शाखाएँ केवल अपेक्षाकृत समय के लिए ही रह सकती हैं और प्रायः ये क्लैडिस्टिक्स में उस आकलन को प्रभावित नहीं करती हैं।

जीव विज्ञान के अतिरिक्त अन्य विषयों में
आँकड़ा प्राप्त करने के लिए उपयोग की जाने वाली तुलना, जिस पर क्लैडोग्राम आधारित हो सकते हैं वे प्रायः जीव विज्ञान के क्षेत्र तक सीमित नहीं हैं। व्यक्तियों या वर्गों का कोई भी समूह जिसकी परिकल्पना एक सामान्य पूर्वज के रूप में की जाती है और जिसके लिए सामान्य विशेषताओं का एक समुदाय प्रयुक्त हो सकता है या नहीं भी हो सकता है, उसके अनुसार तुलना की जा सकती है। क्लैडोग्राम का उपयोग कई अलग-अलग शैक्षणिक क्षेत्रों में वस्तुओं के समूहों के भीतर काल्पनिक वंश संबंधों को दर्शाने के लिए किया जा सकता है। केवल आवश्यकता यह है कि वस्तुओं में ऐसी विशेषताएँ हों जिन्हें पहचाना और मापा जा सके। मनुष्य जाति विज्ञान और पुरातत्व क्लैडिस्टिक विधियों का उपयोग सांस्कृतिक लक्षणों या कलाकृतियों की विशेषताओं के समूहों का उपयोग करके संस्कृतियों या कलाकृतियों के विकास के पुनर्निर्माण के लिए किया गया है।

तुलनात्मक पैतृक कथाओं और लोककथाओं में कई मिथकों के विरोध को पुनः से बनाने के लिए क्लैडिस्टिक विधियों का उपयोग किया जाता है। मायथीम्स के साथ निर्मित पैतृक वंशावली स्पष्ट रूप से कम क्षैतिज संचरण (उधार), ऐतिहासिक (कभी-कभी पुरापाषाण) प्रसार और विराम चिह्न वाले विकास का समर्थन करती है। वे लोककथाओं के बीच सांस्कृतिक संबंधों के विषय में परिकल्पनाओं का परीक्षण करने का एक प्रभावशाली हैं।

कैंटरबरी टेल्स की जीवित पांडुलिपियों और संस्कृत चरक संहिता की पांडुलिपियों के वर्गीकरण में साहित्यिक क्लैडिस्टिक विधियों का उपयोग किया गया है।

ऐतिहासिक भाषाविज्ञान: भाषाई विशेषताओं का उपयोग करके भाषाओं के जातिवृत्त के पुनर्निर्माण के लिए क्लैडिस्टिक विधियों का उपयोग किया गया है। यह ऐतिहासिक भाषाविज्ञान की पारंपरिक तुलनात्मक पद्धति (भाषाविज्ञान) के समान है, लेकिन ओकार्य के रेजर के उपयोग में अधिक स्पष्ट है और बड़े आँकड़ा समूह (कम्प्यूटेशनल जातिवृत्तीय) के साथ बहुत तीव्रता से विश्लेषण की स्वीकृति देता है।

शाब्दिक समीक्षा या स्टेममैटिक: एपोमॉर्फी के रूप में विशिष्ट प्रतिलिपि त्रुटियों का उपयोग करके एक ही कार्य की पांडुलिपियों के जातिवृत्त (और खोए हुए मूल को फिर से बनाना) के पुनर्निर्माण के लिए क्लैडिस्टिक विधियों का उपयोग किया गया है। यह पारंपरिक ऐतिहासिक-तुलनात्मक भाषाविज्ञान से भिन्न है, जो संपादक को पांडुलिपियों के बड़े समूहों का मूल्यांकन करने और अनुवांशिक संबंधों में स्थान देने में सक्षम बनाता है, जिसमें बड़ी संख्या में घटक होते हैं जिन्हें मैन्युअल रूप से संभालना असंभव होता है। यह संचरण की दूषित परंपराओं के पारसीमोनी विश्लेषण को भी सक्षम बनाता है जिसका उपयुक्त समय में मैन्युअल रूप से मूल्यांकन करना असंभव होता है।

खगोल भौतिकी आकाशगंगा विविधीकरण की शाखात्मक आरेख परिकल्पना बनाने के लिए आकाशगंगाओं के बीच संबंधों के इतिहास का अनुमान लगती है।

यह भी देखें

 * जैव सूचना विज्ञान
 * जैव गणित
 * संपार्श्विक सिद्धांत
 * सामान्य वंश
 * वैज्ञानिक नामकरण की शब्दावली
 * भाषा समूह
 * पेट्रोक्लाडोग्राम
 * वंशावली नेटवर्क
 * वैज्ञानिक वर्गीकरण
 * स्ट्रैटोक्लाडिस्टिक
 * उपवर्ग
 * वर्गीकरण पद्धति
 * तीन-टैक्सोन विश्लेषण
 * वृक्ष मॉडल
 * वृक्ष संरचना

ग्रन्थसूची

 * Available free online at Gallica (No direct URL). This is the paper credited by for the first use of the term 'clade'.
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 * Translated from manuscript in German eventually published in 1982 (Phylogenetische Systematik, Verlag Paul Parey, Berlin).
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 * d'Huy, Julien (2013c) "Les mythes évolueraient par ponctuations". Mythologie française, 252, 2013c: 8-12.
 * d'Huy, Julien (2013d) "A Cosmic Hunt in the Berber sky : a phylogenetic reconstruction of Palaeolithic mythology". Les Cahiers de l'AARS, 15, 2013d: 93-106.
 * Reissued 1997 in paperback. Includes a reprint of Mayr's 1974 anti-cladistics paper at pp. 433–476, "Cladistic analysis or cladistic classification." This is the paper to which is a response.
 * Tehrani, Jamshid J., 2013, "The Phylogeny of Little Red Riding Hood", PLOS ONE, 13 November.
 * d'Huy, Julien (2012b), "Le motif de Pygmalion : origine afrasienne et diffusion en Afrique". Sahara, 23: 49-59.
 * d'Huy, Julien (2013a), "Polyphemus (Aa. Th. 1137)." "A phylogenetic reconstruction of a prehistoric tale". Nouvelle Mythologie Comparée / New Comparative Mythology 1,
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 * Tehrani, Jamshid J., 2013, "The Phylogeny of Little Red Riding Hood", PLOS ONE, 13 November.
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 * Tehrani, Jamshid J., 2013, "The Phylogeny of Little Red Riding Hood", PLOS ONE, 13 November.
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 * Tehrani, Jamshid J., 2013, "The Phylogeny of Little Red Riding Hood", PLOS ONE, 13 November.

बाहरी संबंध

 * OneZoom: Tree of Life – all living species as intuitive and zoomable fractal explorer (responsive design)
 * Willi Hennig Society
 * Cladistics (scholarly journal of the Willi Hennig Society)
 * Cladistics (scholarly journal of the Willi Hennig Society)